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Mise en place d'un suivi amphibien à  Vohibola, l'une des dernières forêts humides de la côte Est de Madagascar

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par Ewald JAUSSAUD
Université Joseph Fourier (Grenoble I )  - Master 2 pro biodiversité écologie environnement 2011
  

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2) Inventaire

La méthodologie d'inventaire des grenouilles dans la réserve de Vohibola se base sur le protocole standardisé proposé par Arnaud LeGoff (LeGoff, 2008) et validé par l'expert herpéthologue de Conservation International à Madagascar, Mr Nirhy Rabibisoa. Ce protocole préconise notamment la recherche des amphibiens par "chasse à vue", méthode la plus employée pour ce genre d'étude (Daly & al., 2008 ; Andreone & al ., 2000, 2006 ; Vallan et al ., 2000, 2002, 2004). La méthode des pitfalls (pièges à fosse) s'est quant à elle souvent avérée inefficace car elle ne permettait pas d'observer d'èspèces différentes de celles identifiées par chasse à vue (Andreone & al., 2000, 2006), et n'a donc pas été réalisée pour cette étude. Cette méthode avait d'ailleurs été expérimentée à Vohibola lors d'un inventaire en 2007, mais n'avait permis aucune capture (Deschamps, 2007).

La méthodologie de la présente étude reprend alors les principaux éléments du protocole standardisé, avec toutefois quelques modifications :

- Selon cette méthodologie, par exemple, il est demandé à l'expérimentateur de relever l'hygrométrie au moment de l'inventaire. Cependant, l'ONG ne disposant pas du matériel nécessaire, ce facteur n'a pu être mesuré.

- Le protocole préconise également de relever, lors de la session d'inventaire, un paramètre appelé "distance à l'eau". Ce paramètre correspond à la distance du point d'eau le plus proche à laquelle se trouve un individu observé. Techniquement, sur le terrain ce paramètre est extrêmement difficile à mesurer en raison de ce qui peut-être désigné comme "point d'eau". En effet, dans une forêt dense, un simple receuil d'eau dans une coquille vide d'escargot peut constituer un lieu de ponte pour certaines espèces. Il devient dès lors impossible de savoir à quelle distance une grenouille se situe du point d'eau le plus proche.

De ce fait, le paramètre "distance à l'eau" a été jugé non pertinent et n'a pas été pris en compte lors de cette étude.

- Le protocole standardisé n'envisage qu'une identification à vue (selon des caractéristiques morphologiques) alors qu'ici l'identification est réalisée à la fois de manière visuelle et acoustique.

- En ce qui concerne l'analyse des résultats, un indice de biodiversité supplémentaire (indice de Hill) a été calculé, en plus des indices recommandés (indices de Shannon et Simpson), afin d'affiner l'analyse de la diversité spécifique de chaque site d'échantillonnage.

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Période d'inventaire

Les inventaires se sont déroulés sur une période de trois mois, entre le 13 février et le 15 avril, à raison de trois sessions de quinze jours. Soit une première session du 13 au 27 février, une seconde entre le 16 et le 30 mars et une troisième et dernière session du 2 au 15 avril.

Méthode

Les inventaires de chaque site ont toujours été effectués en binôme, c'est-à-dire avec la participation d'un guide du village, employé de MATE. L'inventaire est réalisé par transect d'une heure (effort d'échantillonnage constant) avec fouille systématique des micro-habitats (litière, arbustes, flaques d'eau...). Un transect respectant une limite de temps est préféré à un transect soumis à une contrainte de taille afin de favoriser un même effort d'échantillonnage : 100m à travers une forêt dense ne représente pas le même effort de recherche que 100m dans une zone dégradée. Les transects sont réalisés sur chaque site de jour et de nuit. Tous les sites sont donc inventoriés six fois en tout : deux fois (jour et nuit) par session, sauf pour certains sites qui n'ont pas été trouvés lors de la première session et on donc été inventoriés quatre fois.

Le jour, les prospections ont lieu entre 5h30 et 7h00, au lever du soleil, afin de détecter les espèces diurnes avant que le soleil ne soit trop haut dans le ciel et donc qu'il ne fasse trop chaud (les grenouilles ayant tendance à se protéger du soleil en se réfugiant dans des troncs d'arbre ou sous les feuilles par exemple, elles deviennent alors difficiles à détecter). L'inventaire de nuit quant à lui se déroule après le coucher du soleil, entre 18h et 20h, ce qui permet d'observer et surtout d'entendre les espèces nocturnes.

Pour chaque site les paramètres suivants sont renseignés lors de l'inventaire (cf. Annexe IV) :

- Date et heure

- Météo et température

- Coordonnées GPS du transect

- Description du milieu

- Données de l'inventaire à proprement parler : espèce observée, nombre d'individus, stade et

sexe, mode de détection, mode d'identification et n° des photos.

Au début de la session d'échantillonnage, un thermomètre est placé au sol afin de déterminer la température. La température n'est alors relevée sur la fiche d'inventaire qu'après avoir renseigné les autres données (Météo, coordonnées GPS...), soit environ 5 mn. Les coordonnées géographiques sont acquises grâce à un GPS Garmin etrex modèle venture HC. Lorsque toutes ces données sont notées, le chronomètre est démarré et la prospection le long du transect débute.

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En pratique, dès qu'un individu est repéré, une ou plusieurs photos sont prises (afin de pouvoir identifier l'individu ultérieurement) puis, si possible, l'individu est temporairement capturé et placé dans le seau prévu à cet effet. L'identification se réalise alors quand le temps de recherche est écoulé afin de bien dissocier temps de recherche et d'identification et ainsi respecter un même effort d'échantillonnage entre les sites. Plusieurs critères contribueront alors à l'identification.

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