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Modélisation des systèmes d'élevage et simulation multi-agents d'une épidémie animale en milieu rural.

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par WILFRIED BAUDOUIN TEDONGMO
Université de Yaoundé 1 - Faculté des Sciences - Master 2 Recherche en Informatique 2011
  

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vi. Résultats de simulations

1. Présentation des paramètres d'entrées

Afin de percevoir la propagation de la PPA dans une zone rurale, nous présentons ici une simulation qui montre son évolution et ses dégâts au cours du temps. Notre simulation a été faite avec le simulateur multi-agents NetLogo5.0.

Initialement, l'on doit définir certains paramètres d'entrées comme suit :

Ø Le nombre de porcs mis en jeu défini ici par number-porcs ;

Ø Le nombre parmi eux initialement infectés initial-infected ;

Ø max-day-propagation qui permet de définir le nombre de jour maximal de propagation dans la zone et peut être ajusté au cours de la simulation ;

Ø infection-chance qui permet de définir le seuil de probabilité d'infection d'un animal qui est proche d'un agent vecteur contagieux ;

Ø resistance-chance qui permet de définir le seuil de probabilité qu'un porc infecté résiste ou pas à la maladie ;

Ø day-immune qui permet de définir par une distribution de Poisson le nombre de jours qu'un porc va rester dans l'immunité, avec sa valeur minimale qui est de 0 car un porc peut ne pas rester immuniser. Dans ce cas, un porc s'il résiste à la maladie passe à l'état sensible ;

Ø les paramètres number-of-person, number-of-tiques, number-other-animal, initial-person-infected, initial-tiques-infected et initial-otheranimal-infect permettent de définir respectivement le nombre initial d'intervenants, de tiques, d'autres animaux (domestiques ou suidés sauvages), d'intervenants infectés, de tiques contagieuses et des autres animaux infectés pour les suidés et contagieux pour les domestiques. Le matériel et les aliments sont considérés comme des agents non mobiles du système.

Etant données la diversité de la source de provenance de la maladie dans une zone, qui peut être des porcs, des intervenants, des tiques ou des animaux qui sont des réservoirs, nous présentons ci-dessous un exemple de simulation avec initialement 100 porcs, dont 2 infectés. La probabilité qu'un porc résiste à l'infection à 5%, la probabilité qu'un porc soit infecté à 100% et le nombre de jours d'immunité à 80. On introduit aussi 5 intervenants avec 0 infecté et 5 tiques avec 0 infectées, 5 autres animaux avec 0 infecté.

Figure 3.10 : Interface NetLogo5.0. Initialisation d'une simulation de la PPA.

Cette figure nous montre que les 2 porcs de couleur bleu infectés vont mettre chacun 2 et 3 jours avant de devenir contagieux.

2. Evolution de la simulation

Au cours de la simulation, en utilisant l'algorithme décrit ci-haut, on obtient la figure ci-dessous.

Figure 3.11 : Etat de la propagation de la peste le 10e jour.

On observe avec les moniteurs de gauche que presque la moitié des porcs ont déjà été infectés avec 1 mort. La propagation est très forte dans les secteurs où il y a déjà un porc contagieux. Chaque porc non sensible présente le nombre de jours qu'il va passer dans cet état. La couleur des animaux est définie comme suit :

Ø Vert : le porc ou l'agent en général est à l'état sensible ou susceptible ;

Ø Bleu : le porc ou l'agent en général est à l'état est infecté ;

Ø Jaune : le porc ou l'agent en général est à l'état est contagieux ;

Ø Rouge : le porc ou l'agent en général est à l'état malade, présente les signes cliniques ;

Ø Gris : le porc a résisté à la maladie. Il est immunisé.

Les patches de couleur bleu sont ceux infectés et qui peuvent infecter un porc si ce dernier se rapproche de ce patch.

Figure 3.12 : Etat de la propagation de la peste le 20e jour.

Il ne reste plus que 4 porcs sensibles et déjà 26 porcs sont morts.

A la fin de la simulation, l'on observe la figure suivante :

Figure 3.13 : Fin de la simulation de la peste après 38e jours de son introduction.

On constate dans cette simulation qu'après 38 jours, seulement 12 porcs ont résisté à la maladie.

La simulation s'arête dans l'un des cas suivants :

Ø Le nombre de jours maximum de propagation est survenu,

Ø Tous porcs sont à l'état immunisé,

Ø Tous les porcs sont morts.

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