2.2.5.3. Calcul des indices
Un indice de diversité est fonction de la richesse
spécifique de la communauté et de la structure de la
communauté. Il permet d'évaluer rapidement, en un seul chiffre,
la biodiversité d'un peuplement. Il renseigne sur la qualité et
le fonctionnement des peuplements.
La diversité spécifique est calculée
suivant les formules de FRONTIER & PICHOD ou de BROWER & al.,
cités par Lomba (2007).
 Ou 
L'indice de diversité de Simpson varie de 0 à
1.
Si Is ou Ds tend vers 0, la diversité est
faible ;
Si Is ou Ds tend vers 1, la diversité est forte.
Is ou Ds = indice de diversité de Simpson
Où ni = nombre d'individus d'une
espèce ou d'une famille ;
N = nombre total d'individus dans
l'échantillonnage ;
fe = rapport entre le nombre d'individus d'une
espèce ou d'une famille et le nombre d'individus pour toutes les
espèces de la communauté.
Le calcul de ces indices a été facilité
par un passage à l'utilisation du logiciel MVSP (Multi-Variate
Statistical Package version 3,12d). Ils tiennent compte de la richesse
spécifique et de la régularité de la répartition
des individus entre les espèces en faisant la somme, sur toutes les S
espèces i, de termes basés sur l'abondance relative de
chaque espèce (fi) au sein de la communauté dont on
calcul l'indice de diversité (Senterre, cité par Boyemba,
2006).
Selon Doucet, Frontier & Pichod-Viale, 1993 in Senterre,
cité par Boyemba, op.cit., la diversité fournie par l'indice de
Shannon-Wiener peut être rapportée à la diversité
théorique maximale à une échelle variant de 0 (lorsque la
quasi- totalité des effectifs est concentrée sur une
espèce) à 1 (lorsque toutes les espèces ont la même
abondance), ce qui correspond à l'indice d'équitabilité de
Piélou (E= H / log2S).
Enfin, un autre indice de diversité que nous avons
utilisé, peu sensible à l'effort d'échantillonnage, est
l'indice de diversité alpha de Fisher (=8). Cet indice, facile à
calculer, ne nécessite que la connaissance du nombre total d'individus
d'une communauté végétale et le nombre d'espèces y
correspondant.
Condit & al, cité par Boyemba (2006), donne une
formule suivante : S = 8 ln (1+N / 8), où
8 = diversité alpha de Fisher,
N = nombre total d'individus et
S = nombre total d'espèces.
a. Indice de Simpson (S)
Où pis est la fréquence de l'espèce i
dans l'échantillon s.
Cet indice se base sur la fréquence des individus
élevée au carré. C'est la probabilité que deux
individus appartiennent à la même espèce dans une
communauté de taille Ni. Par conséquent la contribution relative
des espèces rares est presque insignifiante.
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