I.1.5. Structure et
organisation génomique du VIH
Il se présente sous la forme d'une particule
sphérique de 90 à 120 nm de diamètre (Hoen et
al.,2007) et se compose d'un matériel
génétique(ARN) accompagné de quelques protéines, le
tout contenu dans deux «coques» protéiques (les capsides),
elles-mêmes entourées d'une membrane, portant des protéines
spécifiques (ils forment l'enveloppe du virus) (Furelaud Et
Pavie,2002).
Figure 1: Structure
du VIH (Huraux et al.,2003)
Le génome du VIH-1 se compose d'un ARN simple brin
d'environ 9 181 nucléotides. Il comporte trois gènes principaux
(Gag, Pol, et Env.), ainsi que quelques gènes de régulation
(Soubéiga, 2012). Les gènes des
rétrovirus ne s'expriment qu'après avoir été
transformés en ADN « proviral » (Koné,
2010).
Les principaux gènes sont (Mesbah et
al., 2013) :
Ø Les trois gènes classiques des
rétrovirus :
· Le gène gag qui code pour les protéines
de structure interne, les protéines de structure ;
· Le gène Pol qui code pour la transcriptase
inverse, la protéase et l'intégrase ;
· Le gène env qui code pour les protéines
qui après glycosylation secondaire, donneront une partie de l'enveloppe
du virus les glycoprotéines d'enveloppe (gp120 et gp41).
Ø Les gènes propres au VIH :
Le gène tat est un gène
indispensable à la rétro transcription, capable d'agir à
distance d'où le terme de trans. Il joue un rôle de
synchronisation de la production virale et augmente l'expression par activation
de la séquence tat des LTR (long terminal repeat).
Le gène rev exerce une fonction de
régulation différentielle. Il code pour la protéine rev
grâce à deux séquences nucléotidiques
éloignées chacune ayant un rôle distinct : l'une
inhibitrice et l'autre levant cette inhibition.
Le gène nef est responsable de la
régulation négative de l'expression du virus donc de latence. Sa
destruction augmente la pathogénicité du virus.
Le gène vif intervient dans la
réplication virale. Il est responsable du pouvoir infectieux du virus.
Figure 2 :
Organisation génomiquedu VIH(Mesbah et al.,
2013)
I.1.6. Les marqueurs du VIH
et leurs évolutions
On retrouve 4 marqueurs virologiques dans le sérum ou
le plasma :
ü L'ARN du VIH(ARN-VIH) : le premier marqueur
à apparaitre entre le 7e et le 14e jour,
témoigne d'une réplication active du virus ;
ü L'antigène p24(Ag p24) : détectable
entre le 10e et 26e jour (14e jour en
moyenne) ; elle se négative en 3 à 4 semaines. Sa
réapparition, souvent des années après la primo-infection,
est le témoin d'une réplication virale intense ;
ü Les anticorps(Ac) anti-VIH : détectable entre le
15e et 45e jour et persistent à des concentrations
élevées tout au long de l'infection ;
ü L'ADN proviral ou ADN total cellulaire est le marqueur
le plus utilisé dans les essais cliniques.Détectable entre le
15e et 45e jour et persistenttout au long de
l'infection.
Figure 3 :Les
marqueurs du VIH et leurs évolutions
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