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REPUBLIQUE DU BENIN
******
MINISTERE DE L'ENSEIGNEMENT SUPERIEURE ET DE LA
RECHERCHE
SCIENTIFIQUE
******
ECOLE SUPERIEURE LE FAUCON
*****
DEPARTEMENT DE GENIE DE BIOLOGIE HUMAINE
Option : ANALYSES BIOLOGIQUES ET BIOCHIMIQUES
RAPPORT DE STAGE DE FIN DE FORMATION
Pour
l'obtention du
DIPLOME DE LICENCE PROFESSIONNELLE
THEME :
Evaluation de l'activité antibactérienne
d'extrait de Jatropha multifida et de Artemisia annua sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
Présenté &. Soutenu Par :
Toussaint Delberson Sèmèvo
SOVEGNON
Sous la direction de :
Tuteur de stage : Superviseur :
Mme Pélagie ZODOME Dr Victorien T.
DOUGNON
Chef Service du laboratoire Maître-Assistant des
Universités
de l'hôpital de zone d'Allada au CAMES, Microbiologie
MEMBRE DU JURY :
Président du jury :
Pr.
Fidèle TCHOBO
Rapporteur : Examinateur :
Dr. Victorien DOUGNON Dr. Jean-Robert KLOTOE
Année académique : 2018-2019
8ème Promotion
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
REPUBLIQUE DU BENIN
**********
MINISTERE DE L'ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE
LA
RECHERCHESCIENTIFIQUE
**********
ECOLE SUPERIEURE LE FAUCON
**********
SPECIALITE : ANALYSES BIOLOGIQUES ET
BIOCHIMIQUES
LES DIRIGEANTS DE L'ECOLE SUPERIEURE LE
FAUCON
DIRECTEUR GENERALE: Jean Michel SOARES
DIRECTEUR ACADEMIQUE: Prof. Hyacinthe AHISSOU
CHEF DEPARTEMENT : Dr. Paulin K. YOVO
1
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
LISTE DES ENSEIGNANTS DU DEPARTEMENT DE GBH
Nom et Prénoms Matières
Enseignées
|
ADAMOU
|
Affiz
|
Immunologie générale
|
|
ADJISSE
|
Simplice
|
Mathématiques
|
|
AHISSI
|
Vahid
|
Biochimie Structurale
|
|
AHISSOU
|
Hyacinthe
|
Biochimie Métabolique
|
|
AHOUIGNAN Gilbert
|
Hématologie générale/Hématologie
pathologie
/Hémostase
|
|
AKPOVI
|
Casimir
|
Biochimie Clinique
|
|
ANAGO
|
Eugénie
|
Enzymologie
|
|
ATCHADE
|
Pascal
|
Parasitologie générale/Mycologie/Parasitologie
Médicale
|
|
ATREVI
|
Nicolas
|
Anatomie générale
|
|
BANKOLE S. Honoré
|
Bactériologie appliquée, Virologie
|
|
DEGBEY
|
Cyriaque
|
Microbiologie Médicale /Hygiène
Hospitalière /Santé Publique
|
|
DESSOUASSI
|
Noel
|
Biophysique
|
|
DJEDATIN
|
Gustave
|
Génétique Moléculaire
|
|
DOUGNON
|
Victorien
|
Microbiologie générale/Méthodologie de
Recherche
|
|
GLELE
|
Moise
|
Transfusion sanguine
|
|
KANFON
|
Aurélien
|
Immunohématologie/Sérologie/Contrôle
Qualité
|
|
KLOTOE Jean-Robert
|
Technique instrumentale/Equipements biomédicaux et
Maintenance
|
|
LAFIA
|
Edgard
|
Management des services de santé
|
|
MASLOKONON Vincent
|
Histologie générale/Histologie Pathologie
|
|
NONVIGNON
|
Gisèle
|
Technique d'expression écrite et orale
|
|
PAZOU
|
Elisabeth
|
Biologie cellulaire
|
2
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Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
|
QUENUM Chantal
|
Education physique et sportive
|
|
QUIRINO Clet
|
Informatique
|
|
SEGBO Julien
|
Biologie moléculaire
|
|
SOARES R. Armel
|
Gestion des ressources humaines
|
|
TCHOBO P. Fidèle
|
Chimie organique
|
|
TOBOSSI Boniface
|
Statistique et Probabilité
|
|
TOKPANOU Nikita
|
Chimie générale
|
|
YADOULETON Anges
|
Entomologie médicale
|
|
YOKOSSI Daniel
|
Anglais générale/Anglais Scientifique
|
|
YOVO K. Paulin
|
Pharmacologie/Toxicologie
|
|
YOVOGAN Julien
|
Sciences-Physiques
|
3
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Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
DEDICACE
Dieu le Père! Lui qui a toujours
été mon guide et soutien, qui me comble
chaque jour
au-delà de mes espérances et sans qui je ne suis rien. Que son
nom
soit glorifié.
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Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
REMERCIEMENTS
Au cours de ma formation, j'ai eu l'honneur de rencontrer des
gens exceptionnels dont la sollicitude et la disponibilité me laissent
muet d'admiration. C'est ici le lieu d'exprimer toutes mes gratitudes :
A mon père Delphin SOVEGNON, A
ma mère Bernadette AGNIMONHAN, et A mon frère Ruben, Ma
soeur Merveille; Merci pour le soutien et les conseils et tous les
efforts consentis. Je vous dédie le présent travail.
A mon grand père Joseph SOVEGNON, ma
grand-mère Marie-Théophilia LOUNINFO, mes tantes Colette,
Pascaline et Germaine SOVEGNON, mes oncles Pierre et Roland SOVEGNON ;
Merci pour l'accompagnement et le soutien.
A mon Superviseur, Docteur DOUGNON Tamègnon
Victorien, Vos qualités d'enseignant, votre attention à
nos difficultés, votre patience, votre disponibilité, votre
ponctualité, et votre dévouement font de vous un modèle
qui suscite notre admiration. Je suis fière d'être votre
étudiant. Puisse le tout puissant vous combler au-delà de vos
attentes.
Au fondateur de l'Ecole Supérieure Le FAUCON
Monsieur Michel SOARES, pour tout ce qu'il fait dans
l'amélioration de nos conditions d'études.
A toutes les autorités de l'Ecole
Supérieure le FAUCON en particulier les enseignants du
département d'Analyses Biologiques et Biochimiques, pour la
qualité de la formation.
5
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
Au Directeur de l'Hôpital de Zone d'Allada, M.
Christian Modeste VIGAN, Nous vous remercions d'avoir accepté
nous accueillir comme stagiaire dans votre Hôpital, je vous exprime toute
ma reconnaissance.
A Madame Pélagie ZODOME, Merci de
m'avoir ouvert les portes de votre laboratoire sans aucune exigence. Vous
m'aviez consacré de vos moments précieux malgré vos
énormes occupations. Vos conseils et encouragements ont
été d'une importance capitale.
A tous les techniciens du laboratoire, pour
les conseils et leurs apports techniques.
A Dr Jerrold AGBANKPE, mes sincères
gratitudes pour votre contribution à ce travail.
Aux Mesdames DANNON Olga et AMADOU Afoussatou,
soyez en remerciés et que l'Eternel vous comble.
Aux membres de l'Unité de Recherche en
Microbiologie Appliquée et Pharmacologie des substances naturelles,
merci pour votre contribution dans la réalisation de ce
travail.
A tous mes camarades de la 8ème Promotion de
Licence Professionnelle en Analyses Biologiques et Biochimiques, Ma
profonde reconnaissance.
A tous ceux qui de près ou de loin ont
participés à la réalisation de ce travail.
6
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
HOMMAGES
À SON EXCELLENCE MONSIEUR LE PRESIDENT DU JURY,
C'est un honneur que vous me faites en acceptant de présider le
Jury. Je vous prie de recevoir mes respectueux hommages.
AUX HONORABLES MEMBRES DU JURY,
Je vous suis reconnaissant de l'honneur que vous me faites en
acceptant d'apprécier ce travail et d'apporter vos critiques. Vos
remarques contribueront à l'amélioration de sa qualité. Je
vous prie de recevoir l'expression de mes sincères
considérations.
7
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
SIGLES ET ABREVIATIONS
ES FAUCON : Ecole Supérieure Le
FAUCON
H Z Allada : Hôpital de Zone de
Allada
URMAPha : Unité de Recherche en
Microbiologie Appliquée et
Pharmacologie des substances naturelles
OMS : Organisation Mondiale de la
Santé
GBH : Génie de Biologie Humaine
NFS : Numération Formule Sanguine
GE-DP : Goutte Epaisse Densité
Parasitaire
TE : Test d'Emmel ou test de faciformation
VS : Vistesse de Sédimentation
HIV : Humain Immunodéficience Virus
HCV : Hépatite Virale C
AgHbS : Antigène HBs
GS-Rh : Groupage Sanguin Rhésus
CRP : Proteine Réactif C
ASLO : Antistreptolysine O
ECBU : Examen Cytobacteriologique des
Urines
SDW : Sérodiagnostic de Widal
TPHA : Treponema Pallidum
Hémagglutination Assay
BAAR : Bacille Acido Alcoolo
Résistant
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Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
PV : Prélèvement Vaginale
PU : Prélèvement
Urétral
T×Hb : Taux d'Hémoglobine
CMI : Concentration Minimale Inhibitrice
CMB : Concentration Minimale
Bactéricide
DI : Diamètre d'inhibition
MH : Müller-Hinton
mg : Milligramme
ml : Millilitre
: Klebsiella pneumoniae
. oxytoca : Klebsiella
oxytoca
E. coli : Escherichia
coli
C. freundii
mm : Millimètre
K. pneumoniae
: Citrobacter freundii
S.aureus : Staphylococcus
aureus
SE : Sève entière
EA : Extrait Aqueux
A.annua : Artemisia
annua
J. multifida : Jatropha
multifida
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Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
LISTE DES TABLEAUX
|
Tableau I : Mode opératoire du dosage de
la créatinine (méthode manuelle)
|
25
|
|
TableauII: Norme utilisée pour la lecture
des résultats des tests
d'antibiogramme des extraits végétaux
|
44
|
|
Tableau III : Profil de résistance des
souches de S.aureus isolées
|
48
|
|
Tableau IV: Profil de résistance des
souches de K.oxytoca isolées
|
48
|
|
Tableau V: Profil de résistance des
souches de K.pneumoniae isolées
|
49
|
|
Tableau VI: Profil de résistance des
souches de C. freundii isolées
|
49
|
|
Tableau VII : Diamètre d'inhibition des
extraits des plantes étudiées
sur les souches Cliniques bactériennes isolées
|
.50
|
|
TableauVIII: CMI,CMB, Pouvoir antibiotique (a.p)
de la sève de Jatropha multifida
|
53
|
10
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Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
LISTE DES IMAGES
|
Image I : Plan d'orientation dans le centre
|
21
|
|
Image 2 : Plante de Jatropha multifida
.................................... ......
|
36
|
|
Image 3: Plante de Artemisia
annua...................................................
|
38
|
|
Image 4 : Plaque de manipulation de la CMI et de
la CMB
|
.45
|
|
Image 5 : Manipulation des Diamètres
d'inhibition des extraits
|
51
|
Image 6: Manipulation des Diamètres
d'inhibition de l'extrait aqueux de
Artemisia annua 52
11
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
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Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
LISTE DES FIGURES
|
Figure 1 : Répartition des
résultats
|
46
|
|
Figure 2 : Répartition des
résultats en fonction du sexe
|
47
|
|
Figure 3 : Répartition des
microorganismes isolés
|
.47
|
12
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Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
RESUME
Suite aux échecs thérapeutiques et aux
coûts de plus en plus élevés des traitements des infections
urinaires les scientifiques font recourt aux plantes de la pharmacopée
traditionnelle. La présente étude a été
initiée dans l'objectif général, d'évaluer
l'activité antibactérienne de la sève de Jatropha
multifida et de l'extrait aqueux des feuilles de Artemisia annua
sur quelques souches cliniques responsables d'infection urinaire.
Les souches bactériennes ont été
isolées après l'examen cytobactériologique des urines
collectées. Les méthodes de diffusion en milieu
gélosé et en milieu liquide ont été
utilisées pour le test de sensibilité et la détermination
de la concentration minimale inhibitrice (CMI) et de la concentration minimale
bactéricide (CMB) des extraits de plantes sur les souches
isolées.
Dix souches bactériennes ont été
isolées des échantillons d'urines collectés. Les
bactéries isolées ont présenté des profils de
résistantes variés. Quant à l'activité
antibactérienne évaluée sur les feuilles et sève
collectés, l'extrait aqueux des feuilles de Artemisia annua n'a
eu aucun effet sur les souches étudiées. Les CMI et CMB de la
sève de Jatropha multifida varient en fonction des souches
bactériennes étudiées. Ainsi, la sève de
Jatropha multifida a une activé bactéricide sur toutes
les souches étudiées à l'exception de la souche de
Escherichia coli sur laquelle son action est plus
modérée.
A l'issu des travaux, les espèces bactériennes
les plus isolées sont respectivements Citrobacter freundii
(40%) , Staphyloccocus aureus (30%), et Klebsiella pneumoniae
(20%) . Toutes les souches cliniques isolées sont
multirésistantes. L'extrait aqueux de Artemisa annua à
600mg/ml ne présente aucune activité antimicrobienne sur les
souches étudiées. La sève de Jatropha multifida
montre une activité bactéricide contre les diverses souches
testées et pourrait donc constituer un substituant aux antibiotiques
suite à des transformations en médicaments traditionnels
améliorés.
Mots-clés : Souches clinique,
infections urinaires, activité antibactérienne, Artemisia
annua, Jatropha multifida,
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Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
ABSTRACT
Following therapeutic failures and the rising costs of
treating urinary tract infections, scientists are trying to find alternative
care options. Hence, the resort to plants of the traditional pharmacopoeia for
their many pharmacological activities. The present study was initiated in the
general objective, to evaluate the antibacterial activity of the Jatropha
multifida sap and the aqueous extract of the leaves of Artemisia annua
on some clinical strains responsible for urinary infection.
The bacterial strains were isolated by culture on Ordinary
Media (HD) and on specific media according to the results obtained on
microscopic observation after Gram staining. The species of isolated strains
was determined by the identification of the biochemical characteristics of the
strains. For this purpose the Leminor Gallery has been used for Gram-negative
bacteria. The agar and liquid diffusion methods were used for the sensitivity
test and the determination of the minimal inhibitory concentration (MIC) and
minimum bactericidal concentration (CMB) of the plant extracts on the isolated
strains.
Ten bacterial strains were isolated from the urine samples
collected. Isolated bacteria exhibited various resistant profiles. As for the
antibacterial activity evaluated on the leaves and sap collected, the aqueous
extract of the leaves of Artemisia annua had no effect on the strains studied.
The MICs and CMBs of Jatropha multifida sap vary according to the bacterial
strains studied. Thus, the sap of Jatropha multifida has a
bactericidal activity on all the strains studied with the exception of the
strain of Escherichia coli on which its action is more moderate.
At the end of the work, the most isolated bacterial species
are respectively Citrobacter freundii (40%), Staphyloccocus aureus
(30%), and Klebsiella pneumoniae (20%). All isolated clinical
strains are multiresistant. The aqueous extract of Artemisa annua at
600 mg / ml shows no antimicrobial activity on the strains studied. The sap of
Jatropha multifida shows bactericidal activity against the various
strains tested and could therefore be a substitute for antibiotics following
transformations into improved traditional medicines.
Keywords: Clinical strains, urinary tract
infections, antibacterial activity, Artemisia annua, Jatropha
multifida
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Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
SOMMAIRE
15
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
Introduction .17
Première partie : Présentation du cadre
de stage .19
1. Cadre institutionnel
2. Cadre technique
Deuxième partie : Déroulement du stage
.. 22
3. Objectifs du stage
4. Travaux effectués par section de laboratoire
5. Choix du sujet
Troisième partie : Etude du thème
31
6. Objectifs de l'étude
7. Synthèse bibliographique
8. Matériels et Méthodes
|
|
9. Résultats
|
46
|
10. Commentaire
|
|
..53
|
|
|
Conclusion
|
56
|
|
Références
|
57
|
|
Annexe
|
61
|
16
Réalisé par SOVEGNON Sèmèvo Toussaint
Delberson
Evaluation de l'activité
antibactérienne d'extraits de Jatropha multifida et Artemisia annua
sur
quelques souches cliniques responsables d'infections
urinaires.
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