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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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Chapitre .1 .Nombre et origine des échantillons biologiques collectés et analysés

3.1 Investigations Hospitalières

Pour faciliter la collecte d'échantillons dans les divers hôpitaux de district et au Centre Hospitalier Mère et Enfant, concernés par notre étude, nous avons dû obtenir une autorisation d'accès de la Secrétariat Général du Ministère de la Santé Publique et de la Prévention. Cette autorisation était notre laissez-passer pour accéder aux différents hôpitaux de district et au CHU, nous permettant ainsi de collecter directement auprès des laboratoires et services respectifs de ces établissements tous les échantillons de selles et de sang disponibles des patients malades hospitalisés.

Entre janvier 2022 et juin 2023, un total de 1370 patients ont été enregistrés dans quatre hôpitaux de district ainsi qu'au Centre Hospitalier Universitaire Mère et Enfant pour des cas de gastro-entérites aiguës. Parmi ces patients, 320 (soit 23,35%) présentaient une fièvre supérieure à 38°C lors de la consultation, tandis que 1050 (soit 76,64%) ont fourni des échantillons de selles diarrhéiques, collectés au CHU ME et dans les quatre hôpitaux de district.

3.2Origine géographique des échantillons

L'étude a examiné des échantillons de selles et de sang prélevés dans les quatre hôpitaux de district de N'Djamena à savoir : Hopital de district Est, Hopital de district Nord, Hopital de district Centre ,Hopital de District Sud ainsi qu'au CHU ME. Au total, 1350 échantillons ont été collectés et soumis à analyse. Ces échantillons ont été traités en fonction de leur type et du site de prélèvement correspondant.

3.2.1Identification culturale et morphologique

Les Salmonella, après 18 heures d'incubation dans le milieu Hektoen, donnent des colonies qui ont un diamètre de 1 à 3 mm à 37 ° C (Figure 13). On a observé également des colonies naines, des colonies régulières lactoses négatifs et colonies vertes translucides à centre noir, dans certains cas, le centre noir n'apparaît pas. L'observation microscopique à l'état frais présente des bacilles mobiles.

Figure 12:Salmonella typhi sur Hektoen colonies vertes au centre noir

Les Shigella, après 24 heures à 37 ° C, on observe des colonies très petites 0,5 à 1 mm de diamètre, bleuté (Figure 14). L'observation microscopique à l'état frais présente des bacilles tous immobiles

Figure 13 : Shigella sur Hektoene colonies vertes transparents

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