TABLE DES MATIERES
RESUME I
ABSTRACT II
AVANT PROPOS ET REMERCIEMENTS III
LISTE DES TABLEAUX VII
LISTE DES FIGURES VIII
LISTE DES ANNEXES IX
SIGLES ET ABREVIATIONS X
DEDICACES XI
INTRODUCTION 1
PREMIERE PARTIE : REVUE BIBLIOGRAPHIQUE 3
CHAPITRE I : GENERALITES SUR LA SYMBIOSE
LEGUMINEUSES-RHIZOBIA. 4
I.1. FIXATION BIOLOGIQUE DE L'AZOTE 4
I.2. SYMBIOSE LEGUMINEUSES/RHIZOBIA 5
I.2.1. Définition de la symbiose rhizobienne 5
I.2.2. Intérêts de la symbiose
rhizobia-légumineuses 6
I.2.3. Caractérisation des deux partenaires 7
I.2.3.1. Rhizobia 7
I.2.3.2. Légumineuses 7
I.2.3.3. Caractéristiques du couple :
infectivité, efficience et spécificité 8
CHAPITRE II : APERÇU SUR LE PROCESSUS DE
NODULATION CONDUISANT A LA FIXATION AZOTEE 10
II.1. GENETIQUE DE LA NODULATION CHEZ LA BACTERIE 10
II.1.1. Gènes nod 10
II.1.1.1. Gènes nod D 10
II.1.1.2. Gènes nod communs (ABCIJ) 11
II.1.1.3. Gènes nod spécifiques
(nod H, nod FE, nod G, nod MN, nod
Q etc.) 11
II.1.1.4. Autres gènes nécessaires à la
nodulation 12
II.1.2. Gènes nif 13
II.1.3. Gènes fix 14
II.2. GENETIQUE DE LA NODULATION CHEZ LA LEGUMINEUSE 14
II.3. SCHEMATISATION DES ETAPES DU PROCESSUS DE NODULATION
15
CHAPITRE III : TAXONOMIE DES RHIZOBIA
17
III.1. HISTOIRE DE LA TAXONOMIE RHIZOBIENNE 17
III.2. TAXONOMIE POLYPHASIQUE ET PHYLOGENIE DES RHIZOBIA 18
III.2.1. Taxonomie polyphasique 18
III.2.2. Notion de phylogénie chez les Rhizobia
18
III.3. CLASSIFICATION ACTUELLE DES RHIZOBIA 19
CHAPITRE IV : GENERALITES SUR LE POIS D'ANGOLE
(Cajanus cajan L.) 21
IV.1. ORIGINE ET DISTRIBUTION GEOGRAPHIQUE DE LA PLANTE 21
IV.2. ZONES DE CULTURE ET IMPORTANCE DES PRODUCTIONS 21
IV.3. TAXONOMIE DU POIS D'ANGOLE 22
IV.3.1. Nomenclature 22
IV.3.2. Classification 22
IV.4. DESCRIPTION DU POIS D'ANGOLE 23
IV.4.1. Description botanique 23
IV.4.2. Ecologie 24
IV.4.3. Mode de multiplication et systèmes de culture
24
IV.4.4. Croissance, développement et rendement 24
IV.4.5. Ennemis et maladies de Cajanus cajan 25
IV.5. IMPORTANCE DE LA CULTURE DU POIS CAJAN 25
IV.5.1. Importance nutritionnelle du pois cajan 26
IV.5.2. Importance agronomique du pois cajan 26
IV.5.3. Importance du pois cajan en Afrique 27
CHAPITRE V : RHIZOBIA SYMBIOTIQUES DU POIS CAJAN
28
DEUXIEME PARTIE : ETUDE EXPERIMENTALE
29
CHAPITRE VI : PRESENTATION DE L'ETUDE ET DES
LABORATOIRES D'ACCUEIL 30
VI.1. OBJECTIFS DE L'ETUDE 30
VI.2. PRESENTATION DU SITE DE COLLECTE DES ECHANTILLONS 30
VI.3. PRESENTATION DES LABORATOIRES D'ACCUEIL DE L'ETUDE 30
CHAPITRE VII : MATERIEL ET METHODES
31
VII.1. MATERIEL 31
VII.1.1. Matériel vivant 31
VII.1.2. Matériel technique 31
VII.2. METHODES 33
VII.2.1. Récolte des nodules et isolement des souches
bactériennes 33
VII.2.2. Préparation des cellules bactériennes
par effet thermique 34
VII.2.3. Amplification et digestion de la région 16S de
l'ADNr des rhizobia par
PCR-RFLP 34
VII.2.3.1. Principe de la PCR-RFLP et choix du gène de
l'ADNr 16S 34
VII.2.3.1.1. Principe de la PCR-RFLP 34
VII.2.3.1.2. Choix du gène de l'ADNr 16S 35
VII.2.3.2 Réalisation de la PCR-RFLP 36
VII.2.3.2.1. Principe de la PCR 36
VII.2.3.2.2. Choix des amorces et milieu réactionnel de
la PCR 37
VII.2.3.2.3. Programme de la PCR 38
VII.2.3.2.4. Electrophorèse sur gel d'agarose et
visualisation des gels 39
VII.2.3.2.5. Migration de l'ADN et visualisation 39
VII.2.3.2.6. Digestion des amplifiats 40
CHAPITRE VIII : RESULTATS ET DISCUSSION
41
VIII.1. RESULTATS 41
VIII.1.1. Croissance des bactéries sur milieu TY solide
41
VIII.1.2. Amplification par PCR de l'ADNr 16S 41
VIII.1.3. Produits de digestion 42
VIII.2. DISCUSSION DES RESULTATS 44
CONCLUSION ET PERSPECTIVES 46
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 47
ANNEXES 57
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