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Evaluation de la dynamique spatio-temporelle de l'évolution de la covid a Libreville par une approche machine learning


par Bakari RAMADANE
Institut Africain d’Informatique - Diplôme d’Ingénieur Informaticien 0000
  

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b) Détermination du pique de l'épidémie ou le nombre maximal d'infectés

À partir du modèle S.I.R on peut également obtenir des informations pertinentes du point de vue de la santé publique. On peut par exemple déterminer le nombre maximal d'infectés Imax. Pour cela, on peut réécrire le modèle sous la forme suivante:

Ou encore si I?0

lmax sera obtenu lorsque donc pour soit:

c) Nombre de reproduction de base R0

R0 est le nombre de cas secondaires directement infectés par une unique personne infectieuse, placée dans une population totalement susceptible à la maladie. On l'exprime sous la forme du rapport probabilité de transmission de la maladie ë par le taux de guérison ã. Il est aussi exprimé sous la forme des produits du taux de contact "efficace" â, du nombre de contacts par unité de temps c ; et de la durée de la période contagieuse d.

R0 est un seuil en épidémiologie :

· si R0< 1, alors un individu en infecte en moyenne moins d'un, la maladie disparaîtra de la population à terme.

· si R0> 1, alors la maladie peut se propager dans la population et devenir épidémique.

d) Nombre de reproduction effectif Rt

Pendant les épidémies, la dynamique change en raison des mesures potentielles qui ont été mises en place pour réduire les interactions sociales et en raison du pourcentage croissant de personnes immunisées dans la population. Le taux de reproduction effectif décrit donc le taux de reproduction à un moment donné. Une valeur de Rt reflète la propagation potentielle basée sur les interactions sociales. Il est égale a au produit du taux de reproduction effectif par la proportion de population exposée à la maladie.

e) Intervalle intergénérationnel (D) :

Mesure le temps s'écoulant entre la survenue de la maladie chez un cas dénommé, par convention, le "parent" et la survenue de la maladie chez les personnes qu'il va infecter dénommées, par convention, les "enfants". Cet intervalle est fonction de :

· la durée de contagiosité : période pendant laquelle un infecte peut transmettre la maladie et,

· du temps de latence : période de temps entre l'infection et le début des symptômes chez l'agent infecte

f) vitesse de croissance d'une épidémie

À partir du taux de reproduction de base R0 et de l''intervalle intergénérationnel (D), on peut estimer la vitesse de croissance d'une épidémie. Le nombre d'infecte I(t) au cours d'un temps t est donné par la formule :

Ainsi on en déduit que l'évolution d'une du nombre d'infectés au début d'une épidémie est une croissance exponentielle.

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