CHAPITRE 1 : COVIDE-19
Le génome viral est traduit pour produire des
protéines 1a et 1ab. Ces protéines 1a et 1ab sont traitées
par le virus pour produire une variété de protéines
virales, y compris des polymérases ARN-dépendantes, des
protéines qui remodèlent les membranes pour former des structures
utilisées comme sites pour la synthèse d'ARN viral, des enzymes
qui favorisent plusieurs étapes de la synthèse structurelle du
Coiffe 5'-terminal et une exo nucléase impliquée dans la lecture
lors de la réplication du génome. D'autres protéines
virales sont codées par un ensemble d'ARNm qui partagent une
séquence leader commune (5'UTR) à la fin 5'.La synthèse
par lots d'ARN se produit dans le brin négatif de l'ARN. La plupart du
brin positif n'est pas copié, car il apparaît lorsque la
polymérase le termine jusqu'au 5' UTR. L'ARN à brin
négatif résultant, avec la séquence 3'UTR à la fin,
est ensuite transcrit pour former. Ces ARNm sont traduits pour former des
protéines non structurelles. Les protéines M, S et E
attachées sont insérées dans la lumière du
réticulum endoplasmique, puis migrent vers le site d'assemblage viral,
le réticulum endoplasmique médié par Golgi. L'ARN brin
négatif complet est produit et modélisé pour la
synthèse de l'ARN brin positif, qui est ensuite enveloppé par la
protéine N. La nucléocapside pénètre dans l'ERGIC,
produisant une membrane contenant les protéines S, E et M. Les
particules virales sont transportées vers la membrane plasmique des
vésicules à paroi lisse et libérées de l'exocytose
lorsque la vésicule fusionne avec la membrane plasmatique(Redha,
2020).
Figure 4: cycle de réplication virale dans les cellules
eucaryotes. Le virus se lie à un récepteur
à la surface
des cellules (ACE2 pour le SARS-CoV et le SRAS-Cov-2 ; DPP4 pour le
MERS-
CoV et le SARS-Cov 2)
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CHAPITRE 1 : COVIDE-19
7 Méthodes de dépistage
Pour détecter ce nouveau coronavirus, l'approche
moléculaire est la première ligne de méthodes pour
confirmer les cas suspects. L'analyse des acides nucléiques est la
principale technique en laboratoire. D'autres méthodes telles que les
tests d'antigène viral ou d'anticorps sont également des tests
précieux de courte durée pour détecter une nouvelle
infection à coronavirus. En cas de suspicion d'infection à
coronavirus, le dépistage du coronavirus est effectué à
l'hôpital ou analysé. Il s'agit de prélever un
écouvillon nasopharyngé d'une partie du nez à l'aide d'un
long coton-tige (figure 5). Sécrétions nasales, sang, crachats et
sécrétions broncho-alvéolaires prélevés chez
des patients suspectés d'être utilisés en clinique.
Les échantillons sont soumis à des tests
sérologiques et moléculaires spécifiques au SARS-CoV-2
pour un diagnostic en laboratoire. Les tests sérologiques utilisent un
dosage immuno-enzymatique (ELISA) ou Western blots qui détecte des
protéines SARS-CoV-2 spécifiques. Les approches
moléculaires sont basées sur la PCR en temps réel (RT-PCR)
ou l'hybridation Northern blot ciblant des gènes SARS-CoV-2
spécifiques. Les antigènes viraux présents dans les
échantillons cliniques sont détectés en utilisant le
dosage immuno-fluorescent direct (IFA)(DROUAZ & KADRI, 2020).
Figure 5: prélèvement nasopharyngé dans la
partie haute du nez à l'aide d'un long coton-tige
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