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Caractérisation biochimique d'isoenzymes d'estérases au cours du processus germinatif des graines d'espèces annuelles du genre "médicago " pour la tolérance au stress salin

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par Adel Amar Amouri
Es senia Oran-Algérie - Magistère génétique et amélioration des plantes / doctorant à  la recherche d'un stage en biologie moléculaire 2005
  

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BioTechWorld 2007Colloque International sur les Biotechnologies"Quelles biotechnologies pour les pays du sud ?"24-25 Novembre 2007, Oran, Algérie

CARACTÉRISATION BIOCHIMIQUE D'ISOENZYMES D'ESTÉRASES AU COURS DU PROCESSUS GERMINATIF DES GRAINES D'ESPECES ANNUELLES DU GENRE MÉDICAGO POUR LA TOLÉRANCE AU STRESS SALIN.

AMOURI A**, FYAD-LAMECHE F.Z** et ABDELGUERFI A*. Laboratoire de Génétique et d'Amélioration des plantes. Département de Biologie. Faculté des Sciences. Université d'Oran-Es-Sénia. Oran**. INA El Harach. Alger*. amouriaa@yahoo.fr

Résumé. L'activité des estérases qui est liée au stade physiologique et métabolique de la cellule, peut être affectée par les facteurs environnementaux tels que le stress salin. Pour cela, une étude a porté sur l'électrophorèse native et la révélation spécifique des isoenzymes d'estérases, chez deux écotypes appartenant à deux espèces différentes du genre Medicago, l'une tolérante (Tru 42) appartenant à l'espèce M.truncatula, et l'autre sensible (Pol 248) appartenant à l'espèce M.polymorpha. L'étude de la synthèse des isoenzymes d'estérases durant le processus germinatif des graines en conditions normales et durant le stress salin à différentes concentrations de salinité (0.4 %, 0.6 % et 0.8 %), a mis en évidence des variations quantitatives et qualitatives pour la synthèse de ces isoenzymes , entre ces deux écotypes, avec une cinétique d'apparition différente des nouvelles bandes, ce qui permettra la possiblité de localiser les QTLs en question.

Mots clés : Medicago - stress salin - germination - isoenzymes - estérases.

Abstract. The activity of the esterases wich is related to the physiological and metabolic stage of the cell, can be affected by the environmentals factors such as the salt stress. For that, a study was carried on the native electrophoresis of the isoenzymes of the esterases, on two ecotypes from two different species of Medicago, the tolerant (Tru 42) from M.truncatula and the sensitive one (Pol 248) to M.polymorpha. The study of the synthesis of the esterases isozymes during the germinatif process of seeds under normal and stress condition with different salt concentration (0.4?, 0.6 ? and 0.8 ?), showed a relationship between quantitative and qualitative variation of isoenymes patterns of the two ecotypes and the stress variation application, with a different apparition of new bands. This study will allow the possibility to locate the QTLs in question.

Keys words: Medicago - salt stress - germination - isoenzymes - esterases.

Introduction

L'activité des estérases qui est liée au stade physiologique et métabolique de la cellule, peut être affectée par les facteurs environnementaux tels que la température de culture, le stress hydrique, le stress salin et les agents polluants. Les estérases (E.C.3.1.1.2) EST, appartiennent au groupe des hydrolases. Au cours de la germination des graines (oléagineuses, amylacées et protéagineuses), il y a mobilisation des réserves par différentes hydrolases, lipases et /ou protéases dans une chronologie qui reste à déterminer (Khemiri.H et al., 2004). Le présent travail, a pour but de rechercher un éventuel marqueur isoenzymatique pour la tolérance au stress salin chez deux écotypes appartenant à deux espèces différentes du genre Medicago, l'une tolérante (Tru 42), et l'autre sensible (Pol 248). Le choix de ces deux écotypes n'est pas fortuit car ces résultats ont été obtenus après une étude biométrique (germination des graines et croissance de jeunes plantules) parmi six écotypes appartenant à des espèces différentes de Medicago (M.truncatula, M.polymorpha et M.ciliairis), sous différentes concentrations de salinité (0.4 %, 0.6 % et 0.8 % NaCl) (Amouri A et Fyad-Lameche F.Z., 2005).

Matériels et méthodes:

Matériel végétal :

Un lot de graines de deux écotypes appartenant à des espèces annuelles du genre Medicago (Tru 42 et Pol 248) fournis par l'INA El Harach (Alger), sont désinfectées, scarifiées puis ensemencées dans quatre boites de petri, tapissées de papier filtre. Les graines de la boîte témoin pour chaque écotype sont imbibées d'eau distillée et les graines des trois autres boites traitées sont imbibées d'une solution NaCl à différentes concentrations (0.4, 0.6 et 0.8 %). la germination des graines des boites témoins et traitées se déroule à l'obscurité et à 27°C #177; 1, après neuf jours d'imbibition.

Préparation des extraits isoenzymatiques d'estérases

En conditions normales, l'extraction est faite d'une façon journalière pendant les neuf jours d'imbibition. Pour les graines traitées, l'extraction est faite directement après neuf jours sous différentes concentrations en NaCl (0.4, 0.6 et 0.8 %). L'extraction est menée à froid dans un mortier en présence de sable et de tampon Tris-Kcl, pH=7, les extraits sont soumis ensuite à une centrifugation à froid (4°C) pendant 20 mn, à une vitesse de 13000 tours/ mn. La conservation des extraits a lieu dans un cryoconservateur contenant de l'azote liquide.

Electrophorèse native sur gel de polyacrylamide :

La migration s'effectue sur un gel continu de polyacrylamide à 8%, dans du tampon Tris Borate EDTA (TBE) pH= 8.3. Le tampon cuve est constitué de tampon gel dilué 10 fois. La migration se déroule à 5°C pendant 6 h sous une intensité constante de 30 mA et une tension de 150 V. La révélation s'effectue dans une solution contenant du Na2HPO4, 0.1M à pH=6.2, après l'ajout d'un substrat á naphtyl butyrate 1% mélangé avec de l'acétone et du Fast Blue RR salt. Après révélation les gels sont séchés et conservés.

Résultats

Analyse des profils électrophorètiques d'isoenzymes d'estérases :

Les figures 1-a et 1-b, représentent les zymogrammes du système Estérase chez l'écotype tolérant (Tru 42) sous différentes concentrations en NaCl. Les différents dépôts de j1 à j9 correspondent à des extraits de jeunes plantules témoins après un jour d'imbibition jusqu'au neuvième jour après imbibition. Les dépôts T1, T2 et T3 correspondent à des extraits de plantules traitées durant neuf jours sous différentes concentrations en NaCl (0.4, 0.6 et 0.8 %) respectivement.

Les figures 2-a et 2-b, représentent aussi les zymogrammes du même système enzymatique chez l'écotype jugé sensible (Pol 248) sous différentes concentrations en NaCl citées ci dessus.

Les bandes sont identifiées par leur Rf respectif, ainsi que leur intensité. Chaque écotype possède son propre profil et des bandes qui lui sont spécifiques

Chez l'écotype tolérant (Tru 42) :

Afin de faciliter l'interprétation de ces différents profils eléctrophorètiques, nous avons notés les bandes comme suit :

Bande 1 : rf (0.35-0.4), Bande 2 : rf (0.47-0.5), Bande 3 : rf (0.60), Bande 4: rf (0.65-0.67), Bande 5: rf (0.85-0.90).

Chez l'écotype sensible (Pol 248) :

Nous avons aussi notés les bandes comme suit : Bande 1 : rf (0.15), Bande 2 : rf (0.22), Bande 3 : rf (0.27-0.3), Bande 4: rf (0.4), Bande 5: rf (0.5), Bande 6: rf (0.7), Bande 7: rf (0.8), Bande8:rf (0.85).

Discussion

Après analyse des résultats, des variations qualitatives et quantitatives apparaissent dans la synthèse des isoenzymes d'estérases chez ces deux écotypes. D'après les figures (1-a et 1-b) et (2-a et 2-b), les zymogrammes du système Estérase chez l'écotype tolérant (Tru 42) et l'écotype sensible (Pol 248), montrent une cinétique de synthèse variable pendant les neuf jours de développement. Effectivement, on remarque l'apparition de certaines bandes et leur disparition dans certaines phases de développement, avec des variations de leur intensité, donc on s'attend à des variations quantitatives et qualitatives dans la synthèse des estérases. Nous supposons que chaque bande représente un isoenzyme, afin de faciliter l'interprétation de la cinétique de l'apparition de ces isoenzymes. Chez l'écotype (Tru 42), on remarque une synthèse d'isoenzymes après 24 h d'imbibition, avec apparition de trois bandes. Pendant les deux jours qui suivent (J2 et J3), on note deux bandes avec une disparition de la bande 4 représentant l'isoenzyme synthétisé durant le premier jour, cette disparition de cette dernière et la stabilité de la synthèse d'isoenzymes avec seulement un changement qualitative, représente une phase de repos, la même chose est observé chez l'écotype (Pol 248), avec apparition d'une seul bande au premier jour (J1) et sa disparition au deuxième jour (J2) et la stabilité de synthèse de deux isoenzymes, l'une appartenant a celle du premier jour (bande 1 ) et l'autre nouvellement synthétisée ( bande 7 ). Le quatrième (J4) et le cinquième (J5) jour chez les deux écotypes (Tu42 et Pol 248) respectivement, représentent les phases de début de croissance intense, d'où accroissement des niveaux enzymatiques des enzymes du métabolisme (Turck et al., 2002), cette différence s'observe d'une façon quantitative (bandes plus intenses) et qualitative (apparition de nouvelles bandes). Pour l'écotype (Tru 42), cette croissance intense dure deux jours (J5 et J6), et se stabilise jusqu'au neuvième jour (J9), par contre chez l'écotype (Pol 248), la croissance intense dure trois jours (J5, J6 et J7) ensuite elle se stabilise pendant le huitième (J8) et le neuvième jour (J9).

Pour le traitement T1 :

Chez les deux écotypes tolérant (Tru 42) et sensible (Pol 248), on note l'apparition de deux bandes avec une seule qui est intense, donc à cette concentration, on constate surtout une variation qualitative et quantitative pour (Pol 248) par rapport à (J8 et J9), et seulement qualitative pour (Tru 42) par rapport à (J7, J8 et J9). Chez l'écotype Tru 42, il y a un ralentissement métabolique de 4 jours, aussi bien chez Pol 248, sauf que cette dernière présente des modifications quantitatives ce qui prouve sa sensibilité à ce niveau.

Pour le traitement T2 :

Chez l'écotype (Tru 42), il y a un ralentissement métabolique de 5 jours avec des modifications qualitatives, et que (j 5) rappelons- le est la phase de croissance accélérée, d'où la nécessité de synthèse d'un nombre élevé d'isoenzymes. On peut on déduire que l'isoenzyme nouvellement synthétisé (bandes 3) est probablement une isoenzyme de stress qui appartient à une famille d'enzymes détoxifiantes. Chez l'écotype sensible (Pol 248), un ralentissement métabolique de 4 jours a été enregistré avec plus de variations quantitatives par rapport à Tru42 et des modifications qualitatives par l'apparition de la bande 4 qui représente un nouvel isoenzyme synthétisé.

Pour le traitement T3 :

Chez (Tru 42), il y a un ralentissement métabolique de 9 jours, alors que chez la variété (Pol 248), il y a un ralentissement de 4 jours, mais on remarque une disparition d'un isoenzyme (bande 4) par rapport à T2 et une diminution quantitative de la synthèse d'isoenzymes , ce qui explique que cet isoenzyme est responsable du maintien du pouvoir germinatif à T2 et que sa suppression à T3 inhibe cette germination, car d'après l'étude biométrique, l'indice de tolérance de la germination pour cette dernière, est nul, alors que pour Tru42, l'écotype le plus tolérant, il est de 0.13 (Amouri A et Fyad-Lameche F.Z., 2005). Durant le processus germinatif, en condition normales, les profils des zymogrammes du système (EST) chez les deux écotypes Tru 42 et Pol 248 , montre deux zones d'activités distinctes A et B, l'une a migration lente et l'autre à migration rapide, représentant probablement deux locus (EST 1) et (EST 2) contrôlant l'expression de ces isoenzymes, qui sont très variables en fonction des espèces et des population, et beaucoup plus en fonction des stades de développement (Fyad-Lameche F.Z., 1999). On remarque que dans la majorité des cas que les bandes monomorphiques sont situées dans la zone à migration rapide, et les bandes polymorphiques sont plus lentes.

Conclusion

L'étude de la synthèse des isoenzymes d'estérases durant le processus germinatif et pendant le stress salin, a mis en évidence des variations quantitatives et qualitatives pour la synthèse des isoenzymes de stress, entre les deux variétés, tolérante et sensible, avec des ralentissements métaboloiques et une apparition différente d'isoenzymes de stress, due à des différences dans la synthèse de ces isoenzymes au cours du stress salin. En repérant ces marqueurs de tolérance inductibles par ce stress, il est possible de localiser les QTLs en question.

Références bibliographiques

Amouri A ., Fyad-Lameche F.Z., 2005. Comparaison entre le gamétophyte et le sporophyte chez des écotypes d'espèces annuelles de Medicago pour la tolérance au stress salin.. Colloque euro-méditerraneen en biologie végétale et environnement. Annaba, Algérie, 28 -29 et 30 novembre 2005.

Fyad-Lameche. F-Z., 1999. Polymorphisme des isoenzymes et des protéines de réserves des graines de population naturelles d'espèces annuelles de Medicago en relation avec le système de reproduction. Thèse docteur D'état en Amélioration des plantes. Université d'Oran-Es-Sénia. 194 p.

Khemiri.H, Belguith.h, Jridi.T, Ben El Arbi et Ben Hamida.J., 2004. Caractérisation biochimique d'une amylase active au cours du processus germinatif des graines de colza (Brassica napus L). Congrès International de biochimie. Marrakech, Maroc, 3-6 Mai 2004. pp : 146-149.

Turk.N,Gallardo.K,Job.C,Job.D., 2002. L'analyse protéomique de la réponse au déficit hydrique dans la feuille de maïs en croissance. Congrès de la SFEAP, 16, 17,18 Octobre 2002, Lille. p : 6.

Témoin ( T0 ) Traités

J1 J 2 J3 J4 J5 J6 J7 J8 J9 T1 T2 T3

+

-

Figure 1-a : Zymogramme du système Estérase chez Tru 42

Figure 1-b : Zymogramme du système Estérase chez Tru 42

: Flèche indiquant une isoenzyme de stress

Témoin T0 Traités

J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 J8 J9 T1 T2 T3

+

T0

J1 J2 J3 J4 J5 J6 J7 J8 J9 T1 T2 T3

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Figure 2-a : Zymogramme du système Estérase chez Pol 248 -

Schéma 2-b : Zymogramme du système Estérases chez Pol 248

 : Flèche indiquant une isoenzyme de stress






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"Il faudrait pour le bonheur des états que les philosophes fussent roi ou que les rois fussent philosophes"   Platon