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Etude des facteurs de risques du choléra

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par Doudou TUBAYA
Université de Lubumbashi - DIPLOME D'etudes approfondies en santé publique,option epidémiologie et médecine préventive 2007
  

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II. MATERIELS ET METHODES

1.1. MATERIELS

Notre étude porte sur la période allant du premier Janvier au trente et un Mars de l'année 2008.Durant cette période, nous nous sommes penchés sur 2758 cas de choléra recrutés à Lubumbashi.

1.2. METHODES

Pour apprécier le poids de chaque facteur de risque sur la survenue du cholera à Lubumbashi, nous avons choisi une étude analytique cas- témoin comme type d'étude (42). 2.2.1. Facteurs de risque

Sur base de la revue de la littérature, nous avons retenu dans notre étude les facteurs de risque ci-après (3, 24,29) :

Déterminants biologiques

Donnant une appréciation sur l'identification du sujet (3,24) :

> Age ;

> Sexe (masculin ou féminin).

Déterminants économiques

Donnant une appréciation du standing de vie du sujet :

> Profession ou occupation (6) ;

> Niveau d'étude (11,37) ;

> Ration journalière pour faire allusion aux revenus (34,38) ; > Nombre de pièces par maison.

Déterminants démographiques et sociologiques

Ces déterminants donnent une appréciation sur la promiscuité et le statut social du

sujet (6,11, 28, 29, 32, 35,37) :

> Adresse pour appréhender le milieu dans lequel évolue le sujet ;

> Nombre de personnes par pièces ;

> Condition de séjour ;

> Notion de voyage pour chercher l'éventualité d'une importation de la maladie ;

> Circonstance de survenue faisant évoquer la notion de rassemblement ou le comportement du sujet lors d'un deuil, d'une fête, d'une prière, restaurant et autres.

Déterminants géographiques et écologiques

Il s'agit des renseignements sur l'état des lieux ou les conditions hygiéniques du sujet (6, 28, 29, 33,39) :

> Eau de boisson :

· Source d'approvisionnement de l'eau de boisson : robinet, puit, rivière, «Kishimpo », eau conditionnée en sachet ou en bouteille (6, 11, 26, 29, 30,40) ;

· traitement de l'eau par ébullition, filtration ou chloration (31) ;

· système de conservation de l'eau pour vérifier le mode de contamination de l'eau (19).

> Se laver les mains à l'eau courante avec du savon avant de manger ou après les selles (19) ;

> Aliments (fruits, tubercules, légumes ou autres) consommés, soient crus ou cuits, nettoyés ou non (6,19, 27, 29, 30, 36,40) ;

> Existence d'une latrine voire l'état de propreté (19, 26, 28,38).

Déterminants sanitaires

Dévoilant l'organisation du système sanitaire (28) :

> Structure dans laquelle les cas sont pris en charge (centre de traitement de choléra) ;

> Zone de santé abritant les structures ci - haut évoquées.

Déterminants anthropologiques :

> Religion (chrétienne, musulmane ou autre) ;

> Notion de contage liée aux habitudes telles que mode de salutation, la visite des malades, la manipulation des habits, des aliments ou de l'eau souillée par les selles ou vomissures d'un patient cholérique (19,26,33,36,40).

Déterminant Historique

Antécédent de choléra

2.2.2. Critères d'inclusion :

Les cas

En dehors des cas index ayant bénéficié d'un diagnostic biologique pour

confirmer le cholera, tous les cas de notre échantillonnage ont été retenus sur base de critères ci- après :

- La définition de cas selon l' OMS (13) ;

- Tout cas de cholera ayant fait l'objet d'une admission au CTC Katuba et Kenya, ayant marqué son accord de participation après la sortie du CTC et dont le nom est repris dans le registre des malades ;

- Seuls sont pris en compte les patients résidant à Lubumbashi.

Les témoins

- Un bon moyen de sélectionner un témoin consiste à questionner une personne de même

sexe dont la différence d'âge n'excède cinq ans, habitant dans une parcelle voisine ou sur la même avenue et qui a accepté volontiers l'interview (14) ;

- Sujet sans antécédent de cholera ou de diarrhée quelconque depuis le début de l'épidémie ;

- Sujet résidant à Lubumbashi.

2.2.3. Critères d'exclusion

Les critères d'exclusion ont été :

Les cas

- Tout sujet ne répondant pas à la définition de cas du cholera selon l'OMS ;

- Tout sujet incapable ou ayant refusé de répondre au questionnaire (petits enfants, cas grave, malade décédé) ;

- Tout sujet en transit dans la ville.

Les témoins

- Tout sujet avec une description des symptômes évoquant une suspicion du cholera ou de diarrhée ;

- Tout sujet incapable ou ayant refusé de répondre au questionnaire d'enquête ; - Tout sujet non résident à Lubumbashi.

2.2.4. Echantillonnage

Nous avons appliqué un échantillonnage stratifié proportionnel au premier degré puis, un échantillonnage systématique au second degré(42,43) .La taille de l'échantillon a été calculée à l'aide de la fonction stat calc du logiciel épi info version 3.3.2 en tenant compte des paramètres suivants (33) :

- seuil de signification : 5% ;

- proportion des non malades pour un facteur étudié : 50% ;

- proportion des malades pour un facteur étudié : 60% ;

- puissance : 80% ;

- beta :20 %;

- intervalle de confiance:95%;

- un cas pour un témoin.

De ce qui précède, la taille de l'échantillon est constituée de 407 cas de cholera et 407 témoins. Ce qui fait ressortir un total de 814 sujets examinés. S'agissant d'une enquête rétrospective, il n'y a pas eu des données manquantes car, nous avons eu la possibilité de remplacer automatiquement un cas par un autre qui se trouve dans les mêmes conditions.

2.2.5. Sources d'information

La réalisation de notre étude a eu pour sources d'information : - Registre des malades des CTC ;

- Questionnaire d'enquête ;

- Rapport du quatrième bureau de surveillance épidémiologique de l'IPS /Katanga.

Dans cette perspective de recueil d'informations de terrain,nous avons recruté cinq étudiants de première licence de l'école de santé publique de l'Université de Lubumbashi. Une formation a été organisée à leur intention pour la compréhension de chaque item de notre questionnaire d'enquête (voir annexe 1) .Ce questionnaire a été pretesté dans la zone de santé de Kenya et corrigé pour l'adapter en fonction des difficultés rencontrées sur terrain .Un calendrier a été élaboré pour la descente sur terrain proprement dite. Une supervision ainsi qu'un audit de la qualité des données ont été assurés quotidiennement pour garantir, la fiabilité des données. Une collation a été remise à chaque enquêteur pour soutenir l'effort de terrain.

2.2.6. Analyse des données

Après compilation et encodage des données, l'analyse a été effectuée à l'aide du logiciel epi-info version 3.3.2. en recourant aux mesures d'association suivantes (42) :

> Rapport de cote s'appelle aussi odds ratio.

Le lien entre l'exposition au facteur de risque et le cholera est d'autant plus fort que la valeur odds ratio est élevée (force de l'association) .Si OR est égal à 1 donc le facteur étudié est sans effet chez les cas ; si OR est supérieur à 1 donc le facteur étudié est un facteur de risque. Par contre si OR est inférieur à 1 donc le facteur étudié est un facteur de protection.

> Intervalle de confiance à 95 %

Si la valeur 1 n'est pas comprise dans l'intervalle de confiance 95% de l'odds ratio au seuil 5%, l'association est statistiquement significative entre le facteur étudié et le cholera (jugement de signification).

~ p value désigne le degré de signification

Si p value est inférieur à 0,05, la différence est significative.

Pour certaines données, nous avons établi des tableaux ou graphiques pour une meilleure compréhension à l'aide du tableur excel.

Etant donné la pluralité des variables sous examen, la détermination de la qualité d'association entre les facteurs de risque et le résultat du diagnostic a été réalisée en recourant au tableau de contingence et par application du test de khi deux. Dans le test précité, l'hypothèse nulle demeure l'indépendance ou l'absence d'influence ou d'association entre les différents facteurs de risque sous examen et le résultat binaire du diagnostic.

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"Des chercheurs qui cherchent on en trouve, des chercheurs qui trouvent, on en cherche !"   Charles de Gaulle