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Conception d'idéotypes de tomate adaptés au stress hydrique.

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par Cheikh Mehdi Ould Mohamed Abdellahi Cheikh Mehdi
Montpellier-II - Master-2 informatique 2015
  

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1.2 Présentation de l'entreprise

Le centre Inra Provence-Alpes-Côte d'Azur est un centre de recherche tourné vers l'agroécologie des systèmes de culture sous serres et en vergers et la modélisation de l'impact régionalisé du changement climatique à l'échelle du paysage. Parmi ses unités des recherches, l'unité PSH (Plantes et Systèmes de culture Horticoles) travaille sur les productions horticoles alimentaires, et principalement les fruits et légumes consommés en frais. Ses objectifs finalisés sont de contribuer à la mise au point de scénarios techniques et paysagers permettant de promouvoir la qualité des produits récoltés et le respect de l'environnement. La réalisation de ces objectifs s'appuie sur des études au niveau de la plante, de ses fruits, et de populations de bioagresseurs, destinées à mieux comprendre

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leurs réponses à l'environnement. Elle s'appuie également sur des études au niveau des systèmes de culture permettant de représenter le fonctionnement des plantes en interaction avec l'environnement physique et biotique et les interventions culturales.

1.3 Contexte général du stage

L'unité PSH est structurée en 2 équipes de recherches dont l'équipe (Ecophysiologie de la Plante Horticole). Ce stage se déroule au sein de cette équipe et s'inscrit dans un projet plus vaste sur l'adaptation de la tomate au déficit hydrique, financé par le CTPS (Comité Technique Permanent de la Sélection).

1.3.1 Les données observées

Une expérimentation a été menée en 2013 sur une population de 120 lignées cultivées en condition témoin et en condition de stress hydrique. Cette population est issue du croisement entre une lignée (le génotype Cervil) à petits fruits mais aux qualités orga-noleptiques remarquables et une lignée (le génotype Levovil) à gros fruits (Causse et al. 2002). On traite tout génotype (élément de la population précédente) sous deux conditions (témoin et stress), sous chaque condition donnée, on s'intéresse aux variables MF (la matière fraiche) et MS (la matière sèche) qui varient en fonction de l'âge (des jours après anthèse de la fleur) de ce génotype.

Deux types de données : les premières issues de l'expérimentation, ce qui a permis de mesurer la MF et la MS, ce qu'on appelle dans ce cas, la MFobs (matière fraiche observée) et la MSobs (matière sèche observée) pour tout génotype et dans chaque condition. Le deuxième type de données est issu de la simulation qu'on fait grâce au modèle (la sous section suivante). Au niveau des axes, l'axe X = »des_jours» (il n'est considéré qu'à partir du jour=8) et sur l'axe Y =(MF ou MS). La Figure1.1 illustre pour l'un des génotypes (appelé SSD45) les mesures de matière fraiche observée et matière sèche observée obtenues pour les 2 conditions de culture (témoin et stress). On voit que les stress hydrique a réduit la croissance du fruit.

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"Ceux qui rêvent de jour ont conscience de bien des choses qui échappent à ceux qui rêvent de nuit"   Edgar Allan Poe