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Les éléments transposables: le cas du transposon mariner une approche expérimentale

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par R Ferhi
Université de Tebessa - DES en Biochimie et Biologie moléculaire 2009
  

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II.4.1. Recrutement de fonctions structurelles :

Le cas le plus étudié est l'intégrité des extrémités chromosomiques chez la drosophile. A l'inverse de la plupart des organismes, cette intégrité n'est pas assurée par la télomérase qui catalyse la synthèse des courtes répétitions terminales, elle est assurée par deux rétrotransposons de types non rétroviral (sans LTR), les LINEs TART (pour Telomerase Associated RetroTransposon) et Het-A, ils sont d'environ 7kpb, les TART codent pour leur propre transcriptase inverse (TI), ils sont donc autonomes tandis que les Het-A doivent être transposés en trans par une TI fournit par un TART ou d'autres rétrotransposons. Après chaque cycle de réplication, les extrémités chromosomiques sont érodées par une réplication incomplète, ensuite elles sont régénérées grâce à la rétrotransposition des TART et Het-A. De façon tout à fait remarquable, un équilibre dynamique s'est installé dans ce système où le taux moyen d'érosion est égal au taux moyen de transposition. Par ailleurs, structurellement le domaine transcriptase inverse de la télomérase présente des similarités avec les transcriptases inverses des rétrotransposons ce qui soulève la question de l'ancêtre commun : était-ce la RT d'un rétrotransposon ou celle d'une télomérase ? (Anxolabéhère et al., 2000 ; in Luchetta et al., 2005 ; Renault et al., 1997).

II.4.1. Recrutement de fonctions enzymatiques :

L'exemple le plus frappant d'un tel recrutement est probablement apporté par le système immunitaire des vertébrés. Ce système doit être capable de reconnaître des millions d'antigènes différents, cette diversité est générée au niveau des lymphocytes au cours de leur développement, suite à des remaniements de l'ADN au niveau des gènes codants les immunoglobulines et les récepteurs des cellules T, le processus conduisant à ces remaniements a été appelé Recombinaison V(D)J (In Luchetta et al., 2005 ; in Watson et al., 1994). Dans ce système, deux protéines RAG1 et RAG2, sont essentielles pour la recombinaison, elles possèdent en effet à la fois la propriété de reconnaître des séquences nucléotidiques spécifiques correspondant à des signaux de recombinaison

placés au voisinage des segments V, D et J, et celle de cliver de l'ADN immédiatement à proximité de ces signaux, ces derniers, composés d'héptamères et de nonamères très conservés et séparés les uns des autres par des séquences relativement homogènes de 12 ou 23 nucléotides, évoquent les répétitions terminales inversées de nombreux éléments transposables. Donc RAG1 et RAG2 se comportent exactement comme des transposases c'est-à-dire reconnaissance de sites de coupures et activité endonucléase. Par ailleurs le mécanisme de réparation de la coupure double brin de l'ADN après excision de fragments V(D) ou (D)J est similaire à celui observé pour la réparation chez les transposons Ac/Ds de Zea mays . L'ensemble de ces observations suggèrent que les gènes rag1 et rag2 dérivent d'un ancien élément transposable (l'élément Transib) de classe 2 possèdant des ITR semblables aux actuels signaux de recombinaison entre les séquences V, D et J. L'élément à l'origine de rag1 et rag2 serait devenu immobile par la perte de ses ITR (Figure 5.1) (Anxolabéhère et al., 2000 ; in Luchetta et al., 2005).

Figure 5.1 : Origine du système immunitaire des mammifères par coaptation de l`activité transposase d`un élément transposable : Les éléments transposables à l'origine de la recombinaison V(D)J devaient posséder des répétitions terminales inversées (RTI) comme ceux des transposons de type II, et deux gènes (rag1 et rag2) codant les deux propriétés essentielles d'une transposase : la reconnaissance des sites de coupures et l'activité endonucléasique. Selon le modèle, les recombinases RAG1 et RAG2 et les motifs répétés du système V(D)J dérivent de ces anciens éléments transposables (Anxolabéhère et al., 2000).

Élément transposable d'origine

Cluster des gènes immunoglobulines

V

RTI ITR

RTIa

RAG1

RAG1

ITRa

rag]

rag]

D RTIa ITRa J

rag2

rag2

RAG2

RAG2

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