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20 novembre 2014
Institut de la Francophonie pour l'Informatique
Mémoire de fin d'études pour l'obtention du
diplôme de Master II Informatique
Option : Réseaux et Systèmes Communicants
Développement d'un portail web pour le
criblage
virtuel sur la grille de calcul
Promotion 17-RSC
Rédigépar :
Louacheni Farida
Sous l'encadrement de :
Dr.Nguyen Hong Quang
Dr.Doan
Trung Tung
Dr.Bui The Quang
Remerciements
Ce travail de stage de fin d'études a
étéeffectuéau sein du Laboratoire MSI à l'Institut
de la Francophonie pour l'Informatique, sous la direction du Docteur
Nguyen Hong Quang, auquel je tiens à exprimer ma
profonde gratitude, et ma vive reconnaissance pour m'avoir confiéce
sujet.
J'adresse mes plus vifs remerciements au Dr.Doan Tung
Tung et Dr.Quang Bui The de m'avoir encadréet
prodiguémaints conseils. Je suis très reconnaissante à
tous les enseignants de l'IFI pour la qualitéde
l'enseignement qu'ils nous ont offerts.
Ma reconnaissance infinie à mes très chers
parents qui m'ont enseignéla persévérance dans mes
études, qui m'ont toujours étéd'un grand secours par leur
soutient et leur encouragement, ainsi mes adorables soeurs et mon très
cher frère et mon ami Yacine-Malek.
Enfin, un immense merci à mes amis qui m'ont toujours
soutenue.
Résumé
À l'heure actuelle, la grille de calcul est en train de
devenir une force motrice majeure pour de nouvelles approches pour la
collaboration de science à grande échelle. Plusieurs programmes
nationaux et internationaux eScience ont favoriséla collaboration entre
chercheurs de différents domaines scientifiques.
Dans le domaine biomédicale, plus précisement
dans la recherche de nouveaux médicaments pour les maladies
infectieuses. La grille de calcul a initiéplusieurs projets à
grande échelle dans les approches de criblage de médicaments
in-silico. Le projet WISDOM a étéparmi les
premiers projets dans le domaine public qui a fait usage de la grille tout en
permettant le docking in-silico pour simuler l'in-teraction de
médicaments potentiels avec des protéines cibles. Le docking
in-silico est la première étape dans le processus de
criblage virtuel, il est considérécomme l'une des approches les
plus prometteuses afin accélérer et de réduire les
coûts de développement de nouveaux médicaments pour les
maladies négligées.
Bien que, de nombreuses applications ont
étédéveloppées pour permettre le criblage virtuel
dont le but d'accélérer le processus de recherche des
médicaments. Une barrière critique de ces programmes est leur
complexitéen terme d'utilisation et de prévoir des
procédures concises pour les utilisateurs réguliers.
L'objectif de ce travail est de développer un portail
web conviviale pour effectuer le criblage virtuel, et de déployer un
très grand nombre de docking sur la grille de calcul. Pour atteindre ce
but, la grille de calcul a étéutilisépour
accélérer la recherche et la découverte de nouveaux
médicaments in-silico et traitements pour les maladies
infectieuses.
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