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Polymorphisme des antigenes plaquettaires humains dans la population tunisienne

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par Mabrouka LASSOUED
Université de Tunis El Manar - Mastère de Génétique et Bio-ressourses 2007
  

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I. MATÉRIEL 

Notre étude a porté sur un échantillon de 111 donneurs de sang Tunisiens, pour le système HPA-1, 105 pour le système HPA-2, 104 pour le système HPA-3, 102 pour le système HPA-4 et de 100 donneurs de sang pour le système HPA-5. Les échantillons sanguins choisis au hasard sont constitués de donneurs de sang volontaires au (CNTS) de Tunis. Ces donneurs sont sans lien de parenté, ne souffrant d'aucune pathologie apparente. Ils sont des deux sexes, sont de différents âges et pourraient appartenir à de différentes générations (l'age d'une génération est de 25 ans).

II. MÉTHODES

Les polymorphismes des gènes des HPA-1, - 2, -3, -4 et -5 résultant d'un SNP au niveau d'un brin codant de l'ADN, ont été déterminés par la technique PCR-SSP.

II-1. Prélèvement du sang 

5 ml (1ml de sang renferme 30 à 50 ug d'ADN) dé sang périphérique ont été prélevés sur un anticoagulant EDTA, chez chaque sujet. Après déplasmatisation, le culot globulaire a servi pour extraire l'ADN génomique.

II-2. Extraction de L'ADN génomique total 

II-2.1. Principe : L'ADN utilisé comme matrice d'amplification pour les réactions PCR a été extrait par la technique du relargage des protéines à force ionique élevée : la technique de salting-Out (Technique au chlorure de calcium saturé) (Miller. S. A et al., 1988). Le sang doit être initialement et vigoureusement mélangé à une solution hypotonique pour faire éclater les globules rouges par une solution hypotonique (SLR : tris-HCl 10 Mm pH 7,5 ; MgCl2 5 Mm ; NaCl 10 Mm). Le lysat est centrifugé et, après élimination du surnageant, le culot cellulaire contenant les leucocytes est traité par une solution de lyse de GB (SLB) et une solution de protéinase très active, la protéinase K qui digère les protéines cellulaires. Ces dernières seront par la suite relarguées par l'intermédiaire d'une force ionique du NaCl (6 M). En fin, la précipitation de l'ADN génomique est effectuée en utilisant une solution d'éthanol absolu à froid (-20 °C) (Delpech. M et al., 1999; Raisonnier. A et al., 2002).

II-2. 2. Protocole expémental 

1- Lyse des globules rouges 

Après déplasmatisation de l'échantillon sanguin, on complète les crachoirs à 50 ml avec la (SLR) en les agitant avec le vortex afin de faciliter la lyse des globules rouges. On les centrifuge 10 mn à 2600 trs/mn à température ambiante. On élimine avec précaution, le surnageant. On répète l'opération précédente 2 fois. S'il y a des hématies qui persistent dans le culot, on effectue un lavage supplémentaire jusqu à avoir un culot de blanc blanchâtre dépourvu des globules rouges (sinon on met le culot au congélateur pendant au moins 2 h). On élimine totalement le surnageant de SLR.

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