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Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.


par Aboubacar SYLLA
Université Felix HOUPHOUET- BOIGNY - Master 2 biotechnologies-biosécurité 2017
  

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2.1.3. Contraintes de la phagothérapie

Le principal inconvénient de la phagothérapie est le besoin de déterminer rapidement l'étiologie de la bactérie responsable de l'infection avec certitude. Il n'existe pas de phagothérapie probabiliste comme est le cas en antibiothérapie. La spécificité des relations entre les phages et les bactéries est un principal avantage mais également une limite quant à l'application de la phagothérapie. Un échantillon clinique doit être isolé, cultivé puis identifier selon des procédures microbiologiques standards avant l'administration des phages. Or, ce processus peut s'étendre jusqu'à 5 jours, comme dans le cas de la fièvre typhoïde. Ce problème pourrait trouver solution en l'utilisation de cocktails de phages (Loc-carrillo et Abedon, 2011).

Nécessité d'utiliser un bactériophage lytique et non un bactériophage tempéré car en plus d'être inefficace il peut être à l'origine de transfert de gènes pathogènes vers les bactéries. Cependant, grâce à la biologie moléculaire et au séquençage du génome viral, on peut rapidement éliminer les phages contenant des séquences génomiques potentiellement dangereuses (gènes de toxines, gènes de virulence, gène de résistance aux antibiotiques etc.). (Gorski et al., 2009)

Et pour finir, il est noté également le développement de résistance chez la bactérie cible résultant d'une mutation, d'une sélection ou de l'acquisition d'un nouveau matériel génétique par un phage tempéré. Il existe au moins 4 mécanismes de résistance que peut déployer une bactérie face à un phage spécifique : la perte ou l'absence du récepteur, sa modification structurale, ou par un mécanisme dans lequel le récepteur est caché au phage, contrant ainsi l'adhésion du phage à la bactérie. La perte du récepteur se produit lorsque la modification de la composition de la surface de la cellule bactérienne

Revue bibliographique

advient, tel qu'il a été démontré pour Bordetella spp. (Liu et al., 2002). Fort heureusement, la fréquence de résistance obtenue in vivo lors de la phagothérapie est basse (Kutter et al., 2010) comparée aux observations faites in vitro. De plus, l'isolement de nouveaux phages actifs à partir de l'environnement offre de nouvelles possibilités de traitement

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"Un démenti, si pauvre qu'il soit, rassure les sots et déroute les incrédules"   Talleyrand