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Comparaison de trois tests de détection rapide des β-lactamases à spectre elargi dans les échantillons d’hémocultures et d’urines


par Hervé KAFANDO
Université Joseph Ki-Zerbo - DES de biologie clinique 2019
  

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RESUME

Les entérobactéries sont les principaux germes responsables de bactériémies et d'infections du tractus urinaire. Ces bactéries sont devenues une menace mondiale du fait de leurs multirésistances aux antibiotiques, essentiellement due à l'acquisition de â-lactamases à spectre élargi. Le but de ce travail est d'évaluer d'une part, les performances diagnostiques de l'automate ePlex® dans l'identification des bacilles à Gram négatif et les gènes de résistances associés et d'autres part évaluer les performances du NG-Test-CTXM MULTI et â-LACTATMtest dans la détection des BLSE à partir des échantillons d'urines et d'hémocultures.

Sur une période de cinq mois, les automates ePlex® et MALDI-TOF-MS ont été utilisés pour l'identification des bactéries à partir des échantillons d'hémocultures et d'urines positives à bacilles à Gram négatif à l'examen microscopique. La détection des BLSE a été réalisée par l'automate ePlex® et par les NG-Test-CTXM MULTI et â-LACTATM Test.

Au total, 53 échantillons d'urines et 52 hémocultures ont été analysés, les entérobactéries représentaient respectivement 93 % (52/56) et 59 % (33/56) des identifications avec Escherichia coli en tête, 66 % (37/56) et 37,5 % (21/56) dans les ITU et les bactériémies. Les entérobactéries productrices de BLSE étaient de 21,2 % (11/52) dans les ITU et 27,3% (9/33) dans les bactériémies.Les concordances d'identification entre ePlex® et MALDI-TOF-MS après isolement étaient d'environ 95 % dans les deux types d'échantillons. Les performances diagnostiques de l'automate ePlex® pour la détection des BLSE sont similaires à celles du â-LACTATM test avec des sensibilités de 81,8 à 100 % et des spécificités de 95 à 100%. Le NG-Test-CTX-M MULTI a montré de meilleurs résultats avec des sensibilités allant de 90,9 à 100 % et des spécificités de 97,6 à 100 %. Le panel Gram négatif de ePlex® est bien adapté au diagnostic rapide des entérobactéries et la mise en évidence des gènes de résistance associés. Toutefois, la simplicité et le moindre coût des tests â-LACTATMainsi que des NG-Test-CTX-M MULTI font d'eux des alternatives efficaces dans le diagnostic rapide des entérobactéries productrices de BLSE.

Mots clés :BLSE, CTXM, â-LACTAtest, ePlex®.

ABSTRACT

Enterobacteria are the main germs responsible for bloodstreams and urinary tract infections. These bacteria became a global threat because of their multidrug resistance, essentially due to the Extended Spectrum Betalactamase (ESBL) acquisition. The purpose of this study is to evaluate on the one hand, the diagnostic performances of the ePlex® PLC from urines and blood cultures samples for Gram negative bacilli (BGN) and associated resistances genes identification and, on the other hand, to evaluate the performance of NG-Test-CTXM MULTI and â-LACTATM test in the detection of ESBL from urine and blood cultures samples.

During five months, an identification has been achieved by ePlex® and by MALDI-TOF-MS, from the positive urines and blood cultures with BGN to the microscopic exam. The detection of the ESBL has been achieved by ePlex®, NG-Test-CTXM MULTI and â-LACTATM Test.

On 53 samples of urines and 52 blood cultures analyzed, the enterobacteria represented 93 % (52/56) and 59 % (33/56) respectively, with 66 % (37/56) and 37,5 % (21/56) of E. coli in UTI and bacteremia. ESBL-producing enterobacteria were 21.2% (11/52) in the UTI and 27.3% (9/33) in the bacteremia. The corresponding identification between ePlex® and MALDI-TOF-MS were approximately 95 % in both types of samples.

The diagnostics performances of the ePlex® PLC for ESBL production are similar to that of the â-LACTATM test with sensitivities of 81.8 to 100% and specificities of 95 to 100%. The NG-Test-CTX-M MULTI showed better results with sensitivities ranging from 90.9 to 100% and specificities from 97.6 to 100%. The Gram-negative panel of ePlex® is adapted to the rapid diagnosis of the enterobacteria and their genes of resistance. However, the simplicity and the lower cost of â-LACTATM test as well as NG-Test-CTX-M MULTI are both coalesces for efficient alternatives in the rapid detection of ESBL.

Key words :ESBL, CTXM, â-LACTAtest, ePlex®

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