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Diversité génétique des Rhizobia associés à† un champ de pois d'Angole (Cajanus cajan l.) à† Yamoussoukro (centre de la Côte d'Ivoire)

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par Kouakou Romain FOSSOU
Ecole supérieure d'agronomie de l'institut national polytechnique Félix HouphouŽt Boigny de Yamoussoukro - Diplôme d'agronomie approfondie  2011
  

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ABSTRACT

Pigeon pea (Cajanus cajan) is an important grain legume in tropical zone, notably in West Africa. However, in this area of Africa the diversity of rhizobia nodulating this plant is poorly understood even though its exploration can contribute to increase its interest, notably in agriculture. This work aimed at determining the genetic diversity of rhizobia nodulating a pigeon pea field in Yamoussoukro (Center Ivory Coast). One hundred sixty-nine (169) rhizobia's strains were isolated from field nodules. The use of TY medium allowed the purification and identification of two groups according to their growth rate. PCR-RFLP analyses of the 16S rRNA genes with the endonuclease Tsp 509I enabled the characterization of three main genotypes within the pigeon pea nodulating rhizobial community. The abundance of these genotypes are 11,2 % for the least to 53,9 % for the most important. These studies showed the evidence of physiological and genetic variability within the pigeon pea noduating rhozobial strains.

Keywords: Cajanus cajan; Diversity; Rhizobia; Côte d'Ivoire; rDNA16S; PCR-RFLP.

AVANT-PROPOS ET REMERCIEMENTS

Ce mémoire a été élaboré en vue de l'obtention du Diplôme d'Agronomie Approfondie (DAA). Il marque la fin d'études des étudiants agronomes de l'Ecole Supérieure d'Agronomie (ESA) de l'Institut National Polytechnique Félix Houphouët Boigny de Yamoussoukro (INP-HB). En effet, dans le souci de donner une formation complète à ses élèves ingénieurs, l'ESA a initié un stage de fin d'études d'une durée de six (6) mois portant sur un thème de recherche ou de développement.

C'est pour bénéficier de cette initiative pédagogique que nous avons séjourné successivement au Laboratoire d'Agronomie et Productions végétales de l'INP-HB et au Laboratoire Central de Biotechnologie (LCB) du Centre National de Recherche Agronomique (CNRA). Ce stage nous a permis de réfléchir sur le thème : «Diversité génétique des rhizobia associés à un champ de pois d'Angole (Cajanus cajan L.) à Yamoussoukro». Ce fut pour nous une occasion d'apprentissage d'une technique fondamentale dans l'identification moléculaire des micro-organismes (la Réaction de polymérisation en chaîne ou PCR) et aussi, un temps d'initiation à quelques rudiments de la recherche scientifique.

Ce stage a été proposé par Pr ZEZE Adolphe, enseignant-chercheur à l'INP-HB, à qui nous voulons traduire toute notre reconnaissance pour l'opportunité offerte. Pour nous, il a été plus qu'un encadreur pédagogique et de terrain durant ce stage. C'est pourquoi, nous voulons lui exprimer toute notre fierté de l'avoir côtoyé au moment où nous terminons notre parcours académique à l'INP-HB.

Au Dr AGNEROH née Thérèse ATCHAM, chef du Laboratoire de Phytopathologie et Biologie Végétale, nous exprimons toute notre reconnaissance pour avoir ouvert grandement les portes de son laboratoire pour nos nombreuses et diverses sollicitations durant ce stage.

Au Dr KOUASSI Nazaire, Directeur du LCB du CNRA, nous voulons exprimer notre gratitude pour l'accueil au sein de l'unité de biologie moléculaire et virologie de sa structure pour les manipulations moléculaires.

Nous remercions également MM. YAO Bognon, AMOAKON Adou, YOHOU Alain et Mlle DALE, personnel technique des deux laboratoires sus-cités, pour leur aide précieuse.

Enfin, à notre frère et unique collègue de fin d'études ZAKO, ainsi qu'à toute la 41ème promotion ENSA, nous disons merci.

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9Impact, le film from Onalukusu Luambo on Vimeo.


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