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Influenza aviaire hautement pathogène à  H5N1. Bilan en Afrique de 2006 au 31 décembre 2007

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par Jean- Marc FEUSSOM KAMENI
Université Cheikh Anta Diop de Dakar - Doctorat d'état en sciences et médecine vétérinaires 2008
  

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DEUXIEME PARTIE

Bilan de l'Influenza Aviaire Hautement Pathogène en Afrique en 2006 et 2007.

Chapitre I - Cadre d'étude et approche méthodologique

I Cadre d'Étude

I.1 Milieu d'étude

L'étude a été faite sur tous les pays africains déclarés officiellement à OIE comme infectés par le virus H5N1 de janvier 2006 au 31 décembre 2007.

I.2 Repères géographiques des pays africains affectés par le virus H5N1

I.2.1 Bénin

Le Bénin est un pays d'Afrique Occidentale qui couvre une superficie de 112 622 km² en s'étendant sur 670 km, du fleuve Niger au nord à la côte atlantique au sud. Le Bénin comptait 7 513 946 habitants en 2006. Bordé au Sud par 125 km de plages atlantiques, le Bénin partage ses frontières avec le Togo à l'ouest, le Nigeria à l'est et le Niger et le Burkina Faso au nord (WIKIPEDIA, 2008).

Le Bénin est divisé en douze départements : Alibori ; Atacora ; Atlantique ; Borgou ; Collines ; Donga ; Couffo ; Littoral ; Mono ; Ouémé ; Plateaux ; Zou (WIKIPEDIA, 2008).

I.2.2 Burkina Faso

Le Burkina Faso, également appelé Burkina, anciennement Haute-Volta, est un pays d' Afrique de l'Ouest. Avec  274 200 km² de superficie et une densité de 44 hab./km², le Burkina Faso possède 3 192 km de frontières terrestres avec 06 pays : (Mali : 1 000 km ; Niger :628 km ; Côte d'Ivoire :584 km ; Ghana :548 km ; Bénin :306 km ; Togo : 126 km) ( WIKIPEDIA, 2006b).

Le Burkina Faso compte 45 provinces qui sont regroupées en 13 régions administratives (capitale entre parenthèses) : Boucle du Mouhoun (Dédougou), Cascades (Banfora), Centre (Ouagadougou), Centre-Est (Tenkodogo), Centre-Nord (Kaya), Centre-Ouest (Koudougou), Centre-Sud (Manga), Est (Fada N'Gourma), Hauts-Bassins (Bobo Dioulasso), Nord (Ouahigouya), Plateau-Central (Ziniaré), Sahel (Dori) et Sud-Ouest (Gaoua) ( WIKIPEDIA, 2006b).

I.2.3 Cameroun

La République du Cameroun est un pays d' Afrique centrale. Avec une superficie de 475 442 km² et sa population d'environ 16 380 000 habitants ( 2005), le Cameroun partage une frontière de 1 690 km avec le Nigeria, 1 094 km avec le Tchad, 797 km avec la République centrafricaine, 523 km avec la République du Congo, 298 km avec le Gabon et 189 km avec la Guinée équatoriale (WIKIPEDIA, 2006c).

La république du Cameroun compte dix provinces administratives qui sont les suivantes (avec leur chef-lieu) : Extême-Nord (Maroua), Nord (Garoua), Adamaoua (Ngaoundéré), Nord-Ouest (Bamenda), Sud-Ouest (Buea), Ouest (Bafoussam), Littoral (Douala), Centre (Yaoundé), Est (Bertoua) et Sud (Ebolowa) (WIKIPEDIA, 2006c).

I.2.4 Côte-d'Ivoire

La République de Côte-d'Ivoire est un pays d'Afrique de l'Ouest, ouvert sur le Golfe de Guinée, possédant 515 km Littoral et 3 110 km de frontières terrestres avec les pays suivants: (Liberia 716 km; Ghana 668 km; Guinée 610 km; Burkina Faso 584 km; Mali 532 km). Le pays couvre une superficie totale de 322 462 km2 (WIKIPEDIA, 2006d).

La Côte d'Ivoire est divisée en 19 régions administratives qui sont : Agnéby, Bafing, Bas-Sassandra, Denguélé, Dix-Huit Montagnes, Fromager, Haut-Sassandra, Lacs, Lagunes, Marahoué, Moyen-Cavally, Moyen-Comoé, N'zi-Comoé, Savanes, Sud-Bandama, Sud-Comoé, Vallée du Bandama, Worodougou et Zanzan (WIKIPEDIA, 2006d).

I.2.5 Djibouti

La République de Djibouti, dotée d'une superficie de 23.200 km², est située dans la Corne de l'Afrique et partage des frontières avec l'Érythrée au Nord, l'Éthiopie à l'Ouest et au Sud et avec la Somalie au Sud - Est. Elle possède une façade maritime longue de 370 km qui donne sur la Mer Rouge et le Golfe d'Aden (DJIBOUTI. République, 2006).

D'une population de 680 000 habitants (en 1998), Djibouti possède 508 km de frontières terrestres : ( Éthiopie 337 km ; Érythrée 113 km ; Somalie 58 km). La République de Djibouti est divisée en 5 circonscriptions administratives appelées districts : Djibouti, Ali-sabieh, Dikhil, Tadjourah et Obock (DJIBOUTI. République, 2006).

I.2.6 Égypte

L'Égypte, officiellement la République arabe d'Égypte, est un pays d' Afrique du nord-est. La partie nord-est du pays constituée par la péninsule du Sinaï se situe cependant en Asie. Dotée d'une superficie de 1.001.450 km², l'Égypte possède 2.450 km de côtes et deux façades maritimes, l'une sur la Méditerranée et l'autre sur la mer Rouge. Elle partage une frontière avec Israël (266 km) et la bande de Gaza (11 km) au nord-est, avec la Libye (1.115 km) à l'ouest et avec le Soudan (1.273 km) au sud (WIKIPEDIA, 2006e).

L'Égypte est divisé en vingt-six gouvernorats : Ad Daqahliyah, Al Bahr al Ahmar, Al Buhayrah, Al Fayyum, Al Gharbiyah, Al Iskandariyah, Al Isma'iliyah, Al Jizah, Al Minufiyah, Al Minya, Al Qahirah, Al Qalyubiyah, Al Uqsur, Al Wadi al Jadid, Ash Sharqiyah, As Suways, Aswan, Asyut, Bani Suwayf, Bur Sa'id, Dimyat, Janub Sina', Kafr ash Shaykh, Matruh, Qina, Shamal Sina' et Suhaj. (WIKIPEDIA, 2006e).

I.2.7 Ghana

Le Ghana est un pays d' Afrique Occidentale. Le pays possède 539 km de littoral et partage 2.093 km de frontières terrestres avec le Togo (877 km), la Côte d'Ivoire (688 km) et Burkina Faso (548 km). Avec une superficie de 238.540 km² et une population de 22.112.800 habitants (en 2005), le Ghana est divisé en 10 régions, elles-mêmes subdivisées en districts (183 au total) (WIKIPEDIA, 2007b).

Les régions du Ghana sont (chef-lieu entre parenthèses):Ashanti (Kumasi), Brong Ahafo (Sunyani), Centrale (Cape Coast), Haut Ghana oriental (Bolgatanga), Grand Accra (Accra) , Nord (Tamale), Occidentale (Sekondi-Takoradi),Orientale (Koforidua) , Haut Ghana Occidental (Wa),et Volta (Ho) (WIKIPEDIA, 2007b).

I.2.8 Niger

Le Niger est un pays d' Afrique de l'ouest, situé entre l' Algérie, le Bénin, le Burkina Faso, le Tchad, la Libye, le Mali et le Nigeria. Le pays a une superficie de 1.265 640 km² et une population de 11.058.590 hab. (en 2003) (WIKIPEDIA, 2006f).

Le Niger est divisé en 8 régions : Niamey, Agadez, Dosso, Maradi, Tahoua, Tillaberi, Zinder et Diffa. (WIKIPEDIA, 2006f).

I.2.9 Nigeria

Le Nigeria (ou Nigéria), situé dans le golfe de Guinée, est de loin le pays le plus peuplé d'Afrique avec plus de 140 millions d'habitants. Situé au bord du golfe de Guinée, le pays possède 4047 km de frontière terrestre, et 853 km de littoral. Il est bordé à l'ouest par le Bénin (773 km), à l'est par le Cameroun (1690 km), au nord par le Niger (1497 km), et par le Tchad au nord-est (84 km) (WIKIPEDIA, 2006g).

Le pays comprend en un territoire et 36 États  : Territoire de la capitale fédérale du Nigeria, où se trouve la capitale, Abuja ; et les États : État d'Abia, État d'Adamawa, État d'Akwa Ibom, État d'Anambra, État de Bauchi, État de Bayelsa, État de Benue, État de Borno, État de Cross River, État de Delta, État d'Ebonyi , État d'Edo, État d'Ekiti, État d'Enugu, État de Gombe, État d'Imo, État de Jigawa, État de Kaduna, État de Kano, État de Katsina, État de Kebbi, État de Kogi, État de Kwara, État de Lagos, État de Nassarawa, État de Niger, État d'Ogun, État d'Ondo, État d'Osun, État d'Oyo, État de Plateau, État de Rivers, État de Sokoto, État de Taraba, État de Yobe et l' État de Zamfara (WIKIPEDIA, 2006g).

I.2.10 Soudan

Le Soudan est un pays de l'est de l' Afrique, le plus grand du continent en superficie. Bordé par la Libye et l'Égypte au nord, la mer Rouge, l' Érythrée et l'Éthiopie à l'est, le Kenya, l'Ouganda et la République démocratique du Congo au sud, la République Centrafricaine et le Tchad à l'ouest. Le pays a une superficie de 2.505.810 km² et une population de 36.230.000 habitants (WIKIPEDIA, 2006h).

Le pays compte : 26 états (dits « wilayat », singulier - wilayah) : A'ali zéro, Al Ahmar, Al Buhayrat, Al Jazirah, Al Khartum, Al Qadarif, Al Wahdah, Al Abyad, Al Azraq, cendre Shamaliyah, Al Jabal, Al Istiwa'iyah, Al Ghazal, Gharb Darfur, Gharb Kurdufan, Janub Darfur, Janub Kurdufan, Junqali, Kassala, Nahr de Bahr d'Al de zéro de zéro de Bahr de Gharb de Gharb Bahr zéro, Al Ghazal, Shamal Darfur, Shamal Kurdufan, Al Istiwa'iyah, Sinnar, Warab de Shamal Bahr de Sharq (WIKIPEDIA, 2006h).

I.2.11 Togo

Le Togo est un pays d' Afrique de l'Ouest ayant des frontières communes de 7 580 km avec le Bénin à l'est, le Burkina Faso au nord, et le Ghana à l'ouest. Sa façade sud est ouverte sur le golfe du Bénin sur 50 Kilomètres. Le pays à une superficie de 56.600 km² et comptait environ 5 090 000 d'habitants en 2004.

Le Togo est divisé en cinq régions administratives : Maritime (Lomé), Plateaux, (Atakpamé), Centrale (Sokodé), Kara (Kara) et Savanes (Dapaong). (WIKIPEDIA, 2007c).

II Méthodologie

II.1 Période d'étude

L'étude a été réalisée de janvier 2006 au 31 décembre 2007.

II.2 Approche méthodologique

L'approche méthodologique utilisée pour la conduite de notre étude s'est articulée autour des points suivants : Recherches documentaires et bibliographiques ; Identification et classification des sources d'information ; Prise de contact avec les comités nationaux de lutte contre l'influenza aviaire, certains responsables des centres de recherche et organisations (Envoi des courriers par mail ; Appels téléphoniques ; descentes sur le terrain.) ; inscription aux dépêches et bulletins de veille - influenza aviaire, analyse des résultats obtenus.

Les données utilisées pour établir les bilans nationaux sont communiquées par les organisations internationales de la santé humaine et animale c'est-à-dire, l'organisation mondiale de la santé animale (OIE), l'organisation des nations unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) et l'organisation mondiale de la santé (OMS) ainsi que les informations diffusées par l'UNICEF et le système ProMED-mail. A travers une veille informationnelle sur Internet, plusieurs autres sources d'informations (Sites des journaux, moteurs de recherche, autres bulletins de veille, sites Internet dédiés à l'influenza aviaire) ont été consultées dans différents pays et autres. Après avoir présenté les principales sources de données, nous exposerons les bilans nationaux selon l'ordre alphabétique des pays.

II.3 Origine des données

II.3.1 OIE

II.3.1.1 Présentation

L'OIE est une organisation intergouvernementale qui compte 165 pays membres. Son rôle est de recenser les maladies animales déclarées par les pays adhérents et d'en diffuser l'information. Elle est à l'origine d'un certain nombre de normes et de règles sanitaires internationales qui font référence dans le domaine de la santé animale et du commerce. Elle émet également des recommandations en situation de crise (DELVALLEE, 2004).

II.3.1.2 Collecte et diffusion d'informations sanitaires

Un des rôles de l'OIE est de collecter et diffuser l'information zoosanitaire mondiale. La collecte de l'information se fait par le biais des rapports d'urgence et des rapports de suivis émis par les pays infectés. Les rapports d'urgence sont intégrés dans le système d'alerte précoce de l'OIE, comme schématisé sur la figure 7.

Pays indemne

Pays indemne

Pays infecté

Pays membres de l'OIE et

Organisations internationales intéressées

Bureau central de l'OIE

Site Internet de l'OIE

Liste de diffusion électronique

Rapport d'urgence sous 24 heures

Figure 7 : Système d'alerte précoce de l'OIE, (OIE, 2007b)

Les rapports précisent le nombre de foyers signalés pour chaque maladie, avec le nombre d'animaux malades ou morts. Ils présentent également diverses informations concernant la méthode de diagnostic utilisée et les mesures de prophylaxie et de contrôle de la maladie mises en oeuvre, ainsi que le nombre d'animaux abattus ou vaccinés (OIE, 2007b).

II.3.1.3 Rapport d'urgence

Dans la démarche de notification des maladies à l'OIE, les autorités vétérinaires doivent adresser au bureau central de l'OIE, une notification par l'intermédiaire du délégué de leur pays, sous forme de télégramme, télécopie ou courrier électronique, dans les 24 heures (OIE, 2007b) :

a. de l'apparition pour la première fois d'une des maladies et/ou d'une des infections inscrites sur la Liste de l'OIE dans un pays, une zone ou un compartiment ;

b. de la réapparition d'une des maladies et/ou d'une des infections inscrites sur la liste de l'OIE dans un pays, une zone ou un compartiment, suite à la notification de l'extinction du foyer de ladite maladie ou de ladite infection ;

c. de l'apparition pour la première fois de toute nouvelle souche d'un agent pathogène inscrit sur la liste de l'OIE dans un pays, une zone ou un compartiment ;

d. de l'augmentation, soudaine et inattendue, de la distribution, de l'incidence, de la morbidité ou de la mortalité caractérisant une maladie de la liste de l'OIE prévalant dans un pays, une zone ou un compartiment ;

e. de l'apparition d'une maladie émergente à morbidité ou mortalité significative, ou à potentiel zoonotique ;

f. de toute constatation de modifications dans l'épidémiologie d'une des maladies de la liste de l'OIE (y compris dans le type de l'hôte, le pouvoir pathogène et la souche de l'agent pathogène), en particulier si cette constatation a des implications zoonotiques ;

II.3.1.4 Rapport de suivi

Selon, l'article 1.1.2.3. du Code sanitaire pour les animaux terrestres (2007) :

· Un rapport hebdomadaire, par télégramme, télécopie ou courrier électronique, à la suite d'une notification effectuée en application du point 1 ci-dessus, afin de fournir des informations complémentaires sur l'évolution de l'incident ayant justifié la déclaration d'urgence ; l'envoi de rapports hebdomadaires se poursuivra jusqu'à ce que l'incident ait été résolu soit par l'éradication de la maladie, soit par son passage à l'état endémique : le pays satisfera alors à ses obligations en faisant parvenir à l'OIE les rapports semestriels en application du point 3 ci-dessous ; dans tous les cas, un rapport final relatif à l'incident devra être fourni ;

· Un rapport semestriel sur l'absence, ou la présence, et l'évolution des maladies de la Liste de l'OIE ainsi que sur les faits ayant une importance épidémiologique pour les autres pays ;

· Un rapport annuel concernant toute autre information significative pour les autres pays.

Ainsi pour l'influenza aviaire, l'OIE a mis à disposition un portail Internet (http://www.oie.int/fr/info_ev/fr_AI_avianinfluenza.htm) dédiée à cette maladie pour les informations suivantes : point sur la situation de l'Influenza Aviaire chez les Animaux (Type H5), la chronologie du virus H5N1, les communiqués de presse et mise à jour des rapports d'urgence et cartographie des foyers.

II.3.2 FAO

II.3.2.1 Missions générales.

La FAO sert de réseau de connaissances spécialisées dans le domaine de l'élevage et de l'agriculture. Elle met à profit des compétences extrêmement diverses afin de recueillir, analyser et diffuser sur son site Internet et sur des supports papiers des données utiles au développement. Ses connaissances techniques sont éprouvées sur le terrain dans des projets de développement rural et de lutte contre la faim. Les actions de terrain de la FAO sont notamment financées par des pays industrialisés et des banques de développement (FAO, 2004a).

II.3.2.2 L'unité spéciale « influenza aviaire »

Une unité spéciale consacrée à l'influenza aviaire a été créée par la FAO dès le tout début de l'épizootie sud asiatique, soit en janvier 2004. Cette unité est chargée de suivre l'évolution de la situation, de dispenser une assistance technique dans tous les domaines liés à l'épizootie et de faciliter la communication avec l'OMS et l'OIE. Du 27 janvier 2004 au 31 mai 2007, elle a émis 46 bulletins d'information.

II.3.2.3 Suivi de l'épizootie

Le système FAO Avian Influenza Disease Emergency news, plus simplement appelé FAO AIDE news, est un système d'information sur l'influenza aviaire qui a été initialement développé pour les représentants de la FAO présents sur le terrain. Ce système d'information, qui réunit des données provenant de sources officielles et de sources non officielles telles que la presse et les médias locaux, a été conçu dans le but de maintenir les échanges sur les informations circulant au sujet de l'épizootie d'influenza aviaire. Les retombées ayant fait suite à la première publication du bulletin de la FAO AIDE news étant extrêmement positives, il a été décidé de le rendre accessible à un public plus large (FAO AIDE news, 2004). Il a donc été diffusé sur le site Internet de la FAO [http://www.fao.org/ag/AGA/AGAH/EMPRES/tadinfo/e_tadAVI.htm].

II.3.2.4 Complémentarité des deux agences de santé animale

Les données diffusées par l'OIE, c'est à dire les données contenues dans les rapports officiels émis par les pays atteints, et les données diffusées par la FAO par l'intermédiaire de la FAO AIDE news, c'est à dire les données officielles et non officielles relatives à l'épizootie d'influenza aviaire en Afrique, sont tout à fait complémentaires.

II.3.3 OMS

II.3.3.1 Réseau de surveillance de la grippe

L'OMS a développé, depuis 1947, un programme mondial de contrôle et de surveillance de la grippe qui vise à coordonner les actions globales et nationales, à centraliser et analyser les données recueillies afin de gérer les épidémies annuelles et de préparer une éventuelle pandémie. Le réseau de surveillance de la grippe de l'OMS est extrêmement développé. Ainsi 112 institutions réparties dans 83 pays sont reconnues comme des centres de référence pour la grippe. L'activité principale de ce réseau est la compilation d'informations en vue de la préparation annuelle d'un vaccin contre la grippe humaine adapté aux souches circulantes (OMS, 2006a).

Ces informations proviennent de l'analyse des isolats d'influenzavirus collectés dans les différents pays membres. Ce réseau est également un système d'alerte précoce qui avertit les pays en cas d'émergence de nouvelles souches ayant un potentiel pandémique ou un degré de pathogénicité inhabituel. C'est dans ce cadre que les cas humains d'influenza aviaire sont recensés par l'OMS qui réalise l'analyse antigénique des isolats (FERGUSON et al., 2004).

II.4 Utilisation des données

Pour faire le bilan, au 31 octobre 2007, de l'épizootie d'influenza aviaire dans chaque pays atteint nous avons tantôt utilisé les données de l'OIE, tantôt les données de la FAO et tantôt les deux. Pour retracer l'évolution spatio-temporelle de l'infection au sein de chaque pays nous avons fait le choix de nous fier aux données de l'OIE, sauf cas particulier. Pour évaluer les pertes animales liées à l'épizootie nous avons fait le choix de tenir compte des données de la FAO. En effet, utiliser les données de l'OIE conduirait à une sous-estimation des pertes car certains pays mentionnent uniquement dans leurs rapports le nombre d'animaux morts ou abattus au sein des foyers d'infection, et non le nombre d'animaux abattus dans la zone de protection. En ce qui concerne le mode d'introduction et de propagation de l'infection c'est une donnée qui, quand elle existe, devrait, en toute rigueur, figurer dans les rapports officiels fait à l'OIE. On constate pourtant que bien souvent c'est la FAO qui la communique. Pour décrire les méthodes de lutte mises en oeuvre dans les différents pays nous nous sommes basés sur les données diffusées par l'OIE que nous avons complétées et étayées par les données communiquées par la FAO. Une triangulation a été faite avec d'autres sources d'informations fiables des institutions nationales, régionales africaines (Thèses de l'EISMV, rapports de mission, outils de sensibilisation) ou des réseaux informels d'information. Ceci pour apprécier les impacts socio-économiques, le rôle de la formation et des outils de sensibilisation et de communication.

II.5 Estimation du nombre de cas humains

Pour faire le bilan des cas d'infection humaine par l'influenzavirus H5N1, en Afrique entre le 1er janvier 2006 et le 31 décembre 2007, nous avons pris en compte les cas recensés par l'OMS, c'est à dire les cas officiellement confirmés par les laboratoires de référence pour l'influenza aviaire hautement pathogène.

II.6 Saisie et traitement des données

La saisie des données et analyse a été effectuée sous le tableur Microsoft Office EXCEL® 2003 et le logiciel Epi Info 3.4.1 ®. Egalement, ces programmes nous ont permis de traiter les données chiffrées extraites des différents bulletins (OIE, FAO, OMS), d'établir les tableaux et les figures tout au long du travail.

L'effectif des foyers aviaires de chaque pays a été dénombré via les rapports de notification immédiate ou de suivi. Il en a été de même pour les cas humains, de pertes animales, de pertes économiques et les besoins en formation.

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"Ceux qui vivent sont ceux qui luttent"   Victor Hugo