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UNIVERSITE CHEIKH ANTA DIOP DE DAKAR
FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES Département de
Biologie Animale
Année 2016 Numéro 295
Etude de la dynamique des populations d'Anopheles
et de la transmission du paludisme dans le district sanitaire de Nioro
(Kaolack, Sénégal) après la campagne d'aspersion
intra-domiciliaire d'insecticide de 2015
Mémoire de Diplôme de Master II en
Biologie Animale
Spécialité :
ENTOMOLOGIE
Présenté et soutenu le 04 Juin
2016
Par
Mr Assane Yade Ndiaye
Né le 05
Juillet 1989 à Pikine
Membres du Jury :
Président : Pr Ousmane FAYE
LEVP/FST/UCAD
Membres : Dr Mamadou Demba Sy LEVP/FST/UCAD
Dr Libasse Gadiaga PNLP/MSAS
Dr Abdoulaye Diop Abt Associates
Superviseur : Dr Lassana Konaté
LEVP/FST/UCAD
I
AVANT-PROPOS
Au nom d'ALLAH, le Clément, le Miséricordieux
Paix et salut sur le maître des messagers, le bien
aimé du concepteur de la créature toute entière, ainsi que
sur sa famille, ses compagnons et ceux qui les ont suivis dans la perfection
jusqu'au jour des comptes.
Ce travail a été réalisé au
Laboratoire d'Ecologie Vectorielle et Parasitaire (LEVP) de l'UCAD, en
collaboration avec l'Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et
Tropicales Emergentes (URMITE) de l'IRD de Dakar.
Qu'il me soit permis de remercier :
Le Professeur Ousmane Faye, pour m'avoir accueilli dans son
laboratoire et proposer ce sujet très intéressant,
répondant à un besoin d'informer et de guider le choix des
mesures de lutte. Vous n'avez ménagé aucun effort quant à
la réussite de nos activités. Vous nous avez mis dans
d'excellentes conditions de travail. Votre humilité, simplicité
et vos qualités
scientifiques font de vous un modèle à suivre.
Recevez ici, l'expression de ma profonde gratitude.
Le Docteur Lassana Konaté, malgré votre emploi
du temps chargé, vous nous avez fait profiter de votre expérience
en nous orientant en vue d'améliorer le document. Soyez assuré de
notre profonde reconnaissance.
Le Docteur El hadji Amadou Niang, malgré vos
occupations, vous avez accepté d'encadrer ce travail. Vous vous
êtes approprié le document et avez participé à sa
conception et à sa finalisation. Vos nombreuses interventions et vos
conseils ont été d'un grand apport. Votre simplicité et
vos qualités scientifiques nous ont séduites. Je ne saurai vous
remercier assez. Puisse ALLAH vous guider et fasse que vous réalisez
tous vos projets.
Les membres du jury, pour avoir accepté de juger de ce
travail.
A toute l'équipe du LEVP : père Alioune Gueye,
père Moussa Diagne, Ndèye Diango Faye, Seynabou M. Diedhiou,
Elhadji Diouf, Mbaye Diouf, Manthia Diallo, Malick Ndao Faye, Pape Thiam,
Babacar Ndiouck, Cheikh Lo. Mention spéciale à Youssou Coulibaly,
père Oumar Niang, Dr Massyla W. Senghor « mon Boss
préféré », pour avoir initié mes premiers
II
pas sur les techniques d'échantillonnage sur le terrain
; Abdoulaye KONATE, un frère sur qui on peut toujours compter, de
m'avoir initié aux techniques des tests de sensibilité ; Omar
Thiaw « mon ami » et Abdoulaye Kane Dia, pour avoir contribuer aux
corrections et à l'amélioration du manuscrit ; El hadji Diouf
qui, malgré ses travaux de thèse et ses occupations, nous a
initié aux techniques de biologie moléculaire et a
contribué grandement aux corrections du document, je ne peux que prier
pour vous.
A mes collègues, Oumou Kalsom Guèye, Amblat Ali
Ahmed et Papa Makhary Fall, pour l'entente, la bonne humeur et l'ambiance
décontractée qui a régné entre nous tout au long de
ce stage.
DéDICACES
Je dédie ce travail : A mes parents :
Mon père Moussa Ndiaye, vous constituez un
modèle pour nous (mes frères, soeurs et moi). Trouver ici le
résultat de longues années de sacrifices et de privations pour
m'aider à avancer dans la vie. Merci pour les valeurs nobles,
l'éducation et le soutien permanent. Puisse Dieu vous prêter
longue vie et une santé de fer pour que vous continuez à nous
accompagner.
Ma mère Oumou Khaïry Diop, ma confidente, mon
amie, mon essentielle. Vous avez beaucoup oeuvré pour notre
réussite de par votre amour, votre soutien, vos sacrifices consentis,
vos précieux conseils et toute l'assistance que vous nous portez.
Recevez à travers ce travail aussi modeste soit-il, l'expression de mes
sentiments et de mon éternelle gratitude.
A mes frères : Youssou « mon jumeau cactus »,
Babacar, Abdou et Khadim et soeurs : Thiané et Fatou, qui n'ont
cessé d'être pour moi des exemples de persévérance,
de courage et de générosité.
A Mawlana Cheikh al islam El hadji Ibrahim Niasse « Baye
» qui a consacré toute son existence à la crainte d'ALLAH et
à la vivification de la Sunna du Prophète (PSL) ainsi que la
Tariqa Tidiane. Que l'agrément d'ALLAH soit sur vous, le
prédicateur vers lui par son ordre.
A mon oncle et ami Moussa Diop ainsi que toute la famille Diop
à St-louis, la famille Ndiaye à Khombole, pour l'affection, les
prières et le soutien constant qu'ils me vouent.
III
A mon homonyme Assane Yade, ses amis père Alpha Ba,
père Ndiaga Dramé ainsi qu'à toute la famille Yade de
Thiaroye, pour leur soutien et leur assistance.
A la famille Marone de Dieupeul, trouver ici l'expression de
mon respect et de ma reconnaissance pour le soutien que vous n'avez jamais
cessé de me porter.
A ma moitié Ndeye Fatou Diallo, merci pour tout ce que
tu fais pour moi et l'importance que tu accordes à ma modeste personne.
Trouve dans ce travail, l'expression de ma profonde gratitude.
A Ndoumbé Mbaye, je ne saurai trouver les mots justes
pour dire à quel point tu es indispensable pour moi. Tes conseils, ton
soutien inlassable et ton assistance sont une source de motivation et me pousse
sans cesse à donner le meilleur de moi-même. Ce travail est
également le vôtre.
A mes amis : Mame Birame Fall, Ibrahima Ndao, Jean
Sédar diaga Marone, Ousmane Kouta, Nicolas Mbaye, Cheikh Tidiane
Dramé, Bidji Ndiaye, Moussa Ndao, Omar Diouf
A la sixième promotion du master en Biologie animale
particulièrement à la famille Entomologie.
A tous ceux qui, de près ou de loin, ont
participé à ce modeste travail, soyez assuré de ma
profonde affection.
III
LISTE DES ABRévIATIONS
ADN: Acide
désoxyribonucléique
An : Anopheles
CTAB: Cétyltriméthylammonium
bromure
DDT :
Dichlorodiphényltrichloroéthane
ELISA: Enzyme linked-immunosorbent Assay
GPS: Global Positioning System
IgG: Immuno-globuline G
IRD: Institut de Recherche pour le
Développement
MILDA : Moustiquaire Imprégnée
d'Insecticide à Longue durée d'Action
OMS : Organisation Mondiale de la
Santé
PCR: Polymerase Chain Reaction
PHN: Piqûre/homme/nuit
PID/AID: Pulvérisation/Aspersion
Intra-Domiciliaire
PNLP : Programme Nationale de Lutte contre le
Paludisme
RBM: Roll Back Malaria
TBE: Tris-Borate-EDTA
UCAD: Université Cheikh Anta Diop de
Dakar
UV: Ultra-violets
WHO: World Health Organization
iv
Liste des tableaux
Tableau 1 : Abondance des espèces anophèliennes
selon la méthode de collecte dans les
différentes zones 21
Tableau 2 : Agressivité des
populations d'An. funestus et d'An. gambiae s.l. à
l'intérieur et à
l'extérieur dans les zones traitées et
témoins 22
Tableau 3 : Variations de la densité au repos selon le
statut de la zone 23
Tableau 4 : Taux de parturité selon les zones 26
Tableau 5 : Sensibilité d'An. gambiae s.l. aux
Carbamates et aux Organophosphorés dans le
district de Nioro 27
Liste des figures
Figure 1: Cycle biologique d'une femelle d'Anopheles
(Source : Hervy et al, 1998) 3
Figure 2: Morphologie d'une femelle d'An. gambiae s.l.
x400 (Source : Amougou zibi, 2010) 5 Figure 3 : Les principales interventions
de lutte anti-vectorielle : MILDA (a) et AID (b)
(Sources: a- who.int; b- Sy, 2015) 9
Figure 4 : Carte du département de Nioro du Rip avec les
différents sites d'études 10
Figure 5 : Etapes de réalisation d'une faune matinale
résiduelle et traitement des échantillons
12
Figure 6 : Prospection des gîtes larvaires et collecte des
larves 13
Figure 7 : Cages d'émergence des adultes 14
Figure 8 : Kit OMS 15
Figure 9 : Recherche de femelles infectantes 16
Figure 10 : Détermination de l'origine des repas de sang
17
Figure 11 : Interprétation des bandes pour
l'identification du complexe Gambiae 18
Figure 12 : Taux d'endophagie (en %) en fonction du statut des
villages 23
Figure 13 : Spectres d'hôtes des populations d'An.
gambiae s.l. et d'An. funestus en fonction
du statut de traitement des zones d'étude 25
v
Table des matières
Introduction générale 1
Chapitre I : Synthèse bibliographique
3
I.1 : Généralités sur les
moustiques vecteurs du paludisme 3
I.2 : Ecologie des vecteurs 5
I.3 : Distribution des vecteurs au
Sénégal 6
I.4 : Mesures de lutte contre les vecteurs
7
Chapitre II : Matériel et méthodes
9
II.1 : Présentation du site d'étude
9
II.2 : Méthodes d'échantillonnage de la
population anophélienne 11
II.3 : Etude de la sensibilité des populations
d'An. gambiae s.l. aux insecticides 13
II.4 : Traitement des moustiques au laboratoire
16
II.5 : Analyses des données 18
Chapitre III : Résultats et discussions
20
III.1 : Résultats globaux 20
III.2 : Variations des densités
anophèliennes 22
III.2.1 : Variations de la densité agressive et
du taux d'endophagie 22
III.2.2 : Variations de la densité au repos
23
III.3 : Préférences trophiques
23
III.4 : Taux de parturité 26
III.5 : Indice Circumsporozoïtique : ICS
26
III.6 : Sensibilité des populations d'An.
gambiae s.l. aux insecticides 26
III.7 : Discussion 28
Conclusions et perspectives 29
Références bibliographiques
30
ANNEXES b
Introduction générale
Le paludisme humain est une maladie infectieuse à
transmission vectorielle faisant intervenir trois protagonistes : (i)
l'hôte humain qui est infecté par (ii) un protozoaire parasite du
genre Plasmodium transmis par (iii) un moustique vecteur du genre
Anopheles (Moiroux, 2012). Malgré plus d'un siècle
d'étude, il demeure l'une des maladies parasitaires les plus
répandues à travers le monde. L'aire de distribution actuelle du
paludisme est superposable à celle des pays pauvres. Toutefois, il faut
souligner que ce n'est pas une maladie des pays pauvres mais plutôt un
facteur de pauvreté des pays qui en souffrent à grande
échelle. Les enfants âgés de 0 à 5 ans et les femmes
enceintes constituent les couches les plus vulnérables. En 2010, environ
219 millions de cas de paludisme ont été
répertoriés dans 99 pays et territoires à travers le
monde. Au cours de la même année, on estimait à 660 000 le
nombre de décès dus au paludisme dont 91% survenus dans la
région africaine de l'OMS, et parmi lesquels 86% étaient des
enfants de moins de 5 ans (WHO, 2013).
Selon les dernières estimations de l'OMS, en 2015, 214
millions de cas de paludisme ont causé 438 000 décès, soit
une diminution de la mortalité de 37% à l'échelle mondiale
par rapport à 2000 et de 66% dans la région africaine de l'OMS.
Cette diminution est en partie liée à une augmentation des
interventions de lutte anti-vectorielle. Cette dernière est basée
essentiellement sur l'utilisation des moustiquaires et autres matériaux
imprégnés d'insecticides et la pulvérisation/aspersion
intra-domiciliaire à effet rémanent (PID/AID) (WHO, 2006). En
effet, sur recommandations de l'OMS, 290 millions de moustiquaires
imprégnées ont été délivrées en
Afrique sub-saharienne entre 2008 et 2010, permettant de protéger 580
millions de personnes du paludisme. Et 80 millions de personnes affirment vivre
sous un toit aspergé d'insecticides (IRD, 2012). Les avancées
significatives notées, au cours des 15 dernières années,
ont été couronnées par l'atteinte de la cible 6c des
Objectifs du Millénaire pour le Développement (OMD) qui
était de réduire de 75% l'incidence du paludisme en 2015.
Dans ce contexte, l'OMS a élaboré un nouveau
Plan Stratégique Mondiale de Lutte contre le Paludisme 2016-2030, dont
l'objectif est de réduire la charge palustre à l'échelle
mondiale d'au moins 90% d'ici à 2030 (WHO, 2015).
1
Au Sénégal, à l'instar d'autres pays
d'Afrique, une baisse notable de l'incidence du paludisme, passant de 27 cas
pour 1000 habitants en 2013 à 18,9 cas pour 1000 habitants en 2014, a
été observée. Ce qui s'est traduit par une diminution de
la mortalité de 7,48 % à 3,59 % entre 2013 et 2014. Cette
avancée majeur dans le pays a été obtenue grâce
notamment
à la mise en oeuvre d'une série d'interventions
à efficacité prouvée et recommandées par l'OMS tels
que la prise en charge des cas, la chimio-prévention du paludisme
saisonnier, le traitement préventif intermittent, la couverture
universelle en MILDA et les aspersions intra-domiciliaires, et une meilleure
compréhension de la maladie par les populations (PNLP, 2014). Elle
réaffirme l'ambition du Sénégal à aller vers la
pré-élimination et la réduction de la mortalité
palustre à un niveau proche de zéro. Mais, pour ce faire, la
lutte antipaludique en générale et celle anti-vectorielle en
particulier, doit être plus ciblée en tenant compte des
particularités éco-épidémiologiques de chaque zone.
Cela suppose une meilleure caractérisation des populations vectorielles
pour la mise en place de programmes de lutte intégrée
adéquats et permettre la prise de décisions
éclairées basées sur les données
bioécologiques des vecteurs, incluant la dynamique de leur population
ainsi que leur sensibilité aux insecticides d'usage en santé
publique.
C'est dans ce cadre que ce travail a été
réalisé afin d'étudier la dynamique des populations
d'Anopheles et la transmission du paludisme dans le district de Nioro
(Kaolack, Sénégal) après la campagne d'AID de 2015.
Il a pour objectifs spécifiques :
? D'estimer l'abondance des populations de vecteurs ainsi que
leur agressivité
? De déterminer le comportement de repos des
espèces vectrices
? D'évaluer l'anthropophilie et l'infection à
Plasmodium falciparum des vecteurs
? De déterminer le statut de sensibilité des
vecteurs vis-à-vis de deux familles
d'insecticides à savoir les Carbamates et les
Organophosphorés
2
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