|
Université Bordeaux 1
UMR PACEA 5199
Laboratoire d'Anthropologie des Populations du Passé
Mémoire de Master 2 Sciences et Technologies
Mention
Anthropologie Biologique, Paléoanthropologie et
Préhistoire
Spécialité : Anthropologie Biologique
LA NECROPOLE MEROVINGIENNE « LA CHAPELLE » DE
JAU-
DIGNAC ET LOIRAC (GIRONDE) : DETERMINATION DE
LIENS
DE PARENTE PAR APPROCHE PALEOGENETIQUE
ETUDE DE
FAISABILITE
Diane THIBON
Sous la direction de Dominique CASTEX et de Marie-France
DEGUILLOUX.
Année 2008-2009
Remerciements
Je tiens à remercier toutes les personnes sans lesquelles
cette étude n'aurait pu être menée à bien ;
Messieurs les Professeurs J. JAUBERT et P.MURAIL pour m'avoir
permis de suivre les enseignements du Master Anthropologie biologique,
Paléoanthropologie et Préhistoire.
Marie-France DEGUILLOUX et Dominique CASTEX pour m'avoir
dirigée et conseillée dans ce travail ;
Marie-Hélène PEMONGE pour sa gentillesse et sa
très grande participation, sans laquelle ce mémoire n'aurait pu
être réalisé.
Yannick pour sa patiente et son soutien ;
Et enfin, ma famille pour leurs encouragements et leur
réconfort.
Table des matières
Introduction 6
I Présentation du site archéologique de
« La chapelle » 9
1. Environnement du site 9
2. Les quatre phases d'occupation du site 11
2.1. Le temple antique 12
2.2. La nécropole mérovingienne 12
2.3. Habitats de la fin du Haut Moyen-âge 14
2.4. Chapelle et cimetière médiéval
à moderne 15
3. La nécropole mérovingienne 16
3.1. Pratiques funéraires 16
Les tombes à l'intérieur du bâtiment 16
Les tombes de l'extérieur 17
3.2. Le recrutement par âge et par sexe 18
3.3. Le cas particulier des sarcophages du secteur occidental
18
II Matériel et Méthode 22
1. Généralités techniques sur
l'étude de l'ADN ancien 22
2. Matériel 23
2.1. Présentation du matériel 23
2.2. Choix des régions étudiées 24
3. Méthodes 24
3.1. Précautions 25
3.2. Préparations des échantillons 25
3.3. Extraction de l'ADN 26
3.4. Amplification de l'ADN 26
3.5. Vérification de PCR 28
3.6. Clonage 28
3.7. Analyse des séquences 29
3.8. Typage des fouilleurs 29
III Synthèse bibliographique 31
IV Résultats 33
1. Résultats de la synthèse bibliographique 33
2. Résultats des analyses génétiques 39
2.1. Les fouilleurs 39
2.2. Les séquences des individus 39
Sep 169 40
- 1er inhumé : 40
- 2ème inhumé : 41
- 3ème inhumé : 41
Sep 170 42
- 1er inhumé. 42
- 2ème inhumé : 43
- 3ème inhumé : 43
Sep 171 44
- 1er inhumé : 44
- 2ème inhumé : 44
- 3ème inhumé : 45
2.3. Synthèse des résultats 48
V Discussion 49
1. Authenticité des séquences : conservation de
l'ADN et contaminations 49
2. Haplogroupes retrouvés 51
3. Liens de parentés 54
VI Conclusion et perceptives 57
Annexe A : protocoles d'analyses d'ADN ancien 59
Bibliographie 62
Liste des figures :
Figure 1 : Localisation de Jau-Dignac en Gironde (in
Cartron et Castex 2009) 9
Figure 2 : Localisation de Jau-Dignac en Gironde (in
Cartron et Castex 2009) 9
Figure 3 : Vue aérienne de la zone 1 du site
archéologique (in Cartron et Castex2009). 10
Figure 4 : Plan général du site
archéologique (in Cartron et Castex2008). 11
Figure 5 : Plan de la nécropole
mérovingienne (Phase 2) (in Cartron et Castex 2009). 12
Figure 6 : Plan des structures d'habitats (phase 3)
(in Cartron et Castex 2009). 14
Figure 7 : Plan de la chapelle et du cimetière
médiévaux et modernes (phases 4 et 5) (in Cartron et
Castex 2006). 15
Figure 8 : Sépulture 169, 170 et 171 (in
Cartron et Castex 2006). 19
Figure 9 : Schéma d'une amplification d'ADN par
PCR (Vierstraete 1999). 27
Figure 10 : Fréquence actuelle de l'haplogroupe J
en Europe d'après Logan (2009). 52
Figure 11 : Fréquence de l'haplogroupe X en
Europe d'après Logan (2009). 53
Figure 12 : Arbre généalogique montrant
quels individus sont issus d'une même lignée
mitochondriale. 55
Figure 13 : Informations acquises en termes de relations
de parenté maternelles. 56
Liste des tableaux :
Tableau 1 : Détail des individus inhumés
dans les sarcophages. 20
Tableau 2 : Détail des dents utilisées
lors de l'extraction 24
Tableau 3 : Amorces utilisées pour chaque
fragment (Jehaes et al. 2001). 28
Tableau 4 : Synthèse bibliographique.
Critères techniques et résultats. 36
Tableau 5 : Synthèse bibliographique des
résultats d'études paléogénétique de liens
de parenté. 38
Tableau 6 : Mutations présentes sur la
région HVS 1 des fouilleurs. 39
Tableau 7 : Clones obtenus pour chaque fragment et
individu. 39
Tableau 8 : Détail des mutations présentes
sur tous les clones obtenus. 47
Tableau 9 : Mutations authentiques présentes sur
chaque fragment des individus. 48
| 
