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Recherche de nouvelles souches fongiques productrices d' antibiotiques à  partir du sol et des concrétions sédimentaires des grottes de AàŻn Fezza.

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par Wahiba Kholkhal
Université Abou Bekr Belkaid, Tlemcen Algérie - Magistère en biologie 2006
  

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4- Test d'antibiose :

4-1- Les souches de Penicillium :

Afin de réaliser le test d'antibiose des souches de Penicillium on a utilisé la méthode 1.

4-1-1- Criblage primaire :

Parmi 152 souches isolées, on a réalisé le criblage primaire sur seulement 80 souches.

Les résultats de ce criblage ont montrées que 38 souches présentent une activité contre une des trois bactéries-cible (Escherichia coli (1), Pseudomonas aeruginosa (2) et Staphylococcus aureus (3)). Le tableau 5 représente les résultats du criblage.

Tableau 5 : Criblage primaire des souches de Penicillium.

Bactéries -cible

Zone d'inhibition

Nombre de souches

Escherichia coli (1)

Groupe (1)

7

Groupe (2)

4

Groupe (3)

1

Pseudomonas aeruginosa (2)

Groupe (1)

6

Groupe (2)

14

Groupe (3)

2

Staphylococcus aureus (3)

Groupe (1)

2

Groupe (2)

3

Groupe (3)

0

*Les diamètres des zone d'inhibition sont englobés dans des groupes :groupe (1)de 6 mm à 10 mm ; groupe (2) de 10 mm à 14 mm ; le groupe (3) de 14 mm à 16 mm .

D'après le tableau, on a constaté que la plupart des souches de Penicillium testées ont exercées une activité inhibitrice entre 11 mm et 14 mm dont 14 souches uniquement dans le cas du bactérie-cible Pseudomonas aeruginosa.

Le nombre des souches du groupe (1) était moins important par rapport au groupe (2).

D'après ce même tableau, on a remarqué que certaines souches ont présenté une activité importante « le groupe (3) » dont la zone d'inhibition était entre 14 mm et 16 mm. Pour cette raison, on a essayé de présenter l'origine d'isolement de ces souches (Tableau 6).

Tableau 6 : Origine des souches du groupe (3).

Souche

Station

Point de prélèvement

Le type de substrat

Le mois de prélèvement

La zone d'inhibition et bactérie cible

31S2

Station 1

P

Sol

Décembre

15 mm Pseudomonas aeruginosa

27G1

Station 3

P2

Sol

Décembre

16mm Pseudomonas aeruginosa

6G1

Station 3

P2

Sol

Décembre

16mm Escherichia coli

D'après le tableau, on a remarqué que les souches du groupe (3) proviennent tous des prélèvements du sol du mois de Décembre, et dont l'origine du prélèvement était différent : la souche 31S2 provient du station 1 et les deux autres souches 27G1 et 12 G1 proviennent du point de prélèvement P2 de la station 3.

4-1-2- Criblage secondaire :

Nous avons retenu pour ce test 14 souches de Penicillium révélant une activité antibactérienne plus ou moins important par rapport aux autres souches testées dans le premier criblage.

Les résultats du deuxième criblage ont montré que seules 7 souches ont présenté une activité antibactérienne contre aux moins une bactérie-cible.

Les résultats du premier et du deuxième criblage de ces souches sont illustrés dans le tableau 7.

Tableau 7 : Criblage secondaire des souches de Penicillium

Souche

Criblage primaire

Criblage secondaire

1

2

3

1'

2

3

4

5

6

7

8

9

18S1

8

/

/

-

-

8

-

-

-

-

-

-

29S2

/

14

/

-

-

-

-

-

-

8

15

20

14G1

/

/

11

-

9

8

-

-

-

-

11

18

27G1

/

16

/

-

-

-

-

-

-

-

14

16

32G1

/

13

/

-

-

11

-

-

-

-

11

-

34G1

/

14

/

9

-

8

7

7

-

-

10

8

40G1

/

10

/

-

-

-

-

-

-

-

8

14

* Les bactéries-cibles sont représentées par des numérotations :

1 : Escherichia coli ; 2 : Pseudomonas aeruginosa ; 3 : Staphylococcus aureus ; 1' : Escherichia coli ; 4 : Citrobacter freundï ; 5: Enterobacter cloacea ; 6 : Klebsiella pneumoneae ; 7 : Listeria monocytogenes; 8 : Proteus mirabilis ; 9 : Salmonella typhi

* Les chiffres indiquent le diamètre des zones d'inhibition exprimées en mm y compris celui du disque.

* (-) indique l'absence d'une zone d'inhibition notable.

* (/) indique un test non réalisé.

D'après les résultats du deuxième criblage (Tableau 7 et Fig. 7), on a constaté que la plupart des souches testées ont exercées une activité inhibitrice contre les deux bactéries-cible Salmonella typhi et Proteus mirabilis.

Dans le cas du bactérie-cible Salmonella typhi, l'activité antibactérienne la plus importante était observée chez la souche 29S2 (20 mm), suivie par 14G1 , 27G1, 40G1et en dernier lieu 34G1. Les souches 32G1 et 18S1 n'ont exhibées aucune activité contre cette bactérie-cible.

La zone d'inhibition provoquée par la souche 29S2 contre la bactérie-cible Proteus mirabilis (15 mm) était aussi la plus importante par rapport aux autres souches de Penicillium testées dont 27G1 avec une zone d'inhibition (14 mm), suivie par 14G1(11 mm), 32G1 (11 mm), 34G1(10 mm) et en dernier lieu 40G1(8 mm). L'activité antibactérienne du 18S1 n'était pas exprimée.

Cependant, l'activité antibactérienne contre les autres bactéries- cible Escherichia coli (1'), Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Citrobacter freundï, Enterobacter cloacea, Klebsiella pneumoneae et Listeria monocytogenes était faible (7 mm à 9 mm) ou non exprimée. Seul l'activité antibactérienne de la souche 32G1 contre Staphylococcus aureus qu'elle était remarquable (11 mm).

En comparant ces résultats à ceux du premier criblage, on a remarqué que les zones d'inhibitions obtenues durant le deuxième criblage étaient nettement inférieur a ceux obtenues en criblage primaire.

A titre d'exemple, les zones d'inhibitions des souches de Penicillium contre la bactérie- cible Pseudomonas aeruginosa en premier criblage étaient entre 10 mm et 16 mm, tandis qu'en deuxième criblage la plupart des zones d'inhibitions des mêmes souches ont été non exprimées.

En résumé, le premier et le deuxième criblage nous ont permis à révéler une activité antibactérienne plus ou moins important chez la plupart des souches dont certaines d'entre eux ont présentées une activité importante autant en premier criblage qu'en deuxième (la souche 27G1) ; tandis que d'autre ont révélées une activité importante dans le criblage primaire et une activité faible ou négligeable en deuxième criblage.

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"Piètre disciple, qui ne surpasse pas son maitre !"   Léonard de Vinci