Profil de sensibilité de souches d'escherichia coli isolées des prélèvements urinaires à Lubumbashi

Faculté des Sciences Pharmaceutiques

Département de Biologie Clinique

B.P. 1825

Profil de sensibilité des souches d'Escherichia Coli

isolées des prélèvements urinaires à Lubumbashi

LOSAMBO MUNDEKE Merveil

Mémoire présenté et défendu en vue de l'obtention du diplôme de Bachelier en Sciences Pharmaceutiques (BScP)

Octobre 2025

Faculté des Sciences Pharmaceutiques

Département de Biologie Clinique

B.P. 1825

Profil de sensibilité des souches d'Escherichia Coli

isolées des prélèvements urinaires à Lubumbashi

LOSAMBO MUNDEKE Merveil

Mémoire présenté et défendu en vue de l'obtention du diplôme de Bachelier en Sciences Pharmaceutiques (BScP)

Directeur : Dr Phn LONGANGA OTSHUDI Albert

Professeur

Encadreur : Phn MUJINGA KAYEMBE Rachel

Assistante

Année académique : 2024-2025

DÉDICACE

A mes très chers parents : MUNDEKE Jules et MANDOVU Marceline

II

AVANT-PROPOS

Au terme de ces trois ans de bachelier et à l'aube de ce manuscrit, je me donne le devoir de témoigner ma gratitude à l'Eternel Dieu tout puissant, mon seigneur et sauveur Jésus-Christ, de m'avoir donné la force à survivre ainsi que le courage de surpasser toute les difficultés.

Je souhaite remercier toutes les personnes qui de près ou de loin ont contribué à la réalisation de ce travail.

J'adresse mes remerciements au Professeur LONGANGA Albert, le Directeur de ce mémoire, cher professeur ces quelques mots ne suffiront pas à exprimer tout ce que je vous dois et notamment le choix d'un sujet me permettant de faire un travail si passionnant au monde scientifique. Merci pour vos conseils et orientations ayant permis l'aboutissement de ce travail. Mes remerciements s'adressent également au Professeur KABAMBA Arsène pour son implication et son savoir scientifique dont j'ai été bénéficiaire.

Je remercie l'Assistante MUJINGA Rachel, l'encadreur de ce travail depuis le début de cette étude j'ai bénéficié d'un soutien de votre part. Merci pour ces innombrables pistes de réflexion, corrections proposées avec une patience et une modestie incroyables venant de vous.

A tous mes Maitres et Professeurs de la Faculté de Sciences Pharmaceutiques de l'Université de Lubumbashi, pour l'enseignement reçu et l'éducation de qualité.

J'adresse un grand merci à mes parents : MUNDEKE Jules et MANDOVU Marceline, j'aimerai vous remercier pour tout ce que vous avez fait jusqu'à ce jour ; pour assurer l'éducation et la formation de tous les enfants, vous n'avez épargné aucun sacrifice pour notre réussite. Je vous dois ce que je suis aujourd'hui et ce que je serai demain, je ferai toujours de mon mieux pour rester votre fierté et ne jamais vous décevoir.

A toi mon petit frère bien aimé, ton encouragement et ton soutien était un bouffé d'oxygène qui me ressourçait dans les moments pénibles, de solitudes et de souffrances. En témoignage de mon affection fraternelle, de ma profonde tendresse et reconnaissance, je te souhaite une vie pleine de bonheurs et de succès, que Dieu le Tout Puissant te protège et te garde.

III

A tous ceux qui ont contribués de près ou de loin à la réalisation de ce travail, je vous dis merci

IV

RESUME

Les infections urinaires constituent, après les affections respiratoires, l'un des principaux motifs de consultation en microbiologie clinique. Escherichia coui en est l'agent causal prédominant. Cette étude menée à la Polyclinique la Bénédiction de Lubumbashi, visait à déterminer le profil de sensibilité de ce germe aux antibiotiques.

Il s'agissait d'une étude rétrospective qui s'est déroulée sur une période allant de janvier 2022 à janvier 2025, les fiches et les registres d'enregistrements nous ont servi à collecter les différentes informations sur 144 échantillons d'urines venant des patients.

Les résultats ont montré que 72 échantillons ont étaient positifs à Escherichia coui (50%), on a également noté une prédominance féminine (54,2 %) et la tranche d'âge la plus touchée était celle allant de 25 à 35 ans (50%). L'antibiogramme a révélé des taux de résistance aux antibiotiques de la famille des bêta-lactamines qui avaient été utilisés notamment au céfixime (25%), à l'ampicilline (20,8%), à la gentamicine (20%), à l'amoxicilline + acide clavulanique (18,7%). Toutefois le méropénème et la ciprofloxacine avaient conservé une efficacité.

Ces résultats confirment l'ampleur croissante de l'antibiorésistance et soulignent la nécessité d'un recours systématique à l'examen cytobactériologique des urines avant toute prescription ; d'une surveillance microbiologique régulière ; d'un usage raisonné des antibiotiques.

Mots-clés : Infection, urine, Escherichia coui, antibiogramme, résistance, Lubumbashi.

V

ABSTRACT

After respiratory infections, urinary tract infections are one of the main reasons for clinical microbiology consultations. Escherichia coli is the predominant causative agent. This study, conducted at the Polyclinique la Bénédiction in Lubumbashi, aimed to determine the antibiotic sensitivity profile of this germ.

This retrospective study took place over a period from January 2022 to January 2025. We used patient records and logs to collect various information on 144 urine samples from patients.

The results showed that 72 samples tested positive for Escherichia coli (50%), with a female predominance (54.2%), and the most affected age group was 25 to 35 years (50%). Antibiotic susceptibility testing revealed resistance rates to previously used bêta-lactam antibiotics, including cefixime (25%), ampicillin (20.8%), gentamicin (20%), and amoxicillin + clavulanic acid (18.7%). However, meropenem and ciprofloxacin remained effective.

These results confirm the growing extent of antibiotic resistance and highlight the need for systematic cytobacteriological examination of urine before any prescription ; regular microbiological monitoring ; and prudent use of antibiotics.

Keywords : Infection, urine, Escherichia coui, antibiogram, resistance, Lubumbashi.

VI

SOMMAIRE

DÉDICACE I

AVANT-PROPOS II

RESUME IV

ABSTRACT V

SOMMAIRE VI

LISTE DES FIGURES VIII

LISTE DES TABLEAUX IX

LISTE DES ABRÉVIATIONS X

INTRODUCTION 1

CHAPITRE I. GENERALITES SUR LES INFECTIONS URINAIRES 3

I.1. Urine 3

1.1.1. Définition 3

1.1.2. Composition de l'urine 3

1.2. Appareil urinaire 4

I.3. Infections urinaires (IU) 5

I.3.1. Définition 5

I.3.2. Germes responsables des infections urinaires 6

I.3.3. Facteurs des risques des infections urinaires 7

I.4. Types des infections urinaires 8

I.5. Transmission de l'infection urinaire 9

I.10. Traitement 11

I.10.3. Mesures de prévention non médicamenteuses 12

I.10.4. Prévention prophylactique 12

II.3. Caractères bactériologiques 14

CHAPITRE III. MILIEU, MATERIEL ET METHODE 19

III.1. MILIEU D'ETUDE 19

VII

III.2. TYPE ET PERIODE D'ETUDE 19

III.3. SOUCHES BACTERIENNES 19

III.3.1. Critères d'inclusion 19

III.3.2. Critères d'exclusion 19

III.3.3. Variables étudiées 19

III.4. MATÉRIEL 19

III.5. METHODES 19

III.6. SAISIE ET ANALYSES DES DONNEES 20

III.7. CONSIDERATION D'ETHIQUE 20

CHAPITRE IV. PRESENTATION DES RESULTATS 21

IV.1. SOUCHES ISOLÉES 21

IV.2. CARACTÉRISTIQUES SOCIODÉMOGRAPHIQUES 22

IV.2.1. Répartition des souches d'E. coui selon le sexe 22

IV.2.2. Répartition des souches d'E coui selon les tranches d'âge 23

IV.3. PROFIL DE SENSIBILITE D'E. COUI AUX ANTIBIOTIQUES UTILISES 24

CHAPITRE V. DISCUSSION 25

CONCLUSION 27

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 29

VIII

LISTE DES FIGURES

Figure 1: Appareil urinaire 5

Figure 2 : Répartition des souches d'E coli selon le sexe 22

Figure 3 : Profil de sensibilité des souches d'E. coli aux antibiotiques utilisés 24

IX

LISTE DES TABLEAUX

Tableau I. Principaux constituants de l'urine saine (Yasmine, 2016) 3

Tableau II: Répartition globale des souches isolées 21

Tableau III: Répartition des souches d'E coli selon les tranches d'âge 23

X

LISTE DES ABRÉVIATIONS

BLSE : Bêta-lactamases à spectre élargi

CFA : Antigène de Facteur de Colonisation

E. coli : Escherichia Coli

ECBU : Examen cytobactériologique des urines

IU : Infection urinaire

IUN : Infection urinaire nosocomiale

NAF : Fimbriae Non Agglutinante

RDC : République Démocratique du Congo

1

INTRODUCTION

Les infections urinaires sont des pathologies fréquentes en communauté qu'en milieu hospitalier, elles représentent le deuxième site d'infection bactérienne après les infections pulmonaires (Tullus et Shaiktuh, 2020). Elles sont définies par la présence d'un nombre significatif de bactéries dans les urines et se manifestent au niveau de l'arbre urinaires.

Escherichia coli est l'agent le plus fréquent parmi les isolats cliniques provoquant une infection chez l'homme. Certaines souches d'Escherichia coui se caractérisent par leur résistance à plusieurs antibiotiques ce qu'on appelle la multirésistance. La résistance des bactéries aux antibiotiques est devenue aujourd'hui un problème majeur de la santé publique La situation apparait particulièrement préoccupante en milieu hospitalier (Constantine et Maa-ufm, 2017).

Plusieurs études ont montré que les germes responsables des infections urinaires sont le plus souvent de la famille des entérobactéries avec une prédominance de l'espèce Escherichia coui qui est responsable de (90%) des IU.

La fréquence d'isolement des souches d'Escherichia coui résistantes aux antibiotiques responsables d'infections communautaires et nosocomiales dans les laboratoires hospitaliers est un problème de santé publique majeur.

La fréquence élevée des bactéries résistantes aux antibiotiques serait à la base des complications de la conduite thérapeutique face à cette pathologie, et justifie d'une part l'évaluation de l'efficacité de ces médicaments et d'autre part la recherche de nouvelles molécules antibactériennes. C'est dans cette optique que cette étude a été initié avec comme objectif général de contribuer à l'amélioration de la prise en charge des infections causées par Escherichia coui ; les objectifs spécifiques étaient de :

? Déterminer les caractéristiques sociodémographiques des patients,

? Déterminer la fréquence d'isolement des souches d'Escherichia coui,

? Déterminer le profil de sensibilité des souches d'Escherichia coui vis-à-vis des antibiotiques utilisés.

2

Ce travail est subdivisé en deux parties, la première partie est consacrée à la revue de la littérature sur les généralités des infections urinaires, les généralités sur Escherichia coui et la seconde partie, consacrée à notre expérience personnelle.

Première partie

DONNEES BIBLIOGRAPHIQUES

3

CHAPITRE I. GENERALITES SUR LES INFECTIONS
URINAIRES

I.1. Urine

1.1.1. Définition

L'urine est un liquide biologique composé de déchets de l'organisme, elle est secrétée par les reins par filtration du sang, qui sera expulsée hors du corps par le système urinaire (Alatou et al., 2015).

1.1.2. Composition de l'urine

Il y a 95 % d'eau dans l'urine d'une personne en bonne santé, où les déchets du métabolisme sont

dissous. Les éléments clés sont indiqués dans le tableau I.

Tableau I. Principaux constituants de l'urine saine (Yasmine, 2016)

Substances Plasma (g) Urine primitive (g) Urine définitive (g) Chimiques
Eau	180L	180L	1.5L
Chlore (Cl-)	650	650	7.5 à 22.5
Sodium (Na+)	585	585	6.75
Potassium (K+)	36	36	2.25
Protéine	14400	0	0
Glucide	180	180	0
Lipide	900	0	0
Urée	54	54	30
Acide Urique	5.4	5.4	0.9
Créatinine	1.8	1.8	1.8
Ammoniac	0	0	0.75
Acide Hippurique	0	0	0.3

4

1.2. Appareil urinaire

I.2.1. Définition

C'est l'ensemble des organes qui élaborent l'urine et l'évacuent hors du corps. L'appareil urinaire est formé de 2 parties. Le haut appareil urinaire est situé dans l'abdomen, en arrière de la cavité péritonéale et de son contenu. Il comprend :

? 2 reins, situés dans chaque fosse lombaire, de part et d'autre de la colonne vertébrale : le

parenchyme (tissu fonctionnel) rénal y élabore l'urine, qui est ensuite filtrée dans les calices ; ceux-ci, au nombre de 3 en moyenne pour chaque rein, se réunissent pour former le bassinet, qui collecte l'urine.

? 2 uretères, qui font suite à chacun des 2 bassinets ; ces conduits, d'environ 25 centimètres
de longueur, relient chaque rein à la vessie et permettent l'écoulement de l'urine vers la vessie.

Le bas appareil urinaire comprend :

? Vessie, organe creux, sphérique, dont la paroi est musculaire ; elle stocke l'urine venant

des uretères puis, lorsqu'elle est pleine, l'évacue vers l'urètre en contractant sa paroi musculaire ;

? Urètre : conduit séparé de la vessie par le col vésical, qui permet l'évacuation de l'urine
qu'elle contient hors du corps ; il est entouré d'un sphincter, dit urétral, qui se ferme pendant le remplissage de la vessie et s'ouvre lors des mictions. L'urètre a une morphologie différente chez l'homme et chez la femme. Chez l'homme, il est long et entouré par la prostate, qui forme autour de lui une sorte de manchon, et il s'ouvre à l'extrémité du gland pénien. Chez la femme, il est beaucoup plus court et s'ouvre à la vulve.

5

Figure 1: Appareil urinaire

I.3. Infections urinaires (IU) I.3.1. Définition

L'infection urinaire est l'infection bactérienne la plus commune et la cause d'un fardeau important pour les ressources du système de santé. En milieu communautaire, elle touche principalement les femmes actives sexuellement mais également les gens de tout âge. En milieu hospitalier, les personnes âgées et les porteurs de sonde urinaire sont les principaux patients touchés. Le concept d'une infection urinaire est large, allant d'une infection asymptomatique à une pyélonéphrite avec septicémie. L'identification de la cause et la sévérité de l'infection sont généralement établies au moyen de l'évaluation de la présentation clinique, des analyses biochimiques et des cultures urinaires. Le choix du traitement empirique est déterminé selon les facteurs de risque du patient et la sévérité à la présentation. La thérapie doit cibler l'Escherichia coli, pathogène identifié dans 80% des cas. À la suite de l'émergence d'E. coli producteurs de bêta-lactamases, l'ampicilline et les céphalosporines de première génération ont cédé leur place au triméthoprime-sulfaméthoxazole dans le traitement empirique. Depuis peu, la résistance à ce dernier augmente graduellement, atteignant maintenant jusqu'à 19% dans certains milieux et nécessitant ainsi une révision des choix empiriques. Le traitement de la cystite et celui de la pyélonéphrite sont donc revus, une attention

6

particulière étant accordée à la bactériurie asymptomatique, aux blessés médullaires et aux infections fongiques (Thirion & Williamson, 2003).

I.3.2. Germes responsables des infections urinaires

Les infections urinaires proposent une mise à jour sur les connaissances concernant l'épidémiologie de l'infection communautaire, sur leurs mécanismes de la résistance bactérienne et sur certains aspects de la maladie utiles autant aux urologues qu'aux infectiologues, gynécologues, urgentistes et médecins traitants. L'infection urinaire est multiple, complexe et justifie d'une approche multidisciplinaire (Yasmine, 2016).

Escherichia coli est responsable d'environ 90% des infections urinaires (TU) communautaires. Les souches de E. coli uropathogènes (UPEC) se différencient des souches retrouvées dans la flore commensale chez l'hôte normal, par la présence de facteurs de virulence et l'association à certains sérotypes : O1, O2, O4, O6, O7, O16, O18 et O75. L'arbre urinaire est normalement stérile, à l'exception de l'urètre distal contaminé par la flore digestive (entérobactéries, streptocoques), la flore cutanée (staphylocoques à coagulase négative, corynébactéries) et la flore génitale (lactobacilles chez la femme). Les reins sont protégés de l'invasion bactérienne par le sphincter vésico-urétral et le flux permanent de l'urine pyélique. La survenue d'une TU est liée soit à un déficit des défenses de l'hôte (anomalie organique ou fonctionnelle de l'arbre urinaire ou terrain particulier), soit au développement dans la flore urétrale d'une bactérie uropathogène. L'histoire naturelle de l'TU débute par la colonisation du tube digestif avec une souche uropathogène qui, grâce à la présence de facteurs de virulence, va coloniser l'aire péri-urétrale et migrer le long de l'urètre vers la vessie, puis le long de l'uretère vers le rein (Mariani-Kurkdjian, 2004).

Autres germes responsables des infections urinaires

? Klebsiella pneumoniae est une bactérie multirésistante et persistante, responsable de multiples infections nosocomiales, une panoplie d'éléments génétiques transférables comme les éléments d'intégration et de conjugaison, les plasmides conjugatifs, les transposons, les intégrons, qui offrent à ce germe de nouveaux caractères de virulence et de résistance aux antibiotiques, tels que les enzymes Bêtalactamases à spectre étendu (BLSE) et Carbapénémases codés par des gènes chromosomiques et plasmidiques acquis responsables de la dégradation des Bêtalactamines et des carbapénèmes (Giudicelli, 2025).

7

? Proteus mirabilis est un uropathogène opportuniste Gram négatif commun qui infecte les voies urinaires supérieures. Les fimbriae non agglutinantes (NAF) de P. mirabilis adhèrent aux récepteurs cellulaires de surface. Il a été démontré, dans des essais de liaison en phase solide et dans des tests de chromatographie sur couche mince avec détection par superposition, que des NAF purifiés provenant de P. mirabilis se fixent à de nombreux glycolipides incluant les asialo-GM1 et asialo-GM2 et le céramide lactosyl (LacCer), (Lee et al., 2024).

? Enterococcus faecalis : Lors des deux dernières décennies, Enterococcus faecalis a émergé comme une cause majeure d'infections nosocomiales. E. faecalis est une des rares bactéries presque complètement résistantes à l'un des composés les plus importants et les plus répandus du système immunitaire inné : le lysozyme (Ribeiro dos Santos, 2009).

? Staphylococcus saprophyticus est une des principales causes d'infections urinaires (IU) non compliquées chez la femme jeune sexuellement active. Sa prévalence varie selon les études de 1 % à plus de 42 %. La faculté d'adhérer aux cellules uroépithéliales de cette bactérie joue un grand rôle dans sa pathogénicité. Il a également été rapporté chez l'homme de tout âge et dans des infections plus sévères, comme des pyélonéphrites aiguës, des prostatites, des péritonites ou des endocardites (Praz, 2011).

I.3.3. Facteurs des risques des infections urinaires

Les infections urinaires (IU) peuvent être influencées par plusieurs facteurs de risque notamment : a. Anatomie :

? Femmes : La proximité de l'urètre à l'anus et la longueur plus courte de l'urètre. ? Malformations congénitales des voies urinaires.

b. Activité sexuelle : Avoir des relations sexuelles fréquentes peut augmenter le risque.

c. Hygiène : Mauvaises pratiques d'hygiène personnelle, comme un essuyage incorrect après avoir utilisé les toilettes.

d. Utilisation de contraceptifs : Certains types de diaphragmes ou de gels spermicides peuvent favoriser les infections.

e. Problèmes de santé

? Diabète : Une glycémie élevée peut favoriser la croissance bactérienne. ? Troubles neurologiques : Qui affectent la vessie.

f.

8

Obstruction des voies urinaires : Calculs rénaux ou hypertrophie de la prostate.

g. Utilisation de sondes urinaires : Les cathéters augmentent le risque d'infection.

h. Ménopause : La diminution des oestrogènes peut affecter la flore vaginale et augmenter le risque d'infection.

i. Antécédents d'infections urinaires : Les personnes ayant des antécédents d'infections urinaires fréquentes sont plus à risque.

j. Âge : Les personnes âgées peuvent être plus susceptibles en raison de divers facteurs, y compris des changements dans la fonction immunitaire.

I.4. Types des infections urinaires I.4.1. Cystite

La cystite ne provoque jamais de fièvre et présente des symptômes qui varient en intensité (Emmanuel Mortier, 2002).

? Brûlures mictionnelles, urines troubles, parfois hématurie macroscopique.

? Pollakiurie : mictions fréquentes ou peu abondantes, avec parfois impériosité

? Une cystite peut être totalement asymptomatique, révélée par l'examen microscopique des urines (cas fréquent pendant la grossesse).

I.4.2. Urétrite

L'urétrite est une inflammation de l'urètre masculin d'origine infectieuse, sexuellement transmise, définie par des critères cytologiques. Les micro-organismes responsables sont le plus souvent Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis et Trichomonas vaginalis. Le rôle des mycoplasmes est controversé et les autres micro-organismes sont beaucoup plus rares (Chaine & Janier, 2009).

I.4.3. Pyélonéphrite

La pyélonéphrite emphysémateuse est définie par la présence de gaz d'origine bactérienne au sein du parenchyme rénal et dans les espaces périrénaux. Bien que rare, c'est une affection grave, car non traitée, son évolution reste fâcheuse et sa mortalité varie de 50 à 90 % des cas. Le germe responsable le plus souvent est l'Escherichia coli dans 60 % des cas (Meziane et al., 2004).

9

I.4.4. Prostatite aiguë

La prostatite aiguë est une inflammation aiguë d'origine microbienne de la prostate. Elle affecte environ 1% des hommes au cours de leur vie avec des tableaux allant de simples brûlures urinaires à des sepsis sévères (Crespin et al., 2023).

I.5. Transmission de l'infection urinaire

Le cathétérisme vésical est le principal facteur de risque de survenue d'une infection urinaire à l'hôpital. La transmission manuportée de germes au cours des manoeuvres de pose ou d'entretien des sondes urinaires est souvent à l'origine de la contamination de ces dispositifs invasifs. L'application de mesures d'isolement de type « précautions standard » en général, et le renforcement de l'hygiène des mains en particulier, doivent permettre de prévenir la transmission croisée manuportée. Une nouvelle politique nationale dans le domaine de la désinfection des mains a été récemment lancée visant à promouvoir la friction hydro-alcoolique des mains en remplacement du lavage des mains conventionnelles. La supériorité de la technique de friction, plus accessible, plus efficace et mieux tolérée a été récemment mise en évidence pour améliorer l'observance de l'hygiène des mains et diminuer les infections nosocomiales. Cette technique trouve donc toute sa place dans le panel de mesures proposées pour prévenir les infections urinaires nosocomiales.

I.6. Physiopathologie

Les voies urinaires qui relient les reins au méat urétral sont normalement stériles et résistantes à la colonisation bactérienne malgré une contamination fréquente de l'extrémité distale de l'urètre par les bactéries intestinales. La défense majeure contre les infections urinaires est une vidange complète de la vessie pendant la miction. Les autres mécanismes qui maintiennent les voies urinaires stériles comprennent l'acidité des urines, la valvule vésico-urétérale et diverses barrières immunologiques et muqueuses. Dans près de 95% des cas, l'infection urinaire est due à des bactéries qui remontent vers la vessie par l'urètre et, en cas de pyélonéphrite aiguë, vont de la vessie au rein par l'uretère. Le reste des infections urinaires sont hématogènes. Une infection systémique peut résulter d'une infection urinaire, en particulier chez les personnes âgées. Les infections urinaires sont une cause fréquente de bactériémie nosocomiale (Hassanain et al., 2024).

10

I.7. Symptômes de l'infection urinaire

L'infection urinaire est caractérisée par les symptômes suivants :

· Besoin urgent d'uriner

· Besoin d'uriner plusieurs fois par jour en petites quantités

· Douleur et/ou brûlure à la miction

· Sensation de pression ou de douleur dans le bas-ventre

· Fuite d'urine dans les sous-vêtements

· Urine malodorante

Toutefois, ces symptômes peuvent ne pas être présents dans les cas où l'infection touche les reins. Lorsque c'est le cas, l'infection est généralement plus grave et peut provoquer de la fièvre, des frissons, des douleurs au dos, des nausées et des vomissements.

I.8. Diagnostic : Le diagnostic de l'infection urinaire repose sur la mise en évidence des germes dans les urines, soit indirectement avec des bandelettes urinaires, soit par culture des urines. Toutes fois, l'interprétation des résultats microbiologiques est parfois délicate, une technique de recueil des urines inadapté en particuliers chez les nouveau-nés et les jeunes enfants, est un écueil que le clinicien doit prendre en compte enfin d'éviter de portée un diagnostic erroné d'infection urinaire, un règle par excès ( Leroy, 2004).

I.9.Test de stérilisation des urines

Un test de stérilisation des urines est recommandé dans les situations suivantes :

· Femme présentant une incontinence urinaire par impériosité ou mixte.

· Femme âgée utilisant régulièrement des protections pour incontinence urinaire, quel que soit le type d'incontinence urinaire.

Avant de réaliser un bilan urodynamique ou une cystoscopie. Ce test peut être réalisé par bandelette urinaire ou par uroculture. L'examen cytologique des urines est un examen simple, non invasif, rapide et peu coûteux, qui permet la détection de cellules tumorales desquamant dans les urines provenant d'une tumeur des voies excrétrices urinaires, que celle-ci soit connue ou suspectée, et qui reste un complément à la cystoscopie et à l'histologie. Le cytodiagnostic urinaire, bien qu'il

11

contribue au diagnostic initial des tumeurs urothéliales, prend tout son intérêt pour la surveillance des malades traités. (Molinié & Mouton, 2008).

I.10. Traitement

I.10.1. Traitement curatif a. Infections urinaires basses

Étant limitée à la vessie, l'infection urinaire basse ne comporte pas de risque de cicatrice rénale. Elle peut être symptomatique (troubles et brûlures mictionnelles, douleurs pelviennes) ou asymptomatique. Le traitement de l'infection urinaire symptomatique fait appel à une monothérapie par voie orale d'une durée habituelle de 5 à 7 jours. En revanche, il n'y a pas de justification à traiter une infection urinaire basse asymptomatique. Il est important de rechercher une cause favorisante, tout particulièrement un trouble fonctionnel vésical (Fili & Devant, 2014)

b. Infections urinaires nosocomiales (IUN)

Une bactériurie > 105 ufc mL-1 est le seuil admis pour le diagnostic d'IUN ; ce seuil est cependant discuté. La leucocyturie est un critère diagnostique beaucoup moins utilisé. Aucune étude répondant aux critères actuels de qualité n'établit les modalités de la prévention de l'IUN avec un fort niveau de certitude. L'on recommande une asepsie rigoureuse autour du cathétérisme des voies urinaires, drainage clos. Le traitement curatif repose sur les antibiotiques. Les molécules pouvant être utilisées sont la nitrofurantoïne, les quinolones (norfloxacine, ofloxacine, ciprofloxacine), les C3G orales (Yasmine, 2016).

I.10.2. Traitement préventif

Les infections urinaires récidivantes de la femme posent le problème de leur fréquence et de leur traitement. Jusqu'à présent les antibiotiques donnés empiriquement au long cours permettaient de diminuer l'incidence des crises au prix des effets indésirables et de risque de résistance liés au traitement. Des études ont montré l'intérêt de l'utilisation de la canneberge dans cette indication. (Bruyère et al., 2010).

12

Figure 2 : Canneberge

I.10.3. Mesures de prévention non médicamenteuses

La plupart des mesures préventives des JUN sont non médicamenteuses : traitement chirurgical des obstacles à l'élimination des urines, drainage du résidu postmictionnel par le sondage intermittent, prévention de la constipation, boissons abondantes ou perfusion sous-cutanée, exercice physique, prise en charge des comorbidités. Parmi les thérapeutiques médicamenteuses (Durand-Gasselin et al., 2010).

Des mesures d'hygiène, une bonne hydratation, le respect des rythmes mictionnels permettent de préserver d'un nouvel épisode infectieux. Les compléments alimentaires comme la canneberge ou le D-mannose peuvent également interférer sur la récurrence des cystites par leur action antiadhésive de la bactérie à l'uroépithélium. Leur efficacité est relative et semblerait dose-dépendante. Toutefois, mieux tolérés qu'une antibioprophylaxie, ils peuvent augmenter la durée des périodes de répit.

I.10.4. Prévention prophylactique

La prévention repose essentiellement sur le port de vêtements couvrants et adaptés pour limiter les piqûres. L'immunité acquise ne protège pas contre de nouvelles contaminations. En cas de piqûre, il est recommandé de retirer rapidement la tique dans son intégralité, y compris le rostre, puis de désinfecter soigneusement la zone concernée. Étant donné que le risque de transmission bactérienne reste faible en France, une antibioprophylaxie n'est généralement pas indiquée, sauf pour les femmes enceintes (Tallon et al., 2014).

13

CHAPITRE II. GENERALITES SUR ESCHERICHIA COUI

La bactérie est désormais connue sous le nom Escherichia coli a été décrite pour la première fois par un pédiatre allemand, Theodore Escherich, à la fin du XIXème siècle ((Friedmann, 2006)), l'espèce Bacterium coli commune, isolée de selle de bébés nourris exclusivement au lait maternel (Méric et al., 2016).

II.1. Habitat

Escherichia coli est une espèce commensale du tube digestif, mais elle peut aussi se révéler être un dangereux pathogène intra ou extra intestinal. Un même clone pouvant passer d'un état commensal à pathogène, la compréhension des mécanismes impliqués dans la diversification d'E. coli dans ces deux habitats représente un enjeu majeur de santé publique. Des expériences d'évolution expérimentale utilisant E. coli ont permis de révéler différentes facettes de l'adaptation bactérienne(Friedmann, 2014).

E. coli présente un large spectre d'interactions avec l'hôte, pathogène, commensale ou probiotique. Dans des conditions de déséquilibre comme les maladies inflammatoires de l'intestin ou un régime hyperlipidique, les populations commensales d'E. coli augmentent et peuvent être considérés comme (micro-organismes commensaux ayant un potentiel pathogène) (Honrubia-Escribano et al., 2018).

II.2. Classification

La classification d'Escherichia coli selon le Bergey'smanual (Soumaila, 2012).

· Règne : Procaryote

· Domaine : Bacteria

· Phylum : Proteobacteria

· Classe : Gammaproteobacteria

· Ordre : Enterobacteriales

· Famille : Enterobacteriaceae

· Genre : Escherichia

14

II.3. Caractères bactériologiques II.3.1 Caractère morphologique

Découverts en 1981 par Escherich, les souches d'E. coli sont des bacilles droits aux extrémités arrondies de 2 à 3u de long sur 0,6u de large, sporulés, habituellement non encapsulés et mobiles grâce à des cils péritriche (Nguyen et al., 2000).

Figure 3 : E. coli vue au microscope

II.3.2 Caractères culturaux

o Aéro-anaérobies facultatifs.

o Culture facile sur milieux ordinaires lactosés.

o Sur milieux solides après 18-24h les colonies sont arrondies, lisses, à bords réguliers, de 2à 3 mm de diamètre.

o E. coli est une bactérie mésophile, son optimum de croissance est proche de la température corporelle des animaux à sang chaud (35-43°C). La limite de croissance inférieure se situe aux environs de 7°C. Les E. coli sont tués rapidement lorsque la température dépasse 70°C, comme dans le processus de pasteurisation. Outre la température, le pH peut aussi influencer la multiplication d'E. coli dont l'optimum de croissance est de 7,2 et 0,99 respectivement. La croissance d'E. coli est arrêtée à des pH extrêmes (<3,8 ou >9,5) et à une valeur d'inférieure à 0,94. Le degré d'acidité d'un produit peut donc constituer un facteur de protection pour sa sécurité (Fili & Devant, 2014)

E. coli se multiplie rapidement sur gélose ordinaire ou sélective, après 18 à 24 heures donne des colonies de 2 mm de diamètre. Le dédoublement de cellule a lieu toutes les 20 nm (Berrahmoune et al. 2012).

15

Figure 4 : Culture de l'E. coli

II.3.3. Caractères biochimiques

E.Coli possède un ensemble de caractères biochimiques qui permet de la différencier de l'espèce voisines. E. coli a la capacité de fermenter divers sucres (glucose, lactose, mannitol, et saccharose pour certaines souches) avec production d'acide organique.

L'un des traits distinctifs d'E. coli est sa capacité à produire de l'indole à partir du tryptophane. C'est un aéro-anaérobie facultatif. Urée négatif, tryptophane désaminase négatif, ne génère pas d'acétoïne et n'emploie pas le citrate comme source de carbone. Il transforme le nitrate en nitrite, n'a pas d'oxydase mais possède une catalase (Constantine et al., 2017).

II.3.4. Caractères antigéniques

Escherichia coli (E. coli) possède plusieurs antigènes qui permettent de le classer en différentes souches et sérotypes. Voici les principaux caractères antigéniques :

II.3.4.1. Antigènes O (somatiques)

o Ce sont des polysaccharides présents sur la membrane externe de la bactérie.

o Ils sont classifiés en plusieurs groupes, ce qui permet d'identifier les différents sérotypes (ex. O157).

II.3.4.2. Antigènes H (flagellaires)

o Ce sont des protéines qui constituent les flagelles de la bactérie.

o Ils peuvent également être classés en différents types, et E. coli peut avoir un ou plusieurs antigènes H.

16

II.3.4.3. Antigènes K (capsulaires)

o Ce sont des polysaccharides qui forment une capsule autour de la bactérie.

o Les antigènes K peuvent jouer un rôle dans la virulence, en protégeant la bactérie de la phagocytose.

II.3.4.4. Antigènes F (adhésifs)

o Certains E. coli possèdent des antigènes qui aident à l'adhésion aux surfaces, ce qui est crucial pour l'infection.

II.3.5. Pouvoir pathogène

Les Escherichia coui constituent un très vaste groupe de bactéries. Ils constituent également l'espèce dominante de la flore aérobie du gros intestin. La possession de certains caractères est corrélée avec des pouvoirs pathogènes très divers (Rania, 2017).

Les souches d'Escherichia coui peuvent causer des infections intestinales (entérites, diarrhées) et extra-intestinales (infections urinaires, septicémies, méningites). La plupart des souches d'E. coui pathogènes produisent des adhésines fibrillaires spécifiques qui constituent un facteur essentiel de colonisation. Les souches intestinales d'E. coui sont très souvent porteuses de plasmides transférables contenant des groupes de gènes spécifiques à ces adhésines fibrillaires comme K88, K99 ou les antigènes du facteur de colonisation (CFA) 1 et 11. Par contre les groupes de gènes des fimbriae des souches extra-intestinales d'E. coui, dont les fimbriae P, S sont situés sur le chromosome (Hacker, 1992).

L'espèce Escherichia coui est subdivisée en de nombreuses souches pathogènes pour l'homme et les animaux sur base de la possession de propriétés ou de la production de facteurs spécifiques qui sont responsables de leur pouvoir pathogène. Ces souches pathogènes sont classiquement divisées en souches à tropisme intestinal (entérotoxinogènes, entéropathogènes, entérohémorragiques, vérotoxinogènes et entéro-invasives) et en souches à tropisme extra-intestinal (uropathogènes et invasives). Les souches invasives provoquent des septicémies et/ou des bactériémies avec localisations dans différents organes (infections systémiques). Si les propriétés et facteurs spécifiques de virulence des souches à tropisme intestinal sont relativement bien connus et caractérisés, ceux des souches à tropisme extra-intestinal le sont beaucoup moins, surtout chez les animaux.

17

Escherichia coli constitue la majeure partie de la flore microbienne commensale aérobie du tube digestif de l'homme ; c'est également le bacille à Gram négatif le plus fréquemment responsable d'infections humaines. Celles-ci résultent de la rupture de l'équilibre qui existe entre la bactérie et l'hôte. Le pouvoir pathogène d'E. coli chez l'homme peut être extrêmement varié. D'un point de vue clinique, on distingue au sein de l'espèce les souches pathogènes intestinales et les souches pathogènes extra-intestinales (Infection et al., 1995).

Deuxième partie
TRAVAUX PERSONNELS

19

CHAPITRE III. MILIEU, MATERIEL ET METHODE

III.1. MILIEU D'ETUDE

Cette étude a été menée à la polyclinique la Bénédiction, celle-ci est située au centre-ville de la ville de Lubumbashi, dans la province du Haut-Katanga, en République Démocratique du Congo (RDC).

III.2. TYPE ET PERIODE D'ETUDE

Il s'agit d'une étude rétrospective qui a été réalisée sur une période allant de janvier 2022 à janvier

2025.

III.3. SOUCHES BACTERIENNES

Cette étude a porté sur différentes souches bactériennes qui avait été isolées et identifiées en provenant des échantillons des urines.

III.3.1. Critères d'inclusion

Nous avons inclus dans cette étude uniquement les souches d'Escherichia Coui étant donné que ce sur cette catégorie bactérienne que notre étude était basée.

III.3.2. Critères d'exclusion

Pour la suite du travail, nous avions exclu toutes les autres souches bactériennes qui avaient été identifiées en dehors des souches d'Escherichia coui.

III.3.3. Variables étudiées

La répartition du variable d'étude de notre travail était basée sur le sexe, l'âge et la sensibilité aux Antibiotiques

III.4. MATÉRIEL

Dans cette étude nous avons utilisé les documents, les fiches et les registres d'enregistrement du laboratoire de microbiologie de la polyclinique la Bénédiction

III.5. METHODES

Nous avons utilisé la méthode rétrospective et nous nous sommes servi de la documentation du laboratoire où nous avons collecté les différentes informations.

20

III.6. SAISIE ET ANALYSES DES DONNEES

Les données recueillies en rapport avec les souches d'Escherichia coui avaient été saisies et analysées au moyen de Microsoft Excel 2013

III.7. CONSIDERATION D'ETHIQUE

Toutes les informations ont été codifiées ; le caractère confidentiel et l'anonymat ont été

rigoureusement respectés.

21

CHAPITRE IV. PRESENTATION DES RESULTATS

Ce chapitre reprend les résultats obtenus à l'issue de notre recherche qui a été menée sur 144 échantillons d'urine.

IV.1. SOUCHES ISOLÉES

Tableau II: Répartition globale des souches isolées

Souches	Effectif (N)	Pourcentage (%)
Escherichia coli Klebsiella sp	72	50,0
	5	3,5
Proteus sp Citrobacter sp Candida albicans Klebsiella pneumoniae	8	5,6
	8	5,6
	2	1,4
	4	2,8
Neisseria gonorrhoeae Pseudomonas aeruginosa Staphylocoque coagulase negative Staphylocoque doré	3	2,1
	6	4,2
	8	5,6
	19	13,2
Streptocoque agalactiae Total	9	6,3
	144	100,0

Ce tableau montre que parmi les souches qui avaient été isolées et identifiées, les souches d'Escherichia coli étaient majoritairement représentées soit 50% suivies de souches de Staphylocoque doré (13,2%) et de Streptocoque agalactiae (6,3%).

22

IV.2. CARACTÉRISTIQUES SOCIODÉMOGRAPHIQUES IV.2.1. Répartition des souches d'E. coui selon le sexe

45,8%

54,2%

Feminin Masculin

Figure 2 : Répartition des souches d'E coli selon le sexe

Sur les 72 échantillons positifs pour E. coli ; 54,2 % provenaient de femmes (39 cas) et 45,8 % d'hommes (33 cas).

23

IV.2.2. Répartition des souches d'E coui selon les tranches d'âge Tableau III: Répartition des souches d'E coli selon les tranches d'âge

Tranches d'âge	Effectif (N)	Pourcentage (%)
[5-15 ans[ [15-25 ans[ [25-35 ans[ [35-45 ans[ =45 ans total	1	1,4
	19	26,4
	36	50,0
	10	13,9
	6	8,3
	72	100,0

Ce tableau montre que la tranche d'âge la plus touchée était celle allant de 25 à 35 ans soit 50% suivie de celle de15 à 25 ans soit 26,4% ; 35 à 45 ans (13,9%), celle d'au-delà de 45 ans (8,3 %) et enfin de 5 à 15 ans (1,4 %).

24

IV.3. PROFIL DE SENSIBILITE D'E. COUI AUX ANTIBIOTIQUES UTILISES

0%

Resistance Sensibilité

3,40%

3,30%

8,70%

0,10%

13,40%

4,40%

17,90%

4,80%

13,40% 28,70%

3,70%

25%

20,80%

2,90%

12%

20%

2%

100%

80%

60%

40%

20%

20,20%

25%

16,80%

5,50%

18,70%

Figure 3 : Profil de sensibilité des souches d'E. coli aux antibiotiques utilisés

Profil de sensibilité des souches d'Escherichia coli vis-à-vis des antibiotiques a montré qu'E coli était résistante majoritairement au céfixime (25%), à l'ampicilline (20,8%), à la gentamicine (20%), à l'amoxicilline + acide clavulanique (18,7%). Alors qu'une sensibilité a été révélée face au méropénème (28,7%), à la ciprofloxacine (25%).

25

CHAPITRE V. DISCUSSION

Cette étude menée à la polyclinique le Bénédiction sur les souches d'Escherichia coui isolées des urines a été réalisée sur un total de 144 échantillons et 78 échantillons ont été positifs à ce germe soit une fréquence de 50%, nos résultats rejoignent ceux de Lacheub et yasmine (2016) en Algérie où une prédominance des souches d'Escherichia coui avait été trouvée soit (64 %). Guy Albert (2008) au Cameroun avait trouvé que les entérobactéries étaient les germes les plus fréquemment isolés (81,6%) avec toujours une prédominance d'E. Coui à 46,9 % ; ce pourrait s'expliquer par le fait que E. coui est la bactérie la plus courante dans les infections urinaires communautaires, causant environ 90 % des infections dans certains milieux. La forte prévalence d'E. coui s'explique également par son habitat naturel dans le tube digestif et sa capacité à coloniser la zone péri-urétrale avant de migrer vers l'urètre et la vessie. E. Coli fait partie des coliformes fécaux, donc un mauvais nettoyage des parties intimes peut facilement provoquer l'entrée de la bactérie dans les voies urinaires (Raghu, 2016).

Cette étude a montré une prédominance féminine avec un pourcentage de 54,2 % comparativement par rapport aux (45,8 %). Ce résultat corrobore avec celui de Lacheub et Yasmine (2016) qui avaient trouvé une prédominance féminine de 69,23 % contre (30,77 %) pour le sexe masculin dans une étude réalisée en Algerie. Cette répartition est semblable à celle de beaucoup d'études réalisées à travers le monde (Periro, 2012). Cela est dû à l'anatomie féminine, avec un urètre plus court et une proximité avec l'anus, facilite la migration des bactéries intestinales, augmentant ainsi le risque d'infection. Les rapports sexuels fréquents sont également un facteur de risque pour les femmes.

L'étude indique que la tranche d'âge allant de [25 à 35[ans était la plus touché (50 %) suivies de celle comprise entre [15-25 [ans. Lacheub et Yasmine (2016) avaient trouvé sans leur étude réalisée en Algérie que la tranche d'âge de de 20 à 39 ans était la plus représentée suivie des personnes âgées de 60 ans, Il en est de même à Constantine où les résultats rapportés par Khebbeb et Belloum (2018) avaient montré que le taux des femmes âgées entre [15-40 et plus] était de (49%). Nous pensons que cela peut être lié à une forte activité sexuelle dans cette tranche d'âge.

26

Le taux d'infection est également élevé chez les personnes âgées en raison de divers facteurs, notamment des changements dans la fonction immunitaire.

Les résultats de l'antibiogramme ont montré des taux de résistance aux antibiotiques de la famille des bêta-lactamines qui avaient été utilisés notamment au céfixime (25%), à l'ampicilline (20,8%), à la gentamicine (20%), à l'amoxicilline + acide clavulanique (18,7%). Mbuya et al. (2020) à Lubumbashi en RDC, avaient trouvé dans leur étude une forte résistance à plusieurs antibiotiques entre autres à l'ampicilline (90,91 %) ; à l'augmentin (73,68 %) ; à la gentamicine (57,81 %). Nous pensons que cela pourrait être du au fait que ces antibiotiques sont les plus prescrits ce qui explique l'augmentation de la résistance vis-à-vis de ces derniers. Le méropénème (28,7%) et la ciprofloxacine (25%) étaient deux antibiotiques auxquels les souches d'E. coli étaient sensibles.

27

CONCLUSION

Cette étude a porté sur le profil de sensibilité des souches d'Escherichia coui isolées des prélèvements urinaires à la Polyclinique la Bénédiction de Lubumbashi avec pour objectif de déterminer la fréquence d'isolement d'Escherichia coui et le profil de sensibilité aux antibiotiques utilisés.

A la lumière des résultats obtenus au cours de notre période d'étude, il en ressort que la bactérie Escherichia coui prédomine la liste des germes isolés des urines et était responsable des infections urinaires avec un taux de 50%. Les femmes étaient les plus exposées aux infections urinaires à E. coli avec un pourcentage de (54,2%) comparativement aux hommes (45,8%) ; la tranche d'âge la plus touchée était celle allant de 25 à 35 ans soit (50%).

Les résultats de l'antibiogramme ont révélé des taux de résistance aux antibiotiques de la famille des bêta-lactamines qui avaient été utilisés notamment au céfixime (25%), à l'ampicilline (20,8%), à la gentamicine (20%), à l'amoxicilline + acide clavulanique (18,7%). Toutefois le méropénème et la ciprofloxacine avaient conservé une efficacité.

Ces constats mettent en évidence la nécessité :

? D'une surveillance microbiologique régulière et actualisée des profils de résistance locale ;

? D'un usage raisonné et encadré des antibiotiques pour limiter la pression de sélection ;

? D'un recours systématique à l'examen cytobactériologique des urines et à l'antibiogramme

avant toute prescription ;

? D'une sensibilisation accrue de la population et des soignants sur les mesures d'hygiène et de prévention.

28

29

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

Alatou M, Hamidechi M, Professeur A. 2015. Les infections urinaires.

ANSES. 2012. Avis et rapport de l'ANSES relatifs à une demande d'évaluation du risque lié à Vibrio parahaemolyticus via la consommation de produits de la mer.

Belgique JH-A de la S Géologique de. 1979. Réflexions sur la systématique des Galeoidei et sur les affinités du genre Cetorhinus à l'occasion de la découverte d'éléments de la denture d'un exemplaire fossile. popups.uliege.be.

Berrahmoune M, El N, Bentouir M, Nour R, Devant D, Zineb D, Fatima M, Mohammed B. Contribution à l'étude des mammites subcliniques dues à Escherichia coli chez la vache laitière dans la région d'Aïn Témouchent.

Bi FY. 2006. Profil antibiotypique des bactéries responsables d'infection urinaire communautaire.

Bruyère F, Bugel H, Cariou G, Boiteux JP, Hoznek A, Mignard JP, Escaravage L, Bernard L, Sotto A, Soussy CJ, et al. 2010. Recommandations du comité d'infectiologie de l'AFU : diagnostic, traitement et suivi des infections communautaires bactériennes de l'appareil urinaire de l'homme et de la femme adultes : cystites aiguës. Pelvi-Perineologie 4 : 304-308.

Chaine B, Janier M. 2009. Maladies sexuellement transmissibles. Maladies vénériennes. EMC - Traité de médecine Akos 4 : 1-9.

Constantine, MAA-UFM B. 2017. Étude phénotypique des souches d'Escherichia coli multirésistantes isolées de CHU Constantine.

Constantine M, Constantine M, Constantine M. 2017. Étude phénotypique des souches d'Escherichia coli multirésistantes isolées de CHU Constantine.

Crespin H, Bruyère F, Lecuyer A, Grammatico-Guillon L, Laurent E. 2023. Incidence et mortalité du cancer de la prostate, une cohorte de 564 975 patients, France 2010-2021. Progrès en Urologie - FMC 33 : S107-S108.

Durand-Gasselin T, Blangy L, Picasso C, de Franqueville H, Breton F, Amblard P, Cochard B, Louise C, Nouy B. 2010. Sélection du palmier à huile pour une huile de palme durable et responsabilité sociale. Oléagineux, Corps Gras, Lipides 17 : 385-392.

Emmanuel Mortier XA. 2002. Maladies infectieuses, 3ème édition. ESTEM : 291.

30

Fili V, Devant KA. 2014. Étude de la résistance aux antibiotiques de certaines bactéries d'importance clinique : Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, et Staphylococcus aureus.

Friedmann HC. 2006. Escherich and Escherichia. Advances in Applied Microbiology 60 : 133- 196.

Friedmann HC. 2014. Escherich and Escherichia. EcoSal Plus 6.

Giudicelli JF. 2025. Comparative beta-adrenoceptor blocking effects and pharmacokinet of penbutolol and propranolol: 2125.

Guy Albert Kenkou (2008). Mémoire. L'étude bactériologique des infections urinaires au Centre Pasteur du Cameroun, 2008.

Hacker J. 1992. Role of fimbrial adhesins in the pathogenesis of Escherichia coli infections. Canadian Journal of Microbiology 38 : 720-727.

Hassanain O, Alaa M, Khalifa MK, Kamal N, Albagoury A, El Ghoneimy AM. 2024. Genetic variants associated with osteosarcoma risk: a systematic review and meta-analysis. Scientific Reports 14.

Honrubia-Escribano A, Ramirez FJ, Gómez-Lázaro E, Garcia-Villaverde PM, Ruiz-Ortega MJ, Parra-Requena G. 2018. Influence of solar technology in the economic performance of PV power plants in Europe: a comprehensive analysis. Renewable and Sustainable Energy Reviews 82 : 488-501.

Khebab R, Belloum S. 2018. Les infections urinaires chez le sexe féminin. Mémoire Master : Ecologie Microbienne. Université des frères Mentouri /Constantine :110.

Infection PDEL, chez U, Sondes des, Le D, Urologie SD. 1995. Du CHU de Cocody: étude préliminaire.

Lee CH, Lee K, Lee JS, Jeong KY, Ko YH. 2024. Persistent organic alkalinity in the ocean. Geochimica et Cosmochimica Acta 387 : 53-62.

Leroy V PM-K. 2004. Épidémiologie et diagnostic des infections urinaires. Médecine Thérapeutique/Pédiatrie 8 : 28.

Mariani-Kurkdjian P. 2004. Physiopathologie des infections urinaires.

31

Mbuya KJ, Twite KE, Nkana MV, Mujing F, Kasamba IE1, Kalenga MK. (2020). Profil bacteriologique des infections urinaires diagnostiquées aux Cliniques Universitaires de Lubumbashi-RDC. Journal of Dental and Medical Sciences 19(4) : 01-08 DOI : 10.9790/0853-1904020108 www.iosrjournal.

Méric G, Hitchings MD, Pascoe B, Sheppard SK. 2016. From Escherich to the Escherichia coli genome. The Lancet Infectious Diseases 16 : 634-636.

Meziane K, Wilber M, Mazelle C, Lequéau D, Kuchaek H, Lucek EA, Rème H, Hamza AM, Sauvaud JA, Bosqued JM, et al. 2004. Simultaneous observations of field-aligned beams and gyrating ions in the terrestrial foreshock. Journal of Geophysical Research : Space Physics 109 : 5107.

Miloud KA. 2011. Infection urinaire : expérience du laboratoire de microbiologie de l'hôpital des spécialités de Rabat.

Molinié A, Mouton M-D. 2008. L'ethnologue aux prises avec les archives - introduction. Ateliers Les C 32.

Nguyen NH, Tô MC, Carles M, Bodin ATG. 2000. Étude de 91 souches d'Escherichia coli responsables de la maladie de l'oedème du porcelet dans le sud du Viet Nam.

Periro L. les infections urinaires, cystite aigue de la femme. Actualité Claude Bernard Info Lyon, 2012.

Praz G. 2011. H1N1 (continued), multiresistant Enterobacteriacea, new diagnostic tools. Revue Médicale Suisse 7 : 36-40.

Raghu F, Epidémiologie de la résistance chez les entérobactéries isolées sur les examens cytobactériologiques des urinesréalisés dans un service d'urgence : Université Paris Diderot - paris 7, du 06/04/2016.

Rania F. 2017. Étude du profil bactériologique et de la sensibilité aux antibiotiques des entérobactéries responsables des infections urinaires.

Ribeiro Dos Santos D. 2009. Transfert d'un gène de résistance aux bêta-lactamines blaCTX-M-9 entre Salmonella et les entérobactéries de la flore intestinale humaine : influence d'un traitement antibiotique : 255.

32

Sidor TA, Resnick MI. 1983. Urinary tract infection in children. Pediatric Clinics of North America 30 : 323-332.

Soumaila GA. 2012. Caractérisation phénotypique et génétique des Escherichia coli isolés des cas de colibacilloses aviaires au Sénégal. Thèse de doctorat, Université Cheikh Anta Diop de Dakar.

Tallon L, Luangphakdy D, Ruffion A, Colombel M, Devonec M, Champetier D, Paparel P, Decaussin-Petrucci M, Perrin P, Vlaeminck-Guillem V. 2014. Comparative evaluation of urinary PCA3 and TMPRSS2:ERG scores and serum PHI in predicting prostate cancer aggressiveness. International Journal of Molecular Sciences 15 : 13299-13316.

Thirion DJG, Williamson D. 2003. Les infections urinaires : une approche clinique. Pharmactuel 36.

Tullus K, Shaikh N. 2020. Urinary tract infections in children. The Lancet 395 : 1659-1668.

Tzimenatos L, Mahajan P, Dayan PS, Vitale M, Linakis JG, Blumberg S, Borgialli D, Ruddy RM, Buren JV, Ramilo O, et al. 2018. Accuracy of the urinalysis for urinary tract infections in febrile infants 60 days and younger. Pediatrics 141.

Yasmine B. 2016. Les infections urinaires.