MATERIEL ET METHODES
Mlle HADJ BRAHIM Mouna MATERIEL ET METHODES
32
MATERIEL ET METHODES
1. Matériel végétal
Deux types de population de travail ont été
mobilisés dans le cadre de nos travaux:
Populations biparentales :
- Pour tester la résistance à P.syringae
sur rameaux, une population issue d'un croisement `Bergeron x Bakour'
(BerBa), constituée de 224 individus en pseudo-F1 (ou pseudo-cross),
plantés sur leurs propres racines dans une parcelle homogène, a
été inoculée dans un verger au cours de trois
années consécutives. Cette population a été obtenue
en 2004 et plantée sur le Domaine INRA de Gotheron (26), près de
Valence dans la Drôme (moyenne vallée du Rhône). Bergeron
est la variété locale issue du phylum d'Europe continentale
(Bourguiba et al, 2012), sensible au chancre bactérien (Prunier et al.,
1991), et Bakour une variété tunisienne locale issue du phylum
Nord-africain (Bourguiba et al., 2012) dont la faible sensibilité
variétale a été mise en évidence, validée
par Prunier et al (1991), et confirmé par l'INRA de Gotheron
(Brun et al., 2011). Parallèlement aux travaux de phénotypage, la
population hybride BerBa est entrain de faire l'objet d'une cartographie
génétique à l'aide de marqueurs microsatellites couvrant
le génome. Une étude des régions du génome
impliquées dans les caractères mesurés sera engagée
par analyse de liaison.
- Pour tester les symptômes sur feuilles causé
par P. syringae, une population biparentale en pseudo-F1 `Goldrich x
Moniqui' (GoMo), de 196 individus a été choisie et
inoculée pendant deux années consécutives (2013 et 2014).
Goldrich présente fréquemment des criblures sur feuilles qui ne
sont pas observées chez Moniqui. Cette population est maintenue sur le
domaine de l'Amarine (30). Une carte génétique étant
disponible pour les deux parents, il va être possible d'identifier les
régions du génome impliquées dans l'élaboration des
caractères mesurés.
Collection de ressources génétiques et panel
re-séquencé :
La collection variétale des ressources
génétiques contient 587 variétés issues de
différents phylums (Annexe I). Elle est maintenue sur le domaine de
l'INRA de l'Amarine à Bellegarde (30) où elle est répartie
sur trois parcelles. Une partie de cette
Mlle HADJ BRAHIM Mouna MATERIEL ET METHODES
33
collection, 76 accessions, a été
re-séquencée dans le cadre du projet ANR ABRIWG, cette
core-collection servira à détecter des QTLs par analyse
d'association qui repose sur la recherche d'une association statistique entre
le polymorphisme allélique SNP et la variation phénotypique.
| 
