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Conception d'idéotypes de tomate adaptés au stress hydrique.

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par Cheikh Mehdi Ould Mohamed Abdellahi Cheikh Mehdi
Montpellier-II - Master-2 informatique 2015
  

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Chapitre 5

Conclusions

5.1 Résultats obtenus

L'objectif principal du stage a été suivi dans un premier temps via l'ajustement indépendant (sectin3.1) de 8 paramètres en obtenant 16 valeurs par génotype. Dans un deuxième temps un ajustement parallèle (sectin3.2) a permis de réduire le nombre de paramètres de 16 à 8 par génotype. Ensuite grâce à l'analyse de la variabilité des paramètres (sectin3.3), on a pu réduire encore le nombre des paramètres à ajuster de 8 à 6. Et au final l'objectif principal du stage à savoir, estimer les paramètres du modèle de croissance du fruit pour simuler correctement l'évolution au cours du temps des deux variables MF et MS pour l'ensemble des génotypes a été atteint via l'ajustement parallèle de six paramètres.

5.2 Difficultés rencontrées

Les principales difficultés du stage étaient de pouvoir s'adapter aux situations de la vie en laboratoire de recherche, découvrir et exploiter les travaux précédents sur le modèle dans un court laps de temps, comprendre le vocabulaire de biologie et travailler avec l'outil de programmation R (exigé par l'équipe) que je n'aurais jamais utilisé auparavant. Du coté technique les trois problèmes évoqués en chapitre4, m'ont pris la majorité du temps. Il a fallu découvrir chacun d'eux après un long temps et éventuellement chercher la solution la mieux adaptée.

5.3 Apports

5.3.1 Pour l'entreprise

Le bilan de ce stage est positif, les principaux objectifs (sectin1.3.3) du projet sont accomplis. Désormais, le modèle de croissance du fruit permet de simuler correctement l'évolution au cours du temps des deux variables MF et MS pour l'ensemble des génotypes via l'ajustement parallèle (sectin3.2) de six paramètres. En conséquence, nous pouvons dire, sans aucune prétention, que le modèle développé est un outil efficace pour remplir plusieurs objectifs envisagés dans le cadre du projet TOMSEC (conception d'idéotypes

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culturaux adaptés à la contrainte hydrique et améliorés sur des critères de qualité gustative et nutritionnelle), notamment les deux objectifs suivants :

> Utiliser le modèle pour prédire le comportement de différentes combinaisons allé-liques/paramètres génétiques dans des conditions d'alimentation en eau variables. On suppose que les valeurs des paramètres du modèle dépendent des allèles présents chez les génotypes.

> Proposer des combinaisons de paramètres génétiques permettant d'optimiser le rendement (MS/MF) et la qualité des fruits dans des conditions variables d'environnement. Il s'agit de trouver par l'optimisation multi-objectif les combinaisons de paramètres qui permettent un calibre et une teneur en MS répondant aux exigences du consommateur et ce, dans des conditions respectueuses de l'environnement.

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