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Analyse de la diversité des champignons ectomycorhiziens et des ectomycorhizes du raisinier bord de mer (Coccoloba Uvifera l.) le long d'un gradient de salinité en forêt littorale

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par Raymond AVRIL
Université des Antilles et de la Guyane - Master 2 2009
  

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Résumé

La diversite morphologique et genetique des champignons ectomycorhiziens et des ectomycorhizes de Coccoloba uvifera a ete etudiee le long dÕun gradient de salinite (15ä -2ä) sur la plage de Bois Jolan en Guadeloupe. Ë proximite de lÕeau de mer, les arbres sont de petites tailles et rabougris alors que les arbres eloignes sont de plus grandes tailles avec un houppier bien developpe sous lequel proliferent des plantules issues de graines. Six especes de sporophores (Amanita arenicola, Inocybe littoralis, Inocybe xerophytica Cantharellus cinnabarinus, Scleroderma bermudense et Russula cremeolilacina) ont ete repertoriees en milieu peu sale et seulement une espece (S. bermudense) en milieu sale. De meme, neuf morphotypes ectomycorhiziens (MT), correspondant à six ribotypes, ont ete repertories en milieu peu salé dont trois en milieu sale. Le polymorphisme de longueur des fragments de restriction et le sequencage de la region ITS de lÕADNr nucléaire ont permis de relier des sporophores aux MT et de montrer que des arbres -meres et leurs plantules ont partage un cortège ectomycorhizien commun. Quatre sporophores (C. cinnabarinus, I. xerophytica, S. bermudense et R. cremeolilacina ) ont ete relies à des MT, deux sporophores (A. arenicola et I. littoralis) etaient absents des racines de C. uvifera et deux MT identifiés (Tomentella sp1 et Tomentella sp2) nÕont pas genére de sporophores. Les arbres -meres et leurs plantules ont eu en commun trois champignons (S. bermudense, Tomentella sp1 et Tomentella sp2) presents en majorite sur leurs racines. Les résultats de cette etude ont montre que (i) la salinite a affecte la diversite des champignons ectomycorhiziens (ii) les sporophores ont ete de mauvais indicateurs de diversite (iii) des reseaux ectomycorhiziens potentiels pourraient relier les arbres -meres et leurs plantules.

Mots clés : Arbres-meres, Plantules, PCR-RFLP, Sequencage, ITS, Reseaux mycorhiziens communs

Abstract :

The morphological and molecular diversity of ectomycorrhizal fungi and ectomycorrhizae on Coccoloba uvifera were studied along a salinity gradient ranged from 15%o to 2ä at Bois JolanÕs Beach in Guadeloupe. Only mature trees with an abundant seedling recruitement were well developed within areas far from the sea. Six sporocarps (Amanita arenicola, Inocybe littoralis, Inocybe xerophytica, Cantharellus cinnabarinus, Scleroderma bermudense and Russula cremeolilacina) were collected within the low salinity levels, whereas one (S. bermudense) was collected where the salinity levels were high. Similarly, nine morphotypes (MT) of fungi, corresponding to six ribotypes, were sorted in low salinity levels and only three of them in high salinity levels. The restriction fragment length polymorphism and sequencing of the nuclear rDNA ITS region allowed identification of mycobionts in MT by corresponding sporocarp RFLP patterns and sequences. We determined four matched sporocarps (C. cinnabarinus, I. xerophytica, S. bermudense and R. cremeolilacina) with MT, two unmatched sporocarps (A. arenicola and I. littoralis) and two identified MT (Tomentella sp1 et Tomentella sp2) without corresponding sporocarp. Mature trees and seedlings of C. uvifera shared common mycorrhizal networks (CMN) with three fungi (S. bermudense, Tomentella sp1 and Tomentella sp2). The results of this study showed that (i) the salinity decreased the fungal diversity, (ii) the sporocar ps were a bad indicator for fungal diversity, (iii) there was a potential for the formation of CMN between mature trees and seedlings.

Key words : Mature trees, Seedlings, PCR-RFLP, Sequencing, ITS, Common mycorrhizal networks

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