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Caractérisation biochimique et applications potentielles des glucosidases et de la a-galactosidase du suc digestif de la larve de rhynchophorus palmarum (curculionidae)

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par Assoi Yapi Désiré Patrice YAPI
Université ABOBO-ADJAMà‰ Abidjan - Doctorat 2008
  

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Conclusion

La larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) possède dans son suc digestif une á-glucosidase acide mésophile qui a été purifiée à homogénéité électrophorétique. Cette enzyme semble être différente des á-glucosidases des autres sources enzymatiques jusque là rapportées par les travaux des différents auteurs lorsqu'on tient compte de la spécificité de substrat, des constantes de Michaelis et Menten et des activités transglucosidasiques élevées. Cette enzyme est une saccharase. Son rôle biologique principal dans le suc digestif de la larve est d'hydrolyser le saccharose. Cependant, elle dégrade efficacement le maltose et les maltodextrines. Cette enzyme pourrait être utilisée comme outil de choix dans l'analyse structurale des chaînes d'oligosaccharides, de polysaccharides, de glycoprotéines et de glycolipides. Elle peut aussi être utilisée pour la synthèse des glycoconjugués.

III- PURIFICATION ET CARACTERISATION PHYSICO-CHIMIQUE DE LA â-GLUCOSIDASE DU SUC DIGESTIF DE LA LARVE DE Rhynchophorus palmarum (Curculionidae)

1-Résultats

1-1-Stratégie de purification

La stratégie de purification utilisée pour isoler à homogénéité électrophorétique la âglucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) est identique à celle décrite précédemment.

1-1-1-Chromatographie échangeuse d'anion sur gel de DEAE-Sepharose CL 6B

Cette étape chromatographique a permis non seulement d'éliminer une bonne partie des pigments mais aussi de retenir une seule activité â-glucosidasique sur le gel DEAESepharose CL 6B. Cette activité a été éluée à la concentration de 0,2 M de KCl (Fig. 26). L'activité spécifique de cette enzyme a été de 4,53 UE/mg. Le rendement et le facteur de purification ont été respectivement de 60,00 % et 6,56 % (Tableau 15).

1-1-2-Fractionnement au sulfate d'ammonium

Cette étape a permis d'améliorer le facteur de purification passant de 6,57 à 10,14. Le rendement obtenu a été de 38,77 % (Tableau 15).

1-1-3-Chromatographie d'exclusion moléculaire sur gel de Sephacryl-100 HR

Cette étape chromatographique a permis non seulement d'obtenir un seul pic d'activité â-glucosidasique mais aussi d'éliminer le reste des pigments contenus, dans la solution enzymatique (Fig. 27). L'enzyme responsable de l'hydrolyse du p-nitrophenyl-â-D-glucoside a eu une activité spécifique de 9,37 UE/mg de protéine. Le facteur de purification et le rendement ont été respectivement de 13,58 et 16,2 % (Tableau 15).

1-1-4-Chromatographie d'interaction hydrophobe sur gel de Phényl-Sepharose CL-4B

Une seule â-glucosidase a été isolée (Fig. 28). Elle a été éluée par le thiosulfate de sodium 0,2 M préparé dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Son activité spécifique a été de 25,10 UE/mg. Le facteur de purification et le rendement ont été respectivement de 36,38 et 4,47 % (Tableau 15).

Activite relative (DO 410
nm)

KC1(M)

0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150

1,2

1

0,8

0,6

0,4

0,2

0

3,5

3

2,5

2

1,5

1

0,5

0

Nombre de fraction

DO 280 nm DO 410 nm KCl (M)

Figure 26 : Profil chromatographique d'échange d'anion de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) sur gel de D.E.A.ESepharose CL 6B.

La colonne (2,4 x 6,5 cm) a été équilibrée dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Le débit chromatographique a été de 14 ml/h. Les protéines retenues par le gel sont décrochées par un gradient en palier croissant de KCl préparé dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Des fractions de 4 ml ont été collectées.

0,6

0,5

0,4

0,3

0,2

0,1

0

Protein (D0280 mn)

2

1,8

Activite relative (D0410 mn)

1,6

1,4

1,2

1

0,8

0,6

0,4

0,2

0

0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170

Nombre de fraction

DO 410 nm DO 280 nm

Figure 27 : Profil chromatographique d'exclusion moléculaire de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) sur gel de Sephacryl100 HR.

La colonne (1,6 x 64) a été équilibrée dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Le débit chromatographique a été de 15 ml/h. Les protéines ont été éluées par le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Des fractions de 1 ml ont été collectées.

Thiosulfate de sodium (M)

Activite relative (DO 410 nm)
Protein (DO 660 nm)

2,5 2 1,5 1 0,5 0

 

0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0

 

0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75 80

Nombre de fraction

 

DO 660 nm DO 410nm thiosulfate de sodium (M))

Figure 28 : Profil chromatographique d'interaction hydrophobe de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) sur gel de PhénylSepharose CL-4B

La colonne (1,4 x 5 cm) a été équilibrée dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6 contenant du thiosulfate de sodium 1,7 mM. Le débit chromatographique a été de 14 ml/h. les protéines retenues par le gel ont été décrochées par un gradient en palier décroissant de thiosulfate de sodium préparé dans le tampon acétate 100 mM pH 5,6. Des fractions de 1 ml ont été collectées.

Tableau 15 : Bilan global de purification de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae)

Etape de purification

Activité totale (U.E.)

Protéine (mg)

Activité spécifique (U.E/mg)

Facteur de purification

Rendement (%)

Extrait brut enzymatique

39,30

57,36

0,69

1

100

D.E.A.E Sepharose CL-

22,40

4,15

4,53

6,56

60,00

6B

 
 
 
 
 

Précipitation au sulfate

d'ammonium (80% de

saturation)

15,24

0,75

7,00

10,14

38,77

Sephacryl S-100 HR

6,37

0,68

9,37

13,58

16,21

Phényl-Sepharose CL-4B

1,75

0,07

25,10

36,38

4,47

UE= 1 micromole de p-nitrophénolate par min

1-2-Critère de pureté

L'électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de SDS et de â-mercaptoéthanol a permis d'observer une seule bande protéique, traduisant une pureté satisfaisante de la â-glucosidase du suc digestif de la larve Rhynchophorus palmarum (Curculionidae)

(Fig. 29).

1-3-Masses moléculaires de la â-glucosidase

Les masses moléculaires de la â-glucosidase déterminées en gel de filtration sur la colonne TSK et en électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence de SDS et de âmercapto-éthanol ont été respectivement de 60 et de 58 kDa. Cette similarité de masse moléculaire montre que l'enzyme est monomérique (Tableau 16).

116,25 kDa

66,2 kDa

200 kDa

97,4 kDa

45 kDa

2 1

Figure 29 : â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) purifiée par électrophorèse palmarum.

Ligne 2, protéines de référence. ligne 1, beta-glucosidase.

Tableau 16 : Masses moléculaires de la â-glucosidase du suc digestif de la larve du Rhynchophorus palmarum (Curculionidae)

Masses Nombre de

Méthode de détermination de la masse moléculaire moléculaire sous-unité

(kDa)

Gel de filtration sur la colonne TSK 60 1

Electrophorèse sur gel de polyacrylamide en

présence de SDS et de â-mercaptoéthanol 58

1-4-Influence du pH sur la â-glucosidase 1-4-1-pH optimum d'hydrolyse

La â-glucosidase a présenté son activité maximale dans le tampon acétate 100 mM pH 5,0 (Tableau 17). Elle a conservé plus de 70 % de son activité hydrolytique dans un domaine de pH allant de 4,6 à 6,0. Aux pH compris entre 6,6 et 8,0, l'enzyme a présenté une faible activité ne dépassant pas 40 % (Fig. 30).

1-4-2-Stabilité au pH

La â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) a été stable pendant 2 h dans le tampon acétate 100 mM aux pH compris entre 5,0 et 6,0 (Fig. 31).

1-4-3- Influence de la force ionique du tampon

La force ionique n'a exercé aucune influence sur les valeurs des pH optima d'hydrolyse de la â-glucosidase purifiée du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae) (Tableau 17).

Activite relative (%)

100

40

20

60

80

0

100

Activite relative (%)

40

20

60

80

0

3 4 5 6 7 8 9

pH

Tampon acétate 100 mM (pH 3,6 - 5,6) Tampon phosphate 100 mM (pH 5,6 - 8,0)

Figure 30 : pH optimum d'hydrolyse de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae).

Le pH optimum d'hydrolyse du p-nitrophényl-â-D-glucoside a été déterminé dans les tampons acétate 100 mM (pH 3,6 à 5,6) et phosphate 100 mM (pH 5,6 à 8,0). L'activité enzymatique a été déterminée dans les conditions standard.

3 4 5 pH6 7 8

Tampon acétate Tampon phosphate

Figure 31 : Stabilité au pH de la â-glucosidase du suc digestif de la larve de Rhynchophorus palmarum (Curculionidae)

L'enzyme a été pré-incubée pendant 2 h à 37 °C dans les tampons acétate et phosphate 100 mM pour des valeurs de pH comprises entre 3,6 et 8,0. L'activité enzymatique a été déterminée dans les conditions standard.

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"La première panacée d'une nation mal gouvernée est l'inflation monétaire, la seconde, c'est la guerre. Tous deux apportent une prospérité temporaire, tous deux apportent une ruine permanente. Mais tous deux sont le refuge des opportunistes politiques et économiques"   Hemingway