III. 3. Polymorphisme des marqueurs utilisés
Pour les analyses portant sur le polymorphisme
génétique, nous avons considéré uniquement les
marqueurs ayant amplifié au moins 80% des glossines analysées.
Sur cette base, seulement 5 marqueurs ont été
considérés : GPCAG, 55.3, C102, PGP13 et PGP24.
La figure 11 montre un exemple de photo illustrant la
séparation, sur gel d'agarose, des produits d'amplifications obtenus au
locus 55.3. Quel que soit le locus analysé, aucune différence de
taille n'a été détectable à la suite de la
séparation des produits d'amplifications sur gel d'agarose. Par
ailleurs, une seule bande d'ADN illustrant l'amplification du locus
microsatellite a été obtenue sur gel d'agarose pour chaque
glossine analysée. Les allèles ayant des tailles très
proches, ne peuvent être bien séparés sur gel d'agarose ;
raison pour laquelle nous avons fait recours au gel de polyacrylamide.
Figure 11: Exemple de photo montrant les profils des
bandes obtenues sur gel d'agarose et illustrant les amplicons issus de
l'amplification du locus 55.3.
C- = Contrôle négatif ; 1= G. caligenea ;
2= G. fuscipes ; 3, 13-15= G. p. palpalis ; 4-12= G. p. pallicera
35
Caractérisation génétique de Glossina
pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de
Campo du Sud forestier Camerounais rédigé par GOMSEU DJOUMSIE
Emmanuel Boris
La figure 12 présente un exemple de profils de bandes
obtenues après résolution sur gel de polyacrylamide des produits
d'amplification pour les loci C102 et PGP24.
Homozygotes Hétérozygotes
263* 263* 280* 280* 289* 289* 266*
300* 295* 289*
275*
250*
225*
200*
204*
208*
248* 257* 257* 257* 260* 266* 257* 263* 257*
257* 257* 257* 263*
175*
186* 188*
Figure 12: Photo d'un gel de polyacrylamide montrant
les profils des allèles obtenus pour chaque glossine et aux loci C102 et
PGP24.
* : paire de base ; 1, 2 et 11 =
G. p. palpalis ; 2-9 et 17 = G. p.
pallicera ; 12-15 = G. submorsitans.
C102 ; 16= G. caligenea ; 10 =
marqueur de taille 25pbs. Le locus C102
(échantillon 1-15), le locus PGP24
(échantillon 16 et 17).
Le degré de polymorphisme des marqueurs microsatellites
varie d'un locus à l'autre. La taille des allèles varie de 151
à 247 paires de bases pour le marqueur GPCAG133, de 165 à 193 pb
pour 55.3, de 154 à 210 pour PGP13 et de 242 à 296 paires de
bases pour C102.
Le tableau 4 donne, en fonction du sexe, du village, des
espèces et des loci, la taille des allèles obtenus pour chaque
glossine analysée.
36
Caractérisation génétique de Glossina
pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de
Campo du Sud forestier Camerounais rédigé par GOMSEU DJOUMSIE
Emmanuel Boris
Tableau 4 : Génotypes multilocus obtenus pour
chaque glossine analysée et pour les cinq
|
loci considérés.
|
|
|
|
|
|
|
|
/
|
/
|
/
|
/
|
Génotypes à chaque locus
|
|
|
|
Ind
|
Espèce
|
Village
|
Sexe
|
55.3
|
GPCAG
|
PGP13
|
C102
|
PGP24
|
|
1
|
Gnigr
|
Akak
|
F
|
000/000
|
000/000
|
000/000
|
245/245
|
249/249
|
|
2
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
167/167
|
217/217
|
180/166
|
254/242
|
241/227
|
|
3
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
220/214
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
4
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
167/167
|
214/214
|
180/166
|
251/251
|
241/227
|
|
5
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
214/211
|
166/166
|
251/251
|
241/227
|
|
6
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
167/167
|
220/220
|
180/166
|
254/245
|
241/227
|
|
7
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/211
|
166/166
|
257/257
|
241/227
|
|
8
|
Gnigr
|
CampoBeach F
|
000/000
|
151/151
|
178/166
|
260/260
|
205/205
|
|
9
|
Gpal
|
Memel
|
M
|
000/000
|
220/214
|
166/166
|
251/251
|
207/201
|
|
10
|
Gcal
|
Campo
|
F
|
167/167
|
202/202
|
186/172
|
263/263
|
261/245
|
|
11
|
Gcal
|
Campo
|
F
|
167/167
|
205/220
|
188/174
|
260/260
|
263/247
|
|
12
|
Gcal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
202/202
|
184/176
|
260/260
|
265/251
|
|
13
|
Gpal
|
Campo
|
M
|
167/167
|
202/199
|
166/166
|
260/251
|
265/251
|
|
14
|
Gfus
|
Memel
|
F
|
181/181
|
196/220
|
184/184
|
251/251
|
241/227
|
|
15
|
Gpp
|
Campo
|
F
|
000/000
|
000/000
|
000/000
|
260/260
|
000/000
|
|
16
|
Gpal
|
Memel
|
F
|
167/167
|
202/202
|
000/000
|
266/266
|
000/000
|
|
17
|
Gpal
|
Campo
|
M
|
167/167
|
214/214
|
166/166
|
269/269
|
241/227
|
|
18
|
Gpp
|
Campo
|
F
|
181/171
|
202/202
|
170/154
|
263/251
|
243/243
|
|
19
|
Gpp
|
Campo
|
M
|
177/177
|
211/211
|
192/192
|
263/257
|
209/205
|
|
20
|
Gpal
|
Campo
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
21
|
Gpal
|
Campo
|
F
|
181/167
|
214/214
|
204/190
|
260/260
|
241/227
|
|
22
|
Gpal
|
Campo
|
F
|
181/167
|
238/214
|
204/190
|
254/242
|
241/227
|
|
23
|
Gpal
|
Campo
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
254/242
|
241/227
|
|
24
|
Gpp
|
Campo
|
F
|
193/181
|
211/211
|
210/198
|
257/257
|
207/193
|
|
25
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
000/000
|
220/220
|
180/166
|
000/000
|
000/000
|
|
26
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
000/000
|
220/214
|
166/166
|
000/000
|
000/000
|
|
27
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
214/214
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
28
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
214/214
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
29
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
214/205
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
|
30
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
|
31
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
32
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
243/229
|
|
33
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
000/000
|
217/217
|
166/166
|
257/257
|
241/227
|
|
34
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
37
Caractérisation génétique de Glossina
pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de
Campo du Sud forestier Camerounais rédigé par GOMSEU DJOUMSIE
Emmanuel Boris
|
35
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
36
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
220/220
|
166/166
|
257/257
|
000/000
|
|
37
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
38
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
177/177
|
160/160
|
180/166
|
260/254
|
000/000
|
|
39
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
177/177
|
220/217
|
166/166
|
260/260
|
241/227
|
|
40
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
189/189
|
000/000
|
172/172
|
260/260
|
000/000
|
|
41
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
|
42
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
|
43
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
254/254
|
241/227
|
|
44
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
223/223
|
166/166
|
263/263
|
241/227
|
|
45
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
167/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
241/227
|
|
46
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/217
|
166/166
|
260/260
|
243/229
|
|
47
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
220/217
|
166/166
|
254/254
|
241/227
|
|
48
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
165/165
|
220/214
|
166/166
|
287/257
|
241/227
|
|
49
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/171
|
217/202
|
180/166
|
254/254
|
241/227
|
|
50
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/202
|
166/166
|
257/257
|
241/227
|
|
51
|
Gpal
|
Akak
|
M
|
167/167
|
217/217
|
172/172
|
257/257
|
000/000
|
|
52
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/202
|
180/166
|
257/257
|
241/227
|
|
53
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/202
|
180/166
|
257/257
|
241/227
|
|
54
|
Gpal
|
Akak
|
F
|
181/167
|
217/217
|
180/166
|
260/260
|
243/227
|
|
55
|
Gpal
|
Mabiog
|
F
|
167/167
|
217/217
|
180/166
|
257/257
|
225/225
|
|
56
|
Gpp
|
RioCampo
|
F
|
181/167
|
000/000
|
184/170
|
296/266
|
245/231
|
|
57
|
Gpp
|
RioCampo
|
F
|
181/167
|
190/181
|
194/180
|
260/260
|
000/000
|
|
58
|
Gpp
|
Edjabe
|
M
|
167/167
|
247/208
|
190/190
|
266/266
|
219/203
|
|
59
|
Gpp
|
Edjabe
|
M
|
179/179
|
221/202
|
178/178
|
266/251
|
219/203
|
|
60
|
Gpp
|
RioCampo
|
M
|
177/177
|
205/205
|
186/186
|
260/260
|
000/000
|
|
61
|
Gpp
|
RioCampo
|
F
|
165/165
|
202/202
|
200/194
|
260/260
|
000/000
|
|
62
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
183/175
|
211/202
|
186/172
|
266/266
|
225/211
|
|
63
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
187/177
|
211/211
|
198/186
|
260/260
|
225/211
|
|
64
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
193/183
|
208/208
|
186/174
|
263/251
|
225/213
|
|
65
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
193/183
|
208/202
|
188/172
|
263/251
|
225/211
|
|
66
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
183/171
|
208/208
|
186/174
|
257/245
|
227/213
|
|
67
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
183/171
|
205/205
|
190/178
|
251/243
|
227/213
|
|
68
|
Gpp
|
Fontem
|
F
|
181/167
|
208/190
|
188/176
|
269/269
|
215/199
|
|
69
|
Gmp
|
Adamaoua
|
M
|
167/167
|
208/199
|
202/202
|
263/263
|
223/209
|
|
70
|
Gmp
|
Adamaoua
|
M
|
000/000
|
220/220
|
208/208
|
263/263
|
223/209
|
|
71
|
Gmp
|
Adamaoua
|
M
|
167/167
|
217/217
|
194/194
|
263/263
|
000/000
|
|
72
|
Gmp
|
Adamaoua
|
M
|
193/193
|
214/214
|
220/220
|
290/263
|
221/207
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Ind : Individu ; M : Mâle
; F : Femelle ; Gmp : G. submorsitans
; Geal : G. caligenea ; GPP :
G. p. palpalis ; Gpal : G. p. pallicera
; Gnigr : G. nigrofusca ; Gfus :
G. fuscipes.
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Caractérisation génétique de Glossina
pallicera pallicera circulant dans le foyer de la maladie du sommeil de
Campo du Sud forestier Camerounais rédigé par GOMSEU DJOUMSIE
Emmanuel Boris
Il découle de ce tableau que 69 allèles (dont 36
allèles pour G. p. pallicera) ont été
identifiés pour les cinq marqueurs microsatellites utilisés,
illustrant ainsi une certaine diversité génétique au sein
des différentes populations de glossines.
III.4. Analyses génétiques
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