Chapitre 1 :
covid-19
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CHAPITRE 1 : COVIDE-19
1 Historique
L'émergence récente, en 2002 à 2003, de
l'épidémie de SRAS, et l'identification du pathogène
responsable, une espèce nouvellement apparue dans la population humaine,
a conduit à un regain d'intérêt et à une
intensification considérable de la recherche sur les virus. Les premiers
coronavirus humains ont été identifiés dans les
années 1960 dans le cadre d'infections bénignes des voies
respiratoires supérieures. Ils ont longtemps été
considérés comme l'un des agents responsables du rhume les plus
courants pour les rhinovirus. Même lorsqu'ils sont rapides, certains
travaux ont suggéré qu'ils sont associés à des
infections respiratoires plus graves, à des entéropathies, et que
ces virus ont longtemps été marginalisés chez l'homme.La
plupart des données virologiques sur les coronavirus pré-SRAS
concernent le domaine vétérinaire, où ces virus peuvent
provoquer des infections graves avec de graves conséquences
économiques sur les élevages avicoles et porcins en particulier.
Depuis 2003, 24 nouveaux coronavirus ont été identifiés,
trois chez l'homme, dix chez d'autres mammifères et 11 chez les oiseaux.
Le nombre de séquences de coronavirus référencées
dans GenBank en juillet 2007 était de 3000, dont 264 complètes
provenant de 25 espèces différentes de coronavirus, une
exponentielle des données génétiques disponibles
concernant ces virus(Vabret, Dina, Brison, Brouard, & Freymuth, 2009).
Concernant l'épidémie actuelle, la pathologie se
nomme maladie à coronavirus 2019 ou COVID-19, « CO » pour
corona, « VI » pour virus, « D » pour desease (maladie en
anglais) et 19 pour l'année de son apparition (2019)(DROUAZ & KADRI,
2020).
2 Définition
Covid-19 est une maladie causée par un virus qui
infecte généralement les cellules qui expriment l'enzyme de
conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) à leur surface. Ces cellules se
trouvent principalement dans les voies respiratoires, mais aussi au niveau
gastro-intestinal, rénal et cardiaque (DROUAZ & KADRI, 2020).
3 Classification et taxonomie
Selon la Commission internationale sur la taxonomie virale des
virus, les CoV sont classés dans l'ordre des Nidovirales, une famille
des Coronaviridae et une sous-famille des Coronavirinae. Sur la base de preuves
sérologiques antérieures et de données génomiques
récentes, la famille des Coronaviridae se compose de deux sous-familles,
la sous-famille Torovirinae et de la sous-famille Orthocoronavirinae de quatre
genres: Alphacoronavirus, Betacoronavirus et Deltacoronavirus, Gammacoronavirus
(Hozhabri et al., 2020).
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