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Les éléments transposables: le cas du transposon mariner une approche expérimentale

( Télécharger le fichier original )
par R Ferhi
Université de Tebessa - DES en Biochimie et Biologie moléculaire 2009
  

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I.2.2.1. Le groupe des éléments hat:

Ils sont des transposons endogènes mobiles (In Léonard, 2005), ces éléments contiennent un seul ORF qui code la transposase, leurs ITRs sont généralement courts (11-17pb), l'insertion de l'un de ces éléments dans le site cible conduit à une duplication

Halaimia-Toumi, 2006). Les éléments de
ce groupe représentent entre eux un
domaine très conservé constitué de 50aa

situé sur la région C-terminal de la
transposase, ce domaine est impliqué
dans le phénomène de dimérisation de

Figure 4: structure de l'élément Ac. Modèle
d'après www.scibd.com

de 8pb (Renault et al. , 1997; in

ITR

ITR

deux molécules de transposase pendant le processus de transposition (In Halaimia Toumi, 2006).

Chez le maïs, les éléments Ac (pour activateur) ont une longueur de 4563, l'ARNm de 3500 pb transcrit à partir de ces éléments comprend 5 exons, il code une transposase de 807aa (figure 4) (Renault et al., 1997). La présence de l'élément Ac au sein du gène de la synthèse de l'anthocyane conduit à l'apparition de nouvelles mutations susceptibles d'être reversée suite au déplacement d'Ac, ces mutations sont exprimées par une couleur tacheté des grains (où Ac est inseré) avec la présence des grains de couleur normale (là où la mutation est reversée). L'élément Ds est un dérivé de l'élément Ac par délétion du gène de la transposase, donc cet élément ne peut jamais être transposé qu'à la présence d'Ac c'est-à-dire qu'en absence d'Ac, Ds reste en place et on n'observe pas de réversion de la mutation induite. En revanche, lorsque Ac est présent l'élément Ds se transpose en trans via le transposase d'Ac ce qui permet l'évacuation du Ds sous forme d'un transposon complexe permettant au gène de l'anthocyane de retrouver sa fonction (In Watson et al., 1994 ).

I.2.2.2. Le groupe des éléments PiggyBac:

Le premier élément de cette famille a été découvert chez le baculovirus qui a infecté des cultures des cellules du lépidoptère Trichoplusiani, ils sont d'une longueur comprise entre 2.3-6.3 kb, avec des ITRs d'une taille 12-19 pb, leur site d'insertion est caractérisé par la séquence conservée TTAA (In Halaimia Toumi, 2006). Le seul élément autonome de cette famille est appelé PiggyBac, le séquençage moléculaire a montré qu'il est un transposon de 2500pb et porte des ITRs parfaites de 13pb, en outre ils existent des ITRs internes asymétriquement localisées aux extrémités de l'élément, la transposase (64kDa) est codée par deux ORFs traduits comme un seul ORF, son motif catalytique est estimé d'être DDE?. Les éléments PiggyBac ont été caractérisés dans le génome d'espèces diverses, depuis les insectes jusqu'aux mammifères (Feschotte et Pritham, 2007; in Halaimia Toumi, 2006).

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