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Modélisation des systèmes d'élevage et simulation multi-agents d'une épidémie animale en milieu rural.

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par WILFRIED BAUDOUIN TEDONGMO
Université de Yaoundé 1 - Faculté des Sciences - Master 2 Recherche en Informatique 2011
  

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6. Description formelle du modèle

Le modèle que nous présentons tire ses sources du modèle réalisé par Ivorra et al. [Ivorra & al., 2009], vu que la peste porcine classique (PPC) et la peste porcine africaine (PPA) ont beaucoup de similarités du point de vu agents vecteurs, symptômes et mode de transmissions. Il est très difficile de faire la différence entre les deux, mais seulement que la PPC est préventive et la PPA non [Franco, 2007].

Considérons un intervalle de temps [0, T], T un entier positif, le nombre maximal de jours pendant lesquels la propagation est effectuée dans la zone.

1. Un animal est contagieux ou agent vecteur s'il est dans l'un des états suivants : contagieux, signes cliniques ou immunisé.

2. Comment se fait la propagation de la maladie ? 

Si un porc est contagieux, il peut rependre la maladie autour de lui. S'il y a un autre porc proche de lui qui est sensible, il peut être contaminé. Il est affecté un nombre aléatoire compris entre 0 et 100 exclu pour matérialiser la probabilité que l'animal sensible soit infecté. Si ce nombre est inférieur au paramètre de transmission â, alors l'animal est infecté, sinon il ne l'est pas et reste sensible à la maladie [Klinkenberg & al., 2002].

Si un intervenant est en contact avec un porc contagieux, il peut être infecté. S'il est infecté, un nombre aléatoire compris entre 0 et 2 lui est affecté pour représenter le nombre de jours qu'il peut propager la maladie à d'autres troupeaux, porcs, autres animaux ou intervenants. Ce nombre matérialise le nombre de jours que l'intervenant va porter le virus et pourra le propager.

Si un intervenant porte la maladie, il peut contaminer les animaux et les intervenants qui se rapprochent de lui. Cette propagation se fait en utilisant le paramètre de transmission â.

S'il y a une tique à l'état sensible sur un porc contagieux, elle peut être infectée. Si elle est infectée, un nombre aléatoire entre 15 et 21 lui est affecté pour représenter le nombre de jours pendant lequel elle restera infectée avant d'être contagieuse. Lorsque ce nombre de jours est atteint, elle passe à l'état contagieux et va infecter les porcs sensibles sur lesquels elle va s'accrocher et piquer.

Lorsqu'un porc contagieux passe sur un lieu, il peut y laisser la maladie ce qui fait que si quelques temps après lui un autre animal sensible ou un intervenant se rend sur ce même endroit, en fonction du paramètre de transmission, il peut être infecté.

3. L'évolution journalière de la peste est déterminée en fonction du nombre de porcs déjà contagieux dans la zone, du type du système d'élevage pratiqué et de la répartition des animaux dans le troupeau. Un animal qui vient d'être infecté ne peut pas transmettre la maladie à un autre.

Cette évolution journalière S(t) et I(t) respectivement du nombre de porcs sensible et du nombre de porcs porteurs de la maladie le jour t est obtenue en utilisant une variable aléatoire P(t) suivant une distribution de Poisson de moyenne â(S(t) * I(t))/ (S(t) + I(t)) [Ivorra & al., 2009]. On obtient donc :

S(t+1) = S(t) - P(t), I(t+1) = I(t) + P(t).

4. La transition d'un porc de l'état « infecté » à « contagieux » dépend de la période de «latence» qui suit une distribution de Poisson avec une moyenne de 2 jours après la première infection du porc considéré [Ivorra & al., 2009]. Car l'animal infecté peut commencer à sécréter le virus après deux jours ou plus.

5. La transition d'un porc de l'état « contagieux » aux « signes cliniques » ou « malade » (présente les signes de la maladie) dépend de la période d'incubation qui suit une distribution de Poisson avec une moyenne m qui est fonction du paramètre de guérison á précisé [Klinkenberg & al., 2002]. À la fin de la période de l'état contagieux, suivant la dynamique des symptômes considérée, un nombre entier aléatoire compris entre 0 et 100 exclus est généré et affecté à l'animal pour matérialiser la virulence de la souche, l'état physiologique de l'hôte, et la durée de l'infection dans l'élevage et dans le pays. Si ce nombre est inférieur au seuil de résistance de la maladie qui est le paramètre de guérison, l'animal ne sera pas malade, il passe à l'état immunisé.

6. La transition de l'animal de l'état « malade » à la mort de l'animal suit une distribution de Poisson avec une moyenne m de jours du début de l'état malade. À la fin de la période de l'état malade, suivant la dynamique des symptômes considérée, un nombre entier aléatoire compris entre 0 et 100 exclus est généré et affecté à l'anima. Si ce nombre est inférieur au paramètre de guérison, l'animal passe à l'état immunisé, sinon, il meurt.

7. Soit C(t), M(t), IM(t) et D(t) respectivement le nombre de porcs à l'état contagieux, malade, immunisé et mort le jour t, on a :

C(t) = ? (porc (état=contagieux), t) 

M(t) = ? (porc (état=malade), t) 

IM(t) = ? (porc (état=immune), t)

D(t) = ? (porc (mort), t)

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