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Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.


par Aboubacar SYLLA
Université Felix HOUPHOUET- BOIGNY - Master 2 biotechnologies-biosécurité 2017
  

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1.4.2. Cycle lysogénique « phages tempérés »

Des bactériophages, appartenant tous à l'ordre des Caudovirales, sont appelés des phages tempérés. Ces phages peuvent établir avec les bactéries des rapports de longue durée, éventuellement réversibles, qualifiés de lysogénie (Anas, 2011).

Le cycle lysogénique, aussi nommé « lysogénisation » (Dublanchet et Patey, 2011), a lieu lorsqu'un phage tempéré pénètre dans une cellule bactérienne. Le génome du phage s'insère dans celui de la bactérie et devient dès lors partie intégrante de celle-ci (on appelle le génome viral intégré « prophage »). La réplication de ce matériel génétique a ainsi lieu en même temps que celui de la bactérie. Celle-ci, dont le chromosome bactérien a été envahi, transmet ensuite lors de sa division ce nouveau patrimoine génétique à sa descendance (figure 2) (Dublanchet, 2009). Cet état « silencieux » demeure jusqu'à ce qu'à un moment donné, le cycle lysogénique s'active en cycle lytique et que le génome du phage s'excise du chromosome bactérien. Ce changement d'état est relativement rare : un cas pour 100 000 phages tempérés environ (Dublanchet, 2009), mais sa fréquence est augmentée lors d'un stress, induit par exemple par des rayons ultra-violets, des rayons X ou des substances chimiques comme des oxydants.

1.4.3. Cycle chronique « phages filamenteux »

La durée d'un cycle de réplication typique chez les phages filamenteux varie entre 10 et 15 minutes. Lors de ce cycle, le phage se fixe sur la membrane de la bactérie à partir du pilus sexuel bactérien et injecte son ADN dans la bactérie. L'ADN viral introduit dans la cellule bactérienne est converti de simple brin à double brin puis répliqué et transcrit en ARNm ; les ribosomes bactériens traduisent ensuite les ARNm en protéines de la capside virale, qui s'insèrent ensuite dans la membrane bactérienne, et s'assemblent entre elles en entourant un nouveau brin d'ADN viral, tout en traversant la membrane bactérienne jusqu'à être totalement excrétées sous forme de nouveaux virions. Cette invasion ne détruit généralement pas les bactéries et n'est donc pas intéressante en ce qui concerne la phagothérapie (Ackermann, 2003 ; Clokie et al., 2011).

Revue bibliographique

Figure 2 : Schéma des cycles d'infection phagique (lytique et lysogénique) (García et al., 2010)

Lors d'un cycle lytique, un phage virulent va pénétrer au sein de la cellule bactérienne, détruire le génome bactérien, en détourner la machinerie pour produire des éléments constitutifs de nouveaux phages et enfin lyser la bactérie pour libérer ces nouveaux virions.

Lors du cycle d'un phage tempéré, le génome phagique va s'intégrer au génome bactérien et prendre le nom de « prophage ». Ce prophage peut être transmis par transfert bactérien vertical (cellule mère à cellule fille) ou horizontal (entre deux bactéries sans lien de parenté). Parfois le cycle lysogénique s'active en cycle lytique notamment à l'occasion d'un stress.

Revue bibliographique

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