3.4.2. Dégradation des produits azotés
Les principales formes initiales de l'azote organique sont les
protéines des végétaux et des microorganismes. Viennent
ensuite les amino-polysaccharides constituants de la membrane des champignons
ou de la paroi des bactéries, des pigments (chlorophylle), les acides
nucléiques. La dégradation des composés azotés, des
protéines essentiellement, comporte trois processus successifs : la
protéolyse aboutissant à la libération des acides
aminés constitutifs, l'ammonification aboutissant à la
libération d'azote sous la forme ammoniacale et la nitrification.
3.4.2.1. Protéolyse
En milieu biologique favorable (pH, aération, ...), les
enzymes microbiennes sont capables de rompre des liaisons peptidiques et de
libérer les polypeptides. Ceux-ci sont à leurs tours soit
simplifiés en acides aminés assimilés par les
microorganismes (désaminés) ou ammonification, ou forment de
polycomplexes polyphénols- protéines avec des produits de la
dégradation de la lignine. Très lentement, ces complexes sont
à leur tour dégradés. La microflore de la
protéolyse est très variée et peu spécifique.
3.4.1.2. L'ammonification
L'ammonification est le processus de transformation de l'azote de
la matière organique en azote ammoniacal.
Les acides aminés libérés lors de la
protéolyse totale subissent une désamination selon plusieurs
voies possibles : hydrolyse avec ou sans décarbonatation,
réduction ou oxydation avec décarbonatation. Selon les processus,
un alcool ou un acide gras apparaît accompagné d'une
libération de CO2 et de NH4 + ou non ionisé (NH3) (Stevenson et
Wiley, 1982). La microflore ammonifiante comporte de très nombreuses
espèces de bactéries, d'actinomycètes et de champignons.
Du fait de cette diversité, elle présente peu d'exigences
écologiques.
3.4.2.3. La réorganisation
Une partie de l'ammonium libéré est
aussitôt réutilisée par d'autres microorganismes disposant
d'énergie et de substrat carbonés nécessaires à
l'élaboration de leur protoplasme. L'ammonification brute correspond
à la quantité d'ammonium réellement dégagée.
La présence de composés carbonés
énergétiques favorise la réorganisation. L'organisation de
l'azote est d'autant plus importante que le composé organique contient
moins d'azote mais elle se produit même pour des composés à
faible rapport C/N (Handayanto et al., 1997). Le rapport C/N est
utilisé pour caractériser la biodégradabilité d'un
composé organique.
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