I. Les différents éléments
transposables :
1. Définition :
Les éléments transposables sont classiquement
définis comme des séquences moyennement
répétées qui ont la capacité de se déplacer
d'une position à une autre. Ce mouvement est appelé
transposition. Jusqu'à présent, les ETs ont été
trouvés dans tous les organismes vivants (procaryotes et eucaryotes). Au
sein d'un même génome, on peut trouver des éléments
de type différent. Le nombre de copies des ETs peut varier de moins
d'une dizaine à plusieurs centaines de milliers selon le type
d'éléments et l'espèce hôte. (Orgel et Crick
1980)
Par exemple, chez le maïs, ils représentent plus
de 50% du génome total (SanMiguel et al. 1996) alors que chez la levure
ils ne forment que 3% du génome (Kim et al. 1998) et ils
occupent 44% du génome chez l'homme. (Mills et al 2007)
Lors de leurs déplacements, ils peuvent
s'insérer dans les gènes ou dans des régions
régulatrices et être responsables de mutations pouvant être
délétères ou non. Ils sont aussi responsables d'importants
remaniements chromosomiques comme des délétions, des inversions
et des translocations (Evgen'ev et al. 2000). Ils sont donc une source
de variations génétiques importantes. Ainsi, les ETs ont un
impact important sur leur génome hôte. Malgré la
caractéristique commune qui est de dupliquer leur site cible lors de
leur insertion, les ETs ont des structures pouvant être très
différentes. On peut ainsi les caractériser selon leur structure
et selon l'intermédiaire qu'ils utilisent pour se déplacer
(Finnegan 1992).
Les éléments autonomes possèdent des
gènes codant pour des protéines nécessaires à leur
déplacement. On trouve aussi un certain nombre d'éléments
non autonomes qui dépendent des éléments autonomes pour
leur transposition.
2. Les différentes classes
d'éléments transposables :
Selon leur diversité structurale et leur mode de
transposition, Les ET se répartissent en trois principaux groupes : les
éléments de classe I ou rétrotransposons, les
éléments de classe II ou transposons, et les
éléments de classe III.
2.1 Les éléments de classe I :
Les éléments transposables de classe I ou les
rétrotransposons sont des éléments qui se déplacent
via un intermédiaire ARN selon un modèle réplicatif ou un
modèle copier-coller. Ils sont subdivisés en deux sous-classes,
selon qu'ils possèdent ou pas des séquences (LTR) « Long
Terminal Repeat ».
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