2. Matériel
2.1. Présentation du matériel
Le matériel osseux utilisé pour cette
étude est constitué des 9 mandibules d'individus retrouvés
dans les sarcophages 169, 170 et 171 de la nécropole. Ceux-ci ont
été prélevés lors de la campagne de fouille
menée par D. Castex et I. Cartron en 2005. Le choix du matériel
se justifie essentiellement par le fait qu'il a été montré
que les dents en place et intactes présentent un taux de conservation de
l'ADN plus important que les os (Shultes 1999). Des dents ont donc
été prélevées chez 8 individus sur 9. Aucun type de
dent n'a été privilégié, le choix
privilégiant surtout les dents non endommagées et non
cariées. Le tableau n° 2 présente le type de dent
utilisé pour l'extraction de l'ADN. Concernant le périnatal, il
n'a bien sur pas été possible d'utiliser de dent, une hémi
mandibule a donc été utilisée à la place.
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N°Sépulture
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169
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170
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171
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1er inhumé
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M3
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P1
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C
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2ème inhumé
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M2
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M2
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M3
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3ème inhumé
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M3
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X
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P1
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Tableau 2 : Détail des dents
utilisées lors de l'extraction.
Les conditions de prélèvement des
échantillons sur le site ont été assez variables.
Les prélèvements des individus du sarcophage 169
ont fait l'objet de précautions tout à fait rigoureuses, tel que
le port de masque, de gants, nettoyage systématique des outils à
la javel puis mis en congélation immédiate des
échantillons. Pour plusieurs auteurs (Poinar et al. 2003 ; Gilbert
2005), toutes ces précautions prises lors des prélèvements
sont essentielles et permettent de limiter sérieusement les
contaminations exogènes.
Les individus des sarcophages 170 et 171 n'ont pas fait
l'objet de si grands soins. En effet, les prélèvements ont
été effectués sans gant. Néanmoins, les
échantillons ont été mis en sachet immédiatement
après avoir été prélevés, n'ont pas
été lavés et ont été conservés
à -20°C jusqu'aux analyses. Bien que ce dernier aspect soit
regrettable, il sera néanmoins intéressant, d'un point de vue
méthodologique, de comparer les résultats d'analyse ADN issus de
prélèvements avec et sans port de gant.
2.2. Choix des régions
étudiées
Pour tous les arguments énoncés
précédemment, notre analyse s'est portée en premier lieu
sur l'ADN mitochondrial. Nous avons décidé de nous concentrer
uniquement sur la région de contrôle (D-Loop) même si la
région codante est parfois indispensable pour la confirmation de
certains haplogroupes. Cette région hypervariable, comme nous l'avons
dit, est partagée en 2 segments de taille réduite : HVRI (421pb)
et HVRII (383pb). Seul la région HVRI a été
analysée car c'est la région pour laquelle les bases de
données sont les plus riches. L'ADN ancien étant très
souvent dégradé, cette région sera fractionnée lors
de l'amplification. Nous obtiendrons donc, lors des résultats, quatre
fragments chevauchants et courts A, B, C et CC reconstituant la région
HVR1.
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