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Diversités phénotypique et moléculaire des microsymbiotes du Sulla du nord (Hédysarum Coronarium L. ) et sélection de souches rhizobiales efficientes

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par Sana Dhane Fitouri
Institut national agronomique de Tunisie - Doctorat en sciences agronomiques 2011
  

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3. 5. Effet des bactéries amélioratrices de la croissance des plantes

Parmi les microorganismes du sol, certains à effet PGPB (plant growth promoting bacteria) ont la particularité d'améliorer la croissance des plantes directement ou indirectement (Khan et al., 2009).

La stimulation directe consiste à fournir des éléments nutritifs pour la plante. Parmi ces éléments, figurent : (i) l'azote à travers l'activité des nitrate réductase; (ii) les phytohormones (tels que l'acide indole acétique, la zéatine, l'acide gibbérellique et acide abscissique); (iii) le fer séquestré par les sidérophores bactériens; (iv) le phosphore à travers la solubilisation d'acides organiques (Zaidi et al., 2009).

L'action indirecte inclue : (i) la prévention des phytopathogènes; (ii) l'allélopathie; (iii) la production d'antibiotiques; (iv) la compétition avec les agents délétères (Egamberdiyeva et Islam 2008).

L'inoculation avec des PGPB autre que les rhizobiums peut améliorer la nodulation par infection avec les rhizobiums à travers la modification de l'architecture des racines ou encore la suppression de la biosynthèse de l'éthylène au niveau racinaire. Cet élément qui est directement responsable de la suppression de la formation nodulaire serait inhibé par la l'ACC (1-aminocyclopropane-1-carboxylate) deaminase libérée par certaines rhizobactéries.

Revue bibliographique

Dans ce sens, Shaharoona et al. (2006) ont rapporté que la coinoculation du haricot mungo (Vigna radiata L.) avec une PGPB associée à Bradyrhizobium améliorait la nodulation de cette fabacée de 48 % comparativement à celle inoculée avec Bradyrhizobium uniquement. Selon ces auteurs, cette amélioration est due à la diminution de la synthèse de l'éthylène sous l'action de l'ACC deaminase de la PGPB. Shahzad et al. (2008) ont aussi montré l'effet de l'activité de l'ACC deaminase de 3 souches rhizobactériennes sur l'amélioration de la nodulation d'une culture de pois chiche. Ces auteurs ont enregistré une amélioration de la nodulation de 87 % comparativement au témoin. Dans le même sens, Belimov et al. (2009) ont rapporté une amélioration de la croissance d'une culture de pois en condition de stress hydrique grâce à l'activité de l`ACC deaminase de la bactérie Variovorax paradoxus.

3. 6. Formes et qualité des inoculums

Les formes d'inoculums peuvent être poudreuse, granuleuse, ou encore liquide (Date, 2000; Deaker et al., 2004). La méthode la plus conventionnelle de l'inoculation est l'application directe sur les semences.

D'autres techniques proposent l'inoculation sur des granulés minéraux (Wadoux, 1991), ou encore sur le lit de semence (Hynes et al., 1995). Durant cette dernière décennie, le développement technologique a évolué dans le sens de l'utilisation, comme support pour les rhizobiums, de sous produits à la fois économiques et faciles à utiliser (Ben Rebah et al., 2007; Brockwell and Bottomley, 1995; Denton et al., 2009), (Tableau 3).

Techniques

Description

Tableau 3: Techniques d'inoculation des légumineuses (Brockwell, 1977; Thompson, 1988).

Inoculation des graines: Saupoudrage

Boue

Granulage de chaux ou de phosphate

Imprégnation sous vide Inoculation du sol:

Inoculum liquide Inoculation granulaire

La tourbe est mélangée avec les graines sans remouillage.

Les graines sont mélangées avec une solution aqueuse de tourbe souvent avec l'addition d'un adhésif

Les graines sont traitées avec un inoculum de tourbe et boue suivie d'un ajout de phosphate ou de carbonate de calcium.

La souche de Rhizobium est introduite dans ou sous le tégument des graines sous vide.

L'inoculum liquide est ajouté à la plante en stade jeune plantule
Des granules contenant l'inoculum sont semées avec les graines

Revue bibliographique

Les inoculums sont produits et commercialisés dans plusieurs pays. Leur qualité dépend du nombre, de l'efficience ainsi que de la stabilité génétique des souches rhizobiales contenues dans ces inoculums (Hiltbold et al., 1980; Brockwell et Bottomley, 1995; Stephens et Rask, 2000; Amarger, 2001), mais aussi de leur niveau de compétition avec les rhizobiums indigènes ainsi que leur persistance dans le sol (Graham and Vance, 2003). Cette qualité est très variable d'un pays à un autre. En effet, il existe sur le marché des pays où les contrôles de qualité ne sont pas pratiqués systématiquement, des inoculums de mauvaise qualité (Catroux et al., 2001). Alors qu'en général, les inoculums sous forme liquide ou sur support poudreux, produits en Amérique du Nord, Europe, Australasie et certains autres pays sont de bonne qualité.

Les inoculums de haute qualité peuvent fournir approximativement 104 à 1011 rhizobium/g de sol. Ce qui représente près de 1 % de la population indigène présente dans l'horizon 0-20 cm du sol (Catroux and Amarger, 1992).

La conservation des inoculums est aussi un critère important pour leur qualité. Boonkerd (1991) a montré que la conservation des inoculums à des températures supérieures à 10°C diminue considérablement leur longévité.

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"Je ne pense pas qu'un écrivain puisse avoir de profondes assises s'il n'a pas ressenti avec amertume les injustices de la société ou il vit"   Thomas Lanier dit Tennessie Williams