4.3. Méthodes d'analyses statistiques des
données
4.3.1. Variables quantitatives
Les données collectées ont été
compilées dans deux matrices respectivement pour les variables
quantitatives et qualitatives en utilisant le tableur Excel. L'analyse des
données proprement dite s'est ensuite déroulée en 4
étapes.
4.3.1.1. Vérification de l'effet bloc et
ajustement des valeurs moyennes calculées
Compte tenu du fait que seuls les témoins sont
répétés, il est important d'évaluer d'abord l'effet
des blocs et d'effectuer l'ajustement des moyennes des écotypes non
répétés. Ainsi, une analyse de la variance (ANOVA) a
été faite pour chaque variable avec comme source de variation,
bloc, écotypes, témoins et écotypes x témoin. Cette
analyse a permis d'identifier les variables pour lesquelles il y a l'effet
bloc. Pour ces variables dont les effets bloc sont significatifs, ce sont les
moyennes ajustées qui seront utilisées dans la suite de
l'analyse.
4.3.1.2. Regroupement des écotypes en classe et
détermination des caractères
discriminants
Cette analyse s'est déroulée
en 3 étapes à l'aide du logiciel SAS version 9.2.
Etape 1
Une première étape dans cette analyse a
consisté à établir des combinaisons linéaires entre
les 14 variables en vue d'améliorer la classification numérique.
Ainsi, une analyse en composante principale a été
réalisée et les facteurs générés, et dont le
cumul de la variance expliquée est supérieure à 75 %
seront considérés comme variables pour la classification
(Louati-Namouchi et al., 2000 ; Hammami et al., 2008). Cinq
composantes principales ont été considérées dans la
suite de l'analyse.
Etape 2
La seconde étape consiste à structurer ou
classer les écotypes en groupes homogènes selon les
caractères agro-morphologiques. Elle est réalisée par la
méthode de classification ascendante hiérarchique (CAH).
L'algorithme utilisé est celui de WARD et le coefficient de
détermination R2 obtenu a permis de déterminer le
nombre de classes (INRAB, 2004).
Etape 3
Enfin, une analyse canonique discriminante pas - à -
pas a été réalisée afin de faire ressortir les
caractères qui discriminent les groupes issus de la classification. Une
description de chaque classe en fonction des caractères discriminant est
effectuée en vue de connaitre leurs potentialités
agronomiques.
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