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Diversités phénotypique et moléculaire des microsymbiotes du Sulla du nord (Hédysarum Coronarium L. ) et sélection de souches rhizobiales efficientes

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par Sana Dhane Fitouri
Institut national agronomique de Tunisie - Doctorat en sciences agronomiques 2011
  

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Liste des figures

Figure 1: Hedysarum coronarium L. (sulla) au stade floraison. 6

Figure 2: Dialogue moléculaire entre la plante et la bactérie lors de la mise en place 17
d'une association symbiotique fixatrice de l'azote.

Figure 3: Structure des nodules de légumineuses 20

Figure 4 : Distribution géographique des sites de collecte des rhizobiums du sulla. 32

Figure 5 : Conservation des nodules par déshydratation. 36

Figure 6: Ensemencement des souches sur milieu YEM. 37

Figure 7: Germination des graines sur milieu gélosé agar-agar 0,9 %. 39

Figure 8: Test d'infectivité des souches de la collection en association 40

avec Hedysarum coronarium L. et en conditions contrôlées.

Figure 9: Essai d'évaluation de l'efficience symbiotique 47

des souches rhizobiales, en condition de stress hydrique, sous serre vitrée.

Figure 10 : Variation des pluviométries et des températures minimales et maximales 49

mensuelles durant la campagne agricole 2008-2009 dans les stations Tunis et Goubellat.

Figure 11: Dispositif expérimental dans les stations Tunis et Goubellat. 51

Figure 12: Dilution de la préculture rhizobiale et inoculation du sulla au champ. 52

Figure 13: Projection plane des 2 principaux axes 1 et 2 discriminants 56

avec les sites et données pédoclimatiques relatives.

Figure 14: Dendrogramme de similarité des sites 57

selon les paramètres pédoclimatiques.

Figure 15: Morphologie de nodules rhizobiales sur racines de sulla 60

dans le site Oued Zarga.

Figure 16: Projections planes des deux principaux axes discriminants 61

avec les 14 sites prospectés et les paramètres mesurés.

Figure 17: Dendrogramme de similarité des sullas cultivés 62

dans les stations prospectées.

Figure 18: Observation sous microscope (x 103) des souches rhizobiales Gram-. 67

Figure 19: Aspect des colonies bactériennes sur milieu de culture YEMA/RC. 68

Figure 20: Croissance des souches rhizobiales à des teneurs croissantes 68

en NaCl sur milieu gélosé.

Figure 21: Cinétique de tolérance des souches rhizobiales de sulla 69

selon la salinité (NaCl) du milieu de culture liquide.

Figure 22: Cinétique de tolérance des souches rhizobiales de sulla 70

selon la variation du pH du milieu de culture liquide.

Figure 23: Cinétique de tolérance des souches rhizobiales de sulla 71

selon la variation de stress osmotique du milieu de culture liquide.

Figure 24: Croissance des souches sur milieu YEM/RC solide enrichi en calcaire. 71

Figure 25: Dendrogramme de similarité entre les souches de la collection 74

pour l'ensemble des caractères phénotypiques.

Figure 26: Electrophorèse des amplifias obtenus par Rep-PCR 76

de quelques souches nodulant le sulla.

Figure 27: Dendrogramme (UPGMA) illustrant les relations génétiques 77

estimées par l'indice de Dice résultant de l'analyse par Rep-PCR des souches nodulant le sulla.

Figure 28: Amplification de l'ADNr 16S de quelques souches nodulant le sulla. 79

Figure 29: Profils électrophorétiques de la restriction 80

par RFLP de l'ADNr 16S obtenus pour quelques souches de la collection après digestion par les endo-nucléases MspI et NdeII.

Figure 30: Formes et tailles des nodules issues de la symbiose 86

entre quelques souches de la collection et le sulla.

Figure 31: Système racinaire d'un plant de sulla avec un amas nodulaire inefficient. 86

Figure 32: Rendement des protéines brutes fixées par le sulla cultivé en pot et inoculé 90 avec différentes souches rhizobiales.

Figure 33: Effet du stress hydrique sur le développement du sulla cultivé en pot. 92

Figure 34: Effet du stress hydrique sur la croissance du sulla cultivé en pot 93

et inoculé par les souches HC1, HC5 et HC14.

Figure 35: Effet du stress hydrique sur la surface foliaire du du sulla cultivé en pot 94

et inoculé par les souches HC1, HC5 et HC14.

Figure 36: Morphologie des nodules des sullas cultivés en pot 94

et inoculés par HC14 et HC5.

Figure 37: Effet du stress hydrique sur la nodulation du sulla cultivé en pot 95

et inoculé par les souches HC5, HC14 et HC1 exprimée en poids sec nodulaire et nombre de nodules par plant .

Figure 38: Effet du stress hydrique sur la biomasse sèche aérienne du sulla 95

cultivé en pot et inoculé par les souches HC1, HC5 et HC14.

Figure 39: Variation du rapport PR/PA du sulla inoculé 96

selon les traitements hydriques.

Figure 40: Effet du stress hydrique sur le rendement en protéines brutes fixées 97

du sulla cultivé en pot et inoculé avec les souches HC1, HC5 et HC14.

Figure 41: Effet de l'inoculation rhizobiale au champ sur la croissance en hauteur 101

du sulla de 1ère année dans les sites de Tunis et Goubellat au stade floraison.

Figure 42: Cultures de sulla non inoculée, et inoculée par la souche HC14 102

dans le site de Goubellat (mai 2009).

Figure 43: Effet de l'inoculation rhizobiale au champ sur la surface foliaire 102

du sulla de 1ère année dans les sites de Tunis et Goubellat au stade floraison.

Figure 44: Effet de l'inoculation rhizobiale au champ sur la biomasse sèche aérienne 104

du sulla de 1ère année dans les sites de Tunis et Goubellat au stade floraison.

Figure 45: Effet de l'inoculation rhizobiale au champ sur les rendements 105

en protéines brutes aérienne du sulla de 1ère année dans les sites

Tunis et Goubellat au stade floraison.

Figure 46: Culture de sulla de 2ème année inoculée par HC5 et HC14 106

comparée aux témoins sans azote (T0), et azoté (TN) à Goubellat.

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