|
REPUBLIQUE DE CÔTE D'IVOIRE
Union-Discipline-Travail
Ministère de l'Enseignement Supérieur et de
la Recherche Scientifique
UPR de Génétique
Année Universitaire
2020-2021
MEMOIRE
Présenté pour l'obtention du
Diplôme de MASTER de
Biotechnologie, Biosécurité et
Bioressources de l'Université
Félix
HOUPHOUET-BOIGNY
Spécialité : Génétique et
Amélioration des Espèces
DJEZOU KOUADIO MELITON
ANALYSE DE LA DIVERSITÉ DES
CHAMPIGNONS
MYCORHIZIENS À ARBUSCULES ASSOCIÉS AU MAÏS
DANS
QUATRE ZONES DE PRODUCTION EN CÔTE D'IVOIRE
Numéro d'ordre
1061/2021
Soutenu publiquement Le 6 octobre 2021
Composition du jury
M. FATOGOMA Sorho Professeur Titulaire UFHB
Président
M. TIECOURA Kouakou Maître de Conférences
UFHB Superviseur
M. KOUASSI Abou Bakari Maître-Assistant UFHB
Directeur
M. SOKOURI Didier Paulin Maître de
Conférences UFHB Examinateur
DEDICACE
Ce mémoire est dédié :
? A mon grand-père PAPA NOUVEAU pour
ses conseils et prières.
? A ma mère AMESSAN GNAHON NATHALIE,
brave femme pour son amour et ses prières
? A tous mes frères et soeurs pour le
soutien moral
II
REMERCIEMENTS
Le présent travail est le fruit de la collaboration
franche entre le Laboratoire de Biotechnologie, Agriculture et Valorisation des
Ressources Biologiques de l'Unité de Formation et de Recherche (UFR)
Biosciences de l'Université Félix HOUPHOUET-BOIGNY, l'Institut
Africain pour le développement économique et social (INADES) et
le Fonds Interprofessionnel pour la Recherche et le Conseil Agricole
(FIRCA).
Nombreuses sont les personnes qui, de près ou de loin,
ont contribué à la réalisation de ce travail et à
qui je voudrais rendre hommage à travers ces quelques lignes.
Au Professeur KOUAMELAN Essetchi Paul, Doyen de l'UFR
Biosciences, pour avoir accepté mon inscription au sein de cette UFR.
Au Professeur N'GUETTA Assanvo Simon-Pierre, de l'Unité
Pédagogique et de Recherche (UPR) de Génétique de
l'Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY, Directeur du
Laboratoire de Biotechnologie, Agriculture et Valorisation des Ressources
Biologiques qui a accepté mon inscription en MASTER
Au Dr SOKOURI Didier Paulin, Maître de
Conférences à l'Unité Pédagogique et de Recherche
(UPR) de Génétique de l'Université Félix
HOUPHOUËT-BOIGNY pour ses encouragements
Je manifeste ma profonde gratitude au Dr KOUASSI Abou
Bakari, Maître-Assistant à l'UPR de
Génétique de l'Université Félix
HOUPHOUËT-BOIGNY, Directeur de ce travail. Vous avez
énormément contribué à la réalisation de ce
travail. En plus de vos qualités scientifiques, vos soutiens ont
été importants pour moi. .
J'exprime ma profonde reconnaissance au Dr DROH Germain,
Assistant à l'UPR de Génétique de l'Université
Félix HOUPHOUËT-BOIGNY, pour m'avoir suivi au quotidien. Qu'il soit
remercié pour tout le soutien. Merci infiniment Docteur d'avoir choisi
de travailler avec moi sur votre projet dénomé «
Promotion du biocompost associé aux champignons mycorhiziens
à arbuscules (CMA) dans la production du maïs (Zea mays) en
Côte d'Ivoire ». Ce projet a été
financé par le Fond Compétitif pour l'Innovation Agricole Durable
(FCIAD) sous la référence du contrat N° 18 62
/FIRCA/INADES/FDCI-FCIAD/2018. Que Dieu vous le rende au centuple.
De même, je manifeste également ma profonde
gratitude au Dr TIECOURA Kouakou, Maître de Conférences à
l'UPR de Génétique pour les susgestions et sa
disponibilité en tant que superviseur de ce mémoire
Enfin, j'adresse mes vifs remerciements à tous ceux qui
m'ont apporté leur concours et que je ne peux citer individuellement
III
TABLE DES MATIÈRES
DEDICACE I
REMERCIEMENTS II
TABLE DES MATIÈRES III
SIGLES ET ABREVIATIONS V
LISTE DES FIGURES VI
LISTE DES TABLEAUX VII
Introduction 1
I.- Synthèse bibliographique 4
I.1-Identité et ressource du maïs
4
I.1.1- Origine et morphologie du maïs 4
I.1.3- Contraintes liées à la culture du
maïs 5
I.2- Situation des champignons mycorhiziens dans le monde
vivant 5
I.2.1- Champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA)
5
I.2.1.1- Origine et distribution des CMA 5
I.2.1.2- Classification des champignons mycorhiziens
à arbuscules 6
I.2.2- Différentes symbioses mycorhiziennes
6
I.2.3- Cycle de développement des champignons
mycorhiziens à arbuscules 8
I.2.4- Bénéfices de la symbiose
mycorhizienne à arbuscules 10
I.2.5- Effet des facteurs écologiques sur les
communautés des CMA 12
II- Matériels et méthodes 13
II.1- Site d'échantillonnage 13
II.2- Matériel 13
II.2.1- Matériel végétal
13
II.2.2- Matériel fongique 13
II.2.3- Matériel technique et chimique
13
II.3- Méthodes 14
II.3.1- Méthode de prélèvement des
échantillons de sols 14
II.3.2- Détermination des propriétés
physico-chimiques des échantillons de sols 17
II.3.2- Isolement des spores de CMA 18
II.3.3- Détermination de l'abondance des spores
dans chaque échantillon de sol 18
II.3.4- Analyse de la diversité des spores et
identifications des champignons mycorhiziens 18
II.3.5- Analyse statistique des données de la
diversité des spores 19
III-RESULTATS 20
III.1-Propriétés chimiques des sols des
différents sites d'échantillonnage 20
III.2- Densités moyennes des spores de champignons
mycorhiziens à arbuscules 20
III.2.1- Densités moyennes des spores de CMA selon
leurs tailles 23
IV
III.2.2- Densités moyennes de spores de CMA selon
leurs couleurs 26
III.3- Diversité des communautés de
champignons mycorhiziens à arbuscules 33
III.3.1- Familles de champignons mycorhiziens à
arbuscules dans les échantillons de sol 33
III.3.2- Genres de champignons mycorhiziens à
arbuscules dans les échantillons des sols 33
IV- Discussion 38
V- Conclusion et perspectives 42
V.1- Conclusion 42
V.2- Perspectives 43
REFFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 42
Annexes 52
V
SIGLES ET ABREVIATIONS
ANADER : Agence Nationale d'Appui au Développement
Rural
CMA : Champignons mycorhiziens à arbuscules
Cmol : Centimole
CNRA : Centre National de Recherche Agronomique
FCIAD : Fond Compétitif pour l'Innovation Agricole
Durable
FIRCA : Fonds Interprofessionnel pour la Recherche et le
Conseil Agricole
INADES : Institut Africain pour le Développement
Economique et Social
INVAM : Collection Internationale de Cultures de Champignons
Mycorhiziens à Vésicules
et à Arbuscules (International Culture Collection of
Vesicular - Arbuscular Mycorrhizal Fungi)
Km : Kilomètre
Mm : millimètre
PNIA : Plan National d'investissement Agricole
PVLG : Polyvinyle glycérol
PPA : Prepenetration apparatus
UFHB : Université Félix Houphouët-Boigny
UPR : Unité de Pédagogie et de Recherche
VI
LISTE DES FIGURES
Figure 1: Phylogénie actuelle des Glomeromycota 7
Figure 2: Les principales symbioses mycorhiziennes et leurs
structures inter et intra racinaires 11
Figure 3: Localisation des zones de prélèvement des
échantillons de sol sur les cartes administratives
des régions d'étude 16
Figure 4: Abondances
relatives (%) des spores de couleur jaunâtre, blanchâtre,
marron-clair et
marron-fonce dans les échantillons de sols des
localités prospectées 31
Figure 5: Spores de champignons
mycorhiziens à arbuscules observées au microscope optique
(grossissement 40x) dans du polyvinyle glycerol 36
VII
LISTE DES TABLEAUX
Tableau I : Coordonnées géographiques des sites
de prélèvement d'échantillon de sol des quatre zones
d'échantillonnage 15
Tableau II :
Caractéristiques physico-chimiques des échantillons de sols des
zones prospectées .. 231 Tableau III : Densités moyennes des
spores de champignons mycorhiziens à arbuscules (nombre de
spores/100g de sol) dans les échantillons de sols des
zones prospectées 22
Tableau IV : Densités moyennes de spores
(nombre de spores/100g de sol) par site de prélèvement
des échantillons de sol dans les différentes
localités prospectées 24
Tableau V : Densités moyennes
des spores (Nombre de spores / 100g de sol) de 200, 90, et 45um de
diamètre dans les échantillons de sol des zones
prospectées 25
Tableau VI : Densités moyennes des spores
(nombre de spores/100g de sol) de 200, 90 et 45um de
diamètre dans les échantillons de sol des zones
prospectées 27
Tableau VII : Densités moyennes (nombre de
spores / 100g de sol) des spores de CMA de couleur
28
Tableau VIII : Densités moyennes (nombre de
spores / 100g de sol) des spores de couleur jaunâtre, blanchâtre,
marron-clair et marron-foncé par site de prélèvement des
échantillons de
sol des zones prospectées 32
Tableau IX : Proportions des genres de CMA dans les
echantillons de sol des zones prospectees 35
INTRODUCTION
1
| 
