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Diversités phénotypique et moléculaire des microsymbiotes du Sulla du nord (Hédysarum Coronarium L. ) et sélection de souches rhizobiales efficientes

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par Sana Dhane Fitouri
Institut national agronomique de Tunisie - Doctorat en sciences agronomiques 2011
  

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Conclusions générales et perspectives

Conclusions générales et perspectives

La prospection des potentialités symbiotiques du sulla cultivé dans divers sites du nord de la dorsale tunisienne et la collecte de matériel rhizobial autochtone ont permis de déceler d'une part différentes caractéristiques d'intérêt fonctionnel des souches et d'autre part une diversité biologique bien développée. Une variabilité de la productivité de la plante hôte a été observée en relation avec l'environnement physique, et la population rhizobiale autochtone en symbiose.

L'étude de la diversité phénotypique des isolats collectés a révélé une influence du site géographique sur les groupements phénotypiques. Cette diversité est aussi corrélée à la diversité génétique intra spécifique révélée par Rep-PCR. L'analyse de la diversité génétique par PCR-RFLP de l'ADNr 16S associée au séquençage du gène 16S a confirmé la haute spécificité symbiotique entre H. coronarium L. et R. sullae, et mis en évidence la présence de certains endophytes non spécifiques à cette plante à effet PGPB (Plant Growth Promoting Bacteria).

Trois niveaux de tolérance aux stress abiotiques (salinité, sécheresse, pH) ont été mis en évidence entre les souches de R. sullae: souches hautement tolérantes (400 mM NaCl et - 0,95 MPa); moyennement tolérantes (200 mM NaCl et -0,9 MPa); et sensibles (150 mM NaCl et -0,5 MPa).

L'évaluation de l'efficience symbiotique sous quatre régimes hydriques (100, 75, 50 et 25 % RU) des souches HC5, HC14 et HC1 classées respectivement comme hautement, moyennement tolérantes, et sensible au stress osmotique a montré que la souche moyennement tolérante (HC14) donne les meilleures biomasses sèches (4,75 g/plante) et protéiques (1531 mg/plante) à 100 % RU. A 75 % RU, les souches HC14 et HC5 en symbiose avec le sulla permettent une production de biomasses sèches similaires et équivalentes à celles produites en condition de fertilisation azotée respective à 125 unités d'azote chimique. En condition de stress plus sévère (50 % RU), la souche hautement tolérante au stress HC5 a produit le maximum de protéines brutes (177 mg/ plante) dépassant HC14 de 39 %.

Conclusions générales et perspectives

L'inoculation du sulla par HC14 et HC5, dans deux sites, favorable (Tunis) et défavorable (Goubellat) à la culture, a montré l'adaptation de ces souches aux deux conditions environnementales:

- A Tunis, où le rhizobium spécifique au sulla est présent, l'inoculation a significativement amélioré la masse nodulaire de 52 à 71 % respectivement avec HC14 et HC5. Cette amélioration de la nodulation n'a toute fois pas affecté les rendements fourragers et protéiques.

- A Goubellat, où le rhizobium spécifique au sulla est absent, l'inoculation a fourni en première année de culture et au stade floraison une production de biomasse sèche équivalente à celle produite par une fertilisation chimique de 59 à 64 unités d'azote respectivement avec HC14 et HC5. En deuxième année, la densité rhizobiale spécifique au sulla à Goubellat est passée de 0 à 1,7 x 102 bactérie/g de sol et la production de fourrage de sulla cumulée a été équivalente à celle d'une culture sous régime de fertilisation chimique avec 140 unités d'azote.

En conséquence, l'efficience symbiotique des souches HC14 et HC5 a été vérifiée et couronnée par l'inscription d'un brevet intitulé Bio-fertilisant à base d'une souche locale de rhizobium spécifique au sulla du nord Hedysarum coronarium L. sous le numéro TN 2010/0310 du 02 Juillet 2010.

Du point de vue taxonomique, la recherche sur la diversité génétique des souches nodulant le sulla utilisant d'autres techniques moléculaires, en l'occurrence le séquençage des gènes atpD et recA, permettrait une meilleure classification de ces souches (analyse en cours).

Dans une étape ultérieure, l'évaluation de l'efficience des souches testées sous de nouvelles formes de stress biotique (champignons telluriques) ou abiotique (température) serait particulièrement intéressante dans une conjoncture de changement climatique.

Références bibliographiques

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