L'amélioration génétique du cacaoyer. Des ressources génétiques forestières aux variétés cultivées

Université Montpellier II
Ecole Doctorale Systèmes Intégrés en Biologie, Agronomie, Géosciences,
Hydrosciences et Environnement (Sibaghe).

NOTICE DE TRAVAUX
Présentée pour l'obtention du diplôme

HABILITATION A DIRIGER DES RECHERCHES

Par
Philippe Lachenaud
Chercheur au Cirad-Bios

« L'amélioration génétique du cacaoyer. Des ressources génétiques forestières aux variétés cultivées »

Soutenue le 3 mars 2010 Membres du jury :

M. CHARRIER André, SupAgro Montpellier et U. Montpellier 2, Président du jury. M. DAVID Jacques, UMR DIAPC, SupAgro Montpellier

M. LEFEVRE François, Inra-URFM, Avignon

Mme NEEMA Claire, Dpt SVS, AgroParisTech

M. PRAT Daniel, UMR5023, Université Lyon 1

M. SACHE Yvan, UMR Bioger-CPP, Inra AgroParisTech --

Sommaire

I. Curriculum vitae 3

II. Activités d'encadrement et de formation 5

III. Publications et travaux 7

3.1 Publications dans périodiques 7

3.2 Communications orales lors de rencontres internationales 12

3.3 Posters 16

3.4 Divers 17

3.5 Rapports de mission 18

IV. Synthèse des résultats scientifiques 21

4.1 Amélioration génétique et sélection en Côte d'Ivoire 22

4.1.1 Les variétés hybrides des générations 1975 et 1979 22

4.1.2 Le programme de sélection récurrente réciproque 23

4.1.3 L'utilisation des haploïdes doublés 24

4.2 Les cacaoyers spontanés de Guyane 28

4.2.1 Prospections et collecte 28

4.2.2 Sauvegarde 29

4.2.3 Caractérisation et évaluation 29

4.2.4 Diversité génétique et structuration 30

4.2.5 Utilisation dans les programmes d'amélioration 31

4.3 Conclusions 34

4.4 Références citées 34

V. Projet de recherches 38

5.1 Objectifs 38

5.2 Le projet et les résultats attendus 38

5.2.1 La problématique scientifique-Questions de recherche 38

5.2.2 L'état de l'art 39

5.2.3 Le contexte international 40

5.2.4 Les travaux envisagés 40

5.2.5 Les protocoles expérimentaux 41

A) Evaluation de la résistance aux Phytophthora 41

B) Evaluation de la résistance à Moniliophthora perniciosa 42

C) Evaluation de la résistance à Ceratocystis fimbriata 43

D) Caractérisation de la dureté des cortex 44

E) Tests à Montpellier (Cirad) 44

F) Prélèvement des endophytes 44

5.2.6 Le calendrier prévisionnel 47

5.3 Perspectives 47

5.4 Références citées 48

I. Curriculum vitae : Philippe LACHENAUD

Nationalité :

Date de naissance :

Française

02 septembre 1952

Adresse professionnelle :

Profession :

UPR Maîtrise des bioagresseurs des cultures pérennes TA-A31/02

34398 Montpellier Cedex 5, France

Téléphone : [phone]

Fax : [phone]

Adresse électronique : [e-mail]

Chercheur

Fonction :

Généticien cacao

Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement

Département BIOS

Compétences :

Cacao, ressources génétiques, sélection, phytotechnie

Ressources génétiques cacaoyères (clones, matériel spontané, descripteurs). Sélection cacaoyère (modalités, protocoles, dispositifs).

Phytotechnie et physiologie du cacaoyer.

Thèmes de recherche en cours :

- description et caractérisation du matériel spontané de Guyane,

- étude de la variabilité génétique du matériel spontané de Guyane. - élaboration du rendement.

Autres expertises : Régions d'expérience : Formation :

Facteurs de la Fructification et Remplissage des cabosses. Déficience en bore sur cacaoyer.

Brésil, Côte d'Ivoire, Equateur, Gabon, Guyane, Honduras, Saõ Tomé et Principe

Doctorat

Institut National Agronomique (INA-PG) / Paris / France (1991)

Diplôme d'Ingénieur Agronome de l'INA-PG INA-PG / Paris / France (1977)

Compétences linguistiques :

Expérience professionnelle :

Langue maternelle : Français

Langues de travail : Anglais, Espagnol Autre langue connue (lue) : Portugais

Depuis 2002 : Cirad-CP, puis Cirad-Bios Montpellier (France)

Généticien et expert cacao

Ressources génétiques cacaoyères

Sauvegarde et études de la collection de Guyane. Modélisation de l'élaboration du rendement (Cameroun)

Implications internationales

1997-2002 : CIRAD-CP

CNRA-Bingerville (Côte d'Ivoire)

Généticien Cacao et agronome expert cacao

Responsabilité du programme de Sélection Récurrente Réciproque + Essai clonal international au CNRA (projet CFC-IPGRI).

Télédétection des vergers café-cacao en Côte d'Ivoire (CIRAD-CP/BNETD-CCT).

1996-1997 : CIRAD-CP Montpellier (France)

Généticien et expert cacao

Caractérisation des cacaoyers spontanés de Guyane.

Expertise cacao-café en Côte d'Ivoire (télédétection des vergers).

1995-1996 : CIRAD-CP

Guayaquil et Pichilingue (INIAP, Equateur)

Généticien cacao (projet européen d'amélioration de la qualité du cacao équatorien)

Sélection cacao (résistances aux maladies et qualité).

1988-1995 : Institut de recherches sur le café et le cacao (IRCC) - puis CIRADCP

Kourou (Guyane)

Chef de mission IRCC, responsable des programmes cacao et café

Etude du matériel guyanais spontané (Prospections, sauvegarde, description, évaluation).

Gestion des collections cacao et café.

1981-1988 : IRCC Divo (Côte d'Ivoire) Généticien cacao

Ressources génétiques. Sélection cacaoyère. Phytotechnie cacaoyère.

1980-1981 : Ministère de l'agriculture, Service de la protection des végétaux Poitiers (France)

Ingénieur d'agronomie contractuel

Adjoint au responsable des avertissements agricoles.

1977-1979 : Institut Français du Café et du Cacao Divo, Zagné (Côte d'Ivoire)

Volontaire Service National Actif

Implantation des champs semenciers cacao de la SATMACI. Gestion de la Base de Multiplication et de Vulgarisation de Zagné.

Un des membres fondateurs et membre du comité de pilotage (Steering Commitee) du réseau CACAONET (« Global Cacao Genetic Resources Network »), représentant du Cirad.

Membre à deux reprises du comité international d'organisation des conférences internationales sur la recherche cacaoyère organisées par la COPAL (en 2006, Costa Rica et en 2009, Bali, Indonésie).