3.
Données biologiques sur le VIH-1
3.1. Le rétrovirus, le cycle viral
et le tropisme cellulaire
3.1.1. Biologie du VIH-1
Le virus de l'immunodéficience humaine (VIH-1) est
l'agent étiologique du syndrome de l'immunodéficience acquise
(SIDA).
Le VIH-1 appartient au groupe des lentivirus, famille de virus
à acide ribonucléique (ARN), appartenant à la classe des
rétrovirus. Les lentivirus sont à l'origine de maladies à
évolution lente et de syndromes d'immunodéficience. Ils ont
souvent un tropisme particulier pour le système nerveux
central36.
Les rétrovirus peuvent transcrire leur ARN
génomique monocaténaire en ADN bicaténaire grâce
à une enzyme, la transcriptase inverse. Les rétrovirus ne peuvent
pas se répliquer en l'absence d'une cellule hôte dont ils
utilisent le matériel de réplication. Le génome des
rétrovirus contient trois gènes majeurs, gag
(antigène de groupe), pol (polymérase) et env
(enveloppe). Ces gènes codent les précurseurs
polypeptidiques des protéines majeures et structurelles des
rétrovirus. Dans le cas du VIH, le gène env code les
deux glycoprotéines d'enveloppe, l'enveloppe la plus extérieure,
gp120 et la glycoprotéine transmenbranaire gp41, dérivée
d'une protéine précurseur, la gp160. Les composant codés
par le gène gag incluent les protéines de la capside du
nucléoïde (du core), p55, p40, p24 (antigènes de la
capside), p17 (protéine de la matrice), p7 (nucléocapside), p9,
p6 (protéines de l'ARN). Les protéine importantes codées
par pol sont les protéines des enzymes virales, p66 et p51
(pour la transcriptase inverse), p11 (pour la protéase) et p32 (pour
l'intégrase). Les gènes accessoires portés par le VIH-1
incluent tat, rev, nef, vif, vpr
et vpu. Le gène tat (transcripteur) produit une
protéine de régulation qui active la rétrotranscription et
la synchronisation de la production virale. Le gène rev
(régulateur de l'expression des virions) code une protéine de
régulation qui active la transcription de l'ARN viral, le gène
nef (negative regulatory factor) produit une protéine de
régulation agissant sur la réplication et l'infectiosité
du virus. Les gènes vif, vpr et vpu codent
des protéines jouant un rôle dans l'infectiosité
générale et les effets pathologiques des virus37-39
(figure 2: Diagramme schématique du génome du VIH-1).
Il existe trois groupes de rétrovirus, les
spumavirus, qui ne sont associés à aucune maladie
connue; les oncovirus, a l'origine de sarcomes ou de leucémies,
et les lentivirus, auxquels appartiennent les VIH-1 et VIH-2 ainsi que
des virus responsables de syndromes d'immunodéficience chez le singe
(SIV : simian immunodeficiency virus), les bovins (BIV : bovine
immunodeficiency virus), le chat (FIV : feline immunodeficiency virus) et
la souris (MIV : murine immunodeficiency virus).
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