ABSTRACT
Pigeon pea (Cajanus cajan) is an important grain
legume in tropical zone, notably in West Africa. However, in this area of
Africa the diversity of rhizobia nodulating this plant is poorly understood
even though its exploration can contribute to increase its interest, notably in
agriculture. This work aimed at determining the genetic diversity of rhizobia
nodulating a pigeon pea field in Yamoussoukro (Center Ivory Coast). One hundred
sixty-nine (169) rhizobia's strains were isolated from field nodules. The use
of TY medium allowed the purification and identification of two groups
according to their growth rate. PCR-RFLP analyses of the 16S rRNA genes with
the endonuclease Tsp 509I enabled the characterization of three main
genotypes within the pigeon pea nodulating rhizobial community. The abundance
of these genotypes are 11,2 % for the least to 53,9 % for the most important.
These studies showed the evidence of physiological and genetic variability
within the pigeon pea noduating rhozobial strains.
Keywords: Cajanus cajan; Diversity;
Rhizobia; Côte d'Ivoire; rDNA16S; PCR-RFLP.
AVANT-PROPOS ET REMERCIEMENTS
Ce mémoire a été élaboré en
vue de l'obtention du Diplôme d'Agronomie Approfondie (DAA). Il marque la
fin d'études des étudiants agronomes de l'Ecole Supérieure
d'Agronomie (ESA) de l'Institut National Polytechnique Félix
Houphouët Boigny de Yamoussoukro (INP-HB). En effet, dans le souci de
donner une formation complète à ses élèves
ingénieurs, l'ESA a initié un stage de fin d'études d'une
durée de six (6) mois portant sur un thème de recherche ou de
développement.
C'est pour bénéficier de cette initiative
pédagogique que nous avons séjourné successivement au
Laboratoire d'Agronomie et Productions végétales de l'INP-HB et
au Laboratoire Central de Biotechnologie (LCB) du Centre National de Recherche
Agronomique (CNRA). Ce stage nous a permis de réfléchir sur le
thème : «Diversité génétique des
rhizobia associés à un champ de pois d'Angole (Cajanus cajan
L.) à Yamoussoukro». Ce fut pour nous une occasion
d'apprentissage d'une technique fondamentale dans l'identification
moléculaire des micro-organismes (la Réaction de
polymérisation en chaîne ou PCR) et aussi, un temps d'initiation
à quelques rudiments de la recherche scientifique.
Ce stage a été proposé par Pr ZEZE
Adolphe, enseignant-chercheur à l'INP-HB, à qui nous voulons
traduire toute notre reconnaissance pour l'opportunité offerte. Pour
nous, il a été plus qu'un encadreur pédagogique et de
terrain durant ce stage. C'est pourquoi, nous voulons lui exprimer toute notre
fierté de l'avoir côtoyé au moment où nous terminons
notre parcours académique à l'INP-HB.
Au Dr AGNEROH née Thérèse ATCHAM, chef
du Laboratoire de Phytopathologie et Biologie Végétale, nous
exprimons toute notre reconnaissance pour avoir ouvert grandement les portes de
son laboratoire pour nos nombreuses et diverses sollicitations durant ce
stage.
Au Dr KOUASSI Nazaire, Directeur du LCB du CNRA, nous voulons
exprimer notre gratitude pour l'accueil au sein de l'unité de biologie
moléculaire et virologie de sa structure pour les manipulations
moléculaires.
Nous remercions également MM. YAO Bognon, AMOAKON
Adou, YOHOU Alain et Mlle DALE, personnel technique des deux laboratoires
sus-cités, pour leur aide précieuse.
Enfin, à notre frère et unique collègue
de fin d'études ZAKO, ainsi qu'à toute la 41ème
promotion ENSA, nous disons merci.
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