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Diversité des begomovirus infectant le gombo au Togo


par Ayékitan AKAKPO
Université Joseph Ki-Zerbo - Master 2 en Biotechnologie 2019
  

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Chapitre III : Résultats et discussion

produits PCR de 12 échantillons (3 par zone agro écologique) ont été séquencés (par Macrogen Europe). Après séquençage, 9 produits de séquençage étaient exploitables. L'analyse des neuf (9) séquences obtenues a révélé une identité élevée avec deux espèces virales ; le Cotton leaf curl Gezira virus (CLCuGeV) et le Okra yellow crinkle virus (OYCrV). C'est la première fois que ces 2 espèces virales ont été identifiées sur le gombo au Togo. Le Okra yellow crinkle virus (OYCrV) a été décrit pour la première fois en Afrique de l'Ouest au Mali (Shih et al., 2007; Kon et al., 2009), puis quelques années après en Côte d'Ivoire (Séka et al., 2016). Le Cotton leaf curl Gezira virus (CLCuGeV) quant à lui, il a été identifié à la base au Soudan (Idris et Brown, 2002, 2005) puis par la suite au Niger (Shih et al., 2009), au Burkina Faso (Tiendrébéogo et al., 2010) et en Côte d'Ivoire (Séka et al., 2016) sur le gombo. Il a été également associé à la maladie de l'enroulement foliaire du cotonnier (Gossypium sp. L.) au Soudan (Idris et al., 2000), en Inde (Sohrab et al., 2014) et au Pakistan (Iqbal et al., 2014 ). Au regard de la dynamique de ces deux espèces virales dans la sous-région ouest-africaine ces dernières années, leur découverte au Togo n'est pas surprenante. La propagation de ces virus pourrait s'expliquer par la dissémination des populations de mouche blanche qui constituent les principaux vecteurs. Notre étude a montré que le CLCuGeV est majoritaire et se retrouve dans les 4 zones agro écologiques comparativement à OYCrV qui a été identifié que dans deux zones agro écologiques (Littoral et Savane sèche). Ces résultats montrent que cette maladie est méconnue au Togo. L'impact du Cotton leaf curl Gezira virus (CLCuGeV) sur le rendement (nombre de fruits par plante, longueur, diamètre et poids du fruit) a été évalué au Burkina Faso sur quatre accessions de gombo (cultivar local,`Man Yanga') et quatre cultivars commerciaux (Clemson spineless, Indiana, Lima et Volta) auchamp en 2007 et 2008 (Tiendrébéogo et al., 2010). Des pertes de rendement importantes ont été observées pour le cultivar local (26-55%) comparativement aux cultivars commerciaux (4,4-9,6%). Ces pertes ont été estimées économiquement à 11100 et 1950 dollars à l'hectare, respectivement chez le cultivar local et les cultivars commerciaux. Ainsi, la présence de ces deux espèces virales (CLCuGeV et OYCrV) constituerait un véritable problème non seulement pour la production du gombo, mais aussi pour celle du coton au Togo comme les autres pays producteurs du coton en Afrique de l'Ouest notamment : le Burkina Faso, le Bénin, la Côte d'Ivoire, le Mali et le Sénégal. Pour cela, des mesures rigoureuses doivent être prises en vue d'un contrôle efficace de la propagation de ces virus afin de sécuriser durablement la culture du gombo et celle du coton dont l'exportation contribue considérablement au PIB des différents pays producteurs.

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"L'ignorant affirme, le savant doute, le sage réfléchit"   Aristote