2 METHODOLOGIE
Pour disposer des données nécessaires à
la réalisation de l'étude, une sérié
d'étapes sont obligatoires. Il s'agit notamment de l'extraction, du
formatage et de la codification des données relatives aux examens du LCR
et enregistrées dans le logiciel HEXAFLUX.
L'HEXAFLUX est un logiciel de gestion de laboratoire qui
permet d'enregistrer toutes les demandes d'analyses ainsi que leurs
résultats. Pratiquement, voici le circuit d'une demande
d'analyse est le suivant :
· saisie de la demande et paiement des frais d'analyse au
niveau des caisses ;
· enregistrement de la demande et des données
démographiques (sexe et âge) dans HEXAFLUX par une
secrétaire ;
· prélèvements des échantillons et
transfert au laboratoire : le LCR est prélevé par les
cliniciens et acheminé rapidement au Laboratoire de
Bactériologie ;
· les cahiers sont édités au laboratoire en
fonction de la nature de l'échantillon. A la fin de l'analyse, le
résultat est reporté sur la feuille de paillasse ;
· les résultats de l'analyse sont saisis dans
HEXAFLUX par le biologiste et rendus au clinicien.
HEXAFLUX est un logiciel d'enregistrement des données
et d'étude épidémiologique. La partie
épidémiologique permet de programmer des fonctions, de constituer
une bibliothèque de requêtes, d'extraire les données, de
les formater et les imprimer.
2.1 EXTRACTION DES
DONNEES
Plusieurs étapes sont nécessaires pour extraire
des données à l'aide d'HEXAFLUX. Il faut commencer par
écrire une requête correspondant à la demande
recherchée. L'accès à la fenêtre d'édition
des requêtes se fait à l'aide de la commande REQ, ensuite s'en
suit la rédaction de la requête et l'enregistrement sous un nom.
Dans le cas des examens du LCR, la requête est présente dans la
bibliothèque des requêtes sous la
dénomination'' LCR `'.
La commande EXTRACT permet l'accès à la
fenêtre d'extraction des requêtes. Apres le choix de la
requête à utiliser, du fichier d'entrée et de la saisie des
paramètres de lancement (code de l'analyse, valeur limite du
résultat), le fichier de sortie doit être nommé. Dans le
cas précis des examens du LCR, le code de l'analyse est ANAL1
(répertorié dans les données archivées). La valeur
limite du résultat consistait justement à fixer la période
le long de laquelle l'on veut extraire les données. Le fichier de sortie
a été nommé `'données du LCR 0608'. Tous les
dossiers des examens des patients du C.P.C entre 2006 et 2008 ont
constitué le champ de la recherche.
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