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Analyse des bacteries non cultivables

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par David LECHAUDEE
CNAM - Ingénieur 2010
  

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CONSERVATOIRE NATIONAL DES ARTS ET METIERS DE PARIS

Mémoire de l'examen « communication pour l'ingénieur »
BLG 111

Spécialité : Sciences et techniques du vivant
Option : génie biologique

ANALYSE DES BACTERIES NON CULTIVABLES

Présenté par

David LECHAUDEE

Soutenu le lundi 25 mai 2009

Membres du jury :

Monsieur Ali Saib, Professeur titulaire de la chaire de Biologie Monsieur Robert Morfin, Professeur des universités

Monsieur Philippe Pochart, Professeur des universités Madame Antonia Suau-Pernet, Maître de conférences Madame Marie-Irène Malewiak, Maître de conférences Monsieur Fabien Magne, Maître de conférences Monsieur Olivier Hennebert, Maître de conférences

SOMMAIRE

Pages

INTRODUCTION 3

1. LES BACTERIES NON CULTIVABLES, CONTEXTE ET IMPACT SUR LA SANTE PUBLIQUE. 4

1.1 Caractéristiques physiologiques et morphologiques des bactéries non cultivables. 4

1.1.1 Caractéristiques des bactéries non cultivables et non viables. 4

1.1.2 Caractéristiques des bactéries viables non cultivables (VNC). 5

1.2 Les facteurs induisant l'état non cultivable. 7

1.2.1 Facteurs entraînant la mort cellulaire. 7

1.2.2 Les facteurs de stress cellulaire, induction de l'état viable non cultivable. 7

1.2.3 Induction expérimentale de l'état viable non cultivable. 8

1.3 Bactéries VNC dans les denrées alimentaires, impact et enjeux. 8

1.4 Les bactéries viables non cultivables dans l'environnement. 9

2. ANALYSES ET METHODES DE RECHERCHE DES BACTERIES NON CULTIVABLE. 10

2.1 Analyse par fluorimétrie. 10

2.1.1 Double coloration CTC / DAPI. 11

2.1.2 LIVE/DEAD® BacLightTM. 12

2.1.3 Cytométrie de flux. 13

2.2 Direct Viable Count (DVC). 15

2.3 Analyse en Biologie Moléculaire par RT-PCR. 18

3. ETUDES SUR LA VIABILITE, L'ETAT VIABLE NON CULTIVABLE ET LA RESSUSCITATION. 20

3.1 La ressuscitation. 20

3.2 Les facteurs de ressuscitation : les protéines Rpf et Sps. 22

CONCLUSIONS 24

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 25

LISTE DES ABREVIATIONS 29

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