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Diversité des begomovirus infectant le gombo au Togo


par Ayékitan AKAKPO
Université Joseph Ki-Zerbo - Master 2 en Biotechnologie 2019
  

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Annexe 2:Procédure de préparation du gel et de la migration électrophorétique des ADN

amplifiés par PCR 64

Annexe 3:Préparation des Mix et programmes PCR 64

Annexe 4: Composition de quelques tampons utilisés 66

xi

Liste des Sigles, Abréviations et Acronymes

Liste des acronymes viraux selon le Comité International de Taxonomie des Virus (ICTV)

Acronyme Dénomination du virus

ACMBFV: African cassava mosaic Burkina Faso virus

ACMV : African cassava mosaic virus

CLCuGA : Cotton leaf curl Gezira alphasatellite

CLCuGB : Cotton leaf curl Gezira betasatellite

CLCuGV : Cotton leaf curl Gezira virus

EACMV: East African cassava mosaic virus

HoLCrV: Hollyhock leaf crumple virus

OLCCMV: Okra leaf curl Cameroon virus OLCuMLA: Okra leaf curl Mali alphasatellite OLCuMLB : Okra leaf curl Mali betasatellite

OLCV : Okra leaf curl virus

OYCrCMA : Okra yellow crinkle Cameroon alphasatellite

OYCrV : Okra yellow crinkle virus

ToLCBFV : Tomato leaf curl Burkina Faso virus ToLCTGB : Tomato leaf curl Togo betasatellite

ToLCV: Tomato leaf curl virus

TYLCV: Tomato yellow leaf curl virus

Liste des abréviations

a) Organismes et institutions

CNRST Centre national de la recherche scientifique et technologique

CREAF Centre de recherches environnementales, agricoles et de formation

DDBJ DNA Data Bank of Japan

DSID Direction des Statistiques Agricoles, de l'Information et de la

Documentation

EMBL European Molecular Biology Laboratory

FAO Organisation des Nations unies pour l'alimentation et l'agriculture

FAOSTAT Food and Agriculture Organization Statistics

XII

Liste des Sigles, Abréviations et Acronymes

GenBank Banque de données génomiques des États-Unis d'Amérique

ICTV International commitee on taxonomy of viruses (Comité international de

taxonomie des virus)

INERA Institut de l'environnement et de recherches agricoles

LMI Laboratoire Mixte International

LVBV Laboratoire de Virologie et Biotechnologie Végétale

NCBI National Center of Biotechnology Information

RABIOTECH Réseau ouest-africain de biotechnologie

UFR/SVT Unité de formation et de recherche/sciences de la vie et de la terre

UL Université de Lomé

b) Autres abréviations

ADN Acide Désoxyribonucléique

ADN-A Composant A du génome des Begomovirus

ADN-B Composant B du génome des Begomovirus

ADNsb Acide désoxyribonucléique simple brin

APG Angiosperm Phylogeny Group

ARN Acide Ribonucléique

BLAST Basic Local Alignment Search Tool

bp Paire de bases

cccDNA Forme super-enroulée de l'ADN viral

CP Protéine de Capside

CR Common Region

dNTP Désoxynucléotide triphosphate

DO Densité Optique

EDTA Acide éthylène diamine tétra acétique

ELISA Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay

Genn. Gennadius

ID Immuno-Diffusion

IR Intergenic Region ou Région Intergénique

Kb Kilobase

XIII

Liste des Sigles, Abréviations et Acronymes

LIR Long Intergenic Region

MP Protéine de Mouvement

OLCD Okra leaf curl disease

ORF Open Reading Frames

Ori Origine de réplication

PCR Polymerase Chain Reaction

PIB Produit Intérieur Brut

PIP Programme International de Partenariat

qsp20 Quantité suffisante d'eau pour compléter un volume de réaction à 20 ìl

RCR Rolling Circle Replication

RDR Recombination Dependent Replication ou Réplication dépendante

REn Replication Enhancer ou Protéine activatrice de la réplication

Rep Protéine de Réplication

rpm rotation par minute

SCR : Satellite Conserved Region

TAE Tris-Acétate-EDTA

TrAp Protéine activatrice de la transcription

xv

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"Piètre disciple, qui ne surpasse pas son maitre !"   Léonard de Vinci