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Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.


par Aboubacar SYLLA
Université Felix HOUPHOUET- BOIGNY - Master 2 biotechnologies-biosécurité 2017
  

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2. Méthodes

2.1. Concentration des bactériophages

2.1.1. Principe

La concentration des phages consiste à concentrer les virus par l'intermédiaire de deux solutions:

le Polyéthylèneglycol (PEG 8000 à 40 %) et le NaCl (5 M). Ce mélange va permettre au PEG de former un complexe avec les cellules phagiques (Phage-PEG) et ce complexe est précipité par centrifugation après incubation sur glace. Le PEG est éliminé par le chloroforme pendant que les phages demeurent intacts. Ensuite les phages sont détruits par du phénol tandis que l'élimination des protéines phagiques a été possible par l'ajout du mélange phénol / chloroforme.

2.1.2. Protocole

Les phages ont été concentrés selon la méthode de Kumari et al., 2009 avec quelques

modifications. Ainsi, 3 mL de phages purifiés (1010-1011 PFU/ mL) sont ajoutés à 400 ìL de NaCl 5 M, et 800 ìL de PEG 8000 à 40 % et conservés à 4 O C pendant une nuit. Les précipités recueillis après centrifugation (10 000 rpm / min pendant 10 minutes, 4 O C) sont remis en suspension dans 500 ìL de PBS 1X (pH 7,2). Le mélange obtenu est traité avec un égal volume de chloroforme-alcool-isoamylique (24: 1) puis centrifugé à 9000 rpm / min pendant 2 minutes ; ce qui permet d'éliminer le PEG 8000 et les débris cellulaires de la suspension bactérienne.

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