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Les méthodes QSAR/QSPR et identification de nouveaux médicaments: SARS_CoV-2


par Assia REGRAGUI
Université Chouaïb Doukkali - Licence Fondamentale en Matière de Chimie 2020
  

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CHAPITRE 2 : Conception et développement de nouveaux médicaments Contre le virus

" SARS-CoV-2" 14

1. Introduction 14

2. Les approches adoptées dans la recherche de nouveaux médicaments de "SARS-

CoV-2". 15

2.1 Approche basée sur la médecine traditionnelle 15

2.2 Approche basée sur les fragments 15

2.3 Approche basée sur la carte de connectivité (Connectivity Map) 16

2.4 Approche basée sur la médecine in silico 16

3. Identification de médicaments antibiotiques de "SARS-CoV-2" en l'absence d'une

thérapeutique antivirale et d'un vaccin spécifiques 16

3.1 Des médicaments antibiotiques 16

3.1.1 Amoxicilline 16

3.1.2 Azithromycine 17

3.1.3 Fluoroquinolones 18

3.2 Des médicaments antiviraux 18

3.2.1 Lopinavir / Ritonavir 18

3.2.2 Ribavirin 19

3.2.3 Favipiravid (T-705) 19

3.2.4 Remdesivir 20

3.2.5 Oseltamivir 21

3.2.6 Chloroquine 21

3.2.7 Interférons 22

3.3 Les corticostéroïdes (méthylprednisolone) 22

4. Identification de nouveaux médicaments herbal de "SARS-CoV-2" 23

4.1 Les médicaments anti-coronavirus à base de la médecine traditionnelle Chenoise 23

4.1.1 Radix astragali (Huangqi) 24

4.1.2 Glycyrrhizae Radix Et Rhizoma (Gancao) 25

4.1.3 Radix saposhnikoviae (Fangfeng) 25

4.1.4 Rhizoma Atractylodis Macrocephalae (Baizhu) 26

4.1.5 Forsythiae Fructus (Lianqiao) 26

4.1.6 Lonicerae japonicae flos (Jinyinhua) 27

4.2 Les médicaments anti-coronavirus à base de la médecine traditionnelle Marocaine 27

4.2.1 Digitoxigenin 28

4.2.2 â-Eudesmol 29

4.2.3 Crocin 29

5. Conclusion 31

Conclusion générale 32

6. Bibliographie 33

Liste des figures

Figure 1. Schéma d'élaboration et validation d'un modèle QSTR (Khadidja, 2015) 3

Figure 2. Des descripteurs moléculaires relient la structure chimique à l'activité biologique. 4

Figure 3. Exemple de tableaux de connectivité C et de distance D de la molécule de l`acridine

7

Figure 4. Exemple d'illustration d'échafaudage moléculaire 8

Figure 5. Illustration simplifiée d'un réseau de neurones 10

Figure 6. L'arbre de décision a trois types de noeuds 11

Figure 7. Cycle infectieux d'un coronavirus, l'ensemble du processus de réplication virale a

lieu dans le cytoplasme 14

Figure 8. Illustration de la structure moléculaire de l'amoxicilline 17

Figure 9. Illustration de la structure moléculaire de l'azithromycine 17

Figure 10. Illustration de la structure moléculaire des Fluoroquinolones 18

Figure 11. Illustration de la structure moléculaire de Lopinavir (a) et Ritonavir (b) 19

Figure 12. Illustration de la structure moléculaire du ribavirin 19

Figure 13. Illustration de la structure moléculaire de favipiravid 20

Figure 14. Illustration de la structure moléculaire de Remdesivir 20

Figure 15. Illustration de la structure moléculaire de l'oseltamivir 21

Figure 16. Illustration de la structure moléculaire de la chloroquine 21

Figure 17. Illustration de la structure moléculaire des interférons 22

Figure 18. Illustration de la structure moléculaire de la méthylprednisolone 23

Figure 19. Liste des herbes utilisées par la médecine traditionnelle Chenoise. 24

Figure 20. Illustration de la plante « Radix astragali » 24

Figure 21. Illustration de la plante « Glycyrrhizae Radix Et Rhizoma » 25

Figure 22. Illustration de la plante « Radix saposhnikoviae » 25

Figure 23. Illustration de la plante « Rhizoma Atractylodis Macrocephalae » 26

Figure 24. Illustration de la plante « Forsythiae Fructus » 26

Figure 25. Illustration du chèvrefeuille et sa structure moléculaire 27

Figure 26. Illustration de la structure moléculaire de digitoxigenin. 28

Figure 27. Illustration de la structure moléculaire de Digitoxigenin en 3d. 28

Figure 28. Illustration de la structure moléculaire de f3-Eudesmol. 29

Figure 29. Illustration de la structure moléculaire de f3-Eudesmol en 3d. 29

Figure 30. Illustration de la structure moléculaire de Crocin. 30

Figure 31. Illustration de la structure moléculaire de Crocin en 3d. 30

Liste des tableaux

Tableau 1: L'interaction la plus importante de la liaison hydrogène entre les trois composés

naturels et la protéine de pointe du coronavirus (2019-nCoV). 28

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