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Diversité des begomovirus infectant le gombo au Togo


par Ayékitan AKAKPO
Université Joseph Ki-Zerbo - Master 2 en Biotechnologie 2019
  

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Chapitre I : synthèse bibliographique

blots", "Leafimprint blots", "Tissue blots", "Transmission electronmicroscopy and immunolabeling" (Abouzid et al., 2002).

4.2. Tests moléculaires

Les techniques moléculaires de détection et d'identification des virus sont basées sur la réaction de polymérisation en chaîne (PCR). Des couples d'amorces spécifiques ou universelles ont été développés pour la détection respectivement de certaines espèces de Begomovirus ou de certains groupes de Begomovirus, notamment à partir d'informations sur la séquence des régions conservées de l'ADN-A (Wyatt et Brown, 1996; Atzmon et al., 1998; Brown et al., 2001). De nos jours, les comparaisons de séquences nucléotidiques et la phylogénie permettent de distinguer avec précision les espèces virales (Padidam et al., 1995; Brown, 1997; Fauquet et al., 2003). Ces comparaisons sont généralement basées sur la séquence de la région intergénique (IR) et celle du gène de la protéine de capside (CP) en l'absence de séquence complète de l'ADN-A (Brown, 1997; Brown et al., 2001). Mais pour une taxonomie définitive, la séquence complète de l'ADN-A est nécessaire. Le seuil de distinction taxonomique des Begomovirus actuellement admis par le comité international de taxonomie virale (CITV) est de 89% pour l'ADN-A (Fauquet et al., 2008 ; Brown et al., 2015).

5. Méthodes de lutte contre les Begomovirus

Les maladies virales des plantes occasionnent de pertes importantes à la fois sur le rendement et la qualité des produits agricoles. De nos jours, peu de méthodes de lutte sont disponibles dans le cas d'une infection virale et surtout, aucun traitement curatif ne peut être appliqué. Les principales mesures de lutte contre les Begomovirus visent surtout à réduire les sources de l'inoculum viral et la population du vecteur. Ces moyens de lutte sont essentiellement biologiques, chimiques, culturaux et physiques. La lutte peut être également génétique et basée sur l'utilisation de variétés résistantes ou tolérantes au virus et/ou au vecteur (Brown et Bird, 1992; Brown, 1994; Thresh et Otim-Nape, 1994; Pico et al., 1996; Polston et Anderson, 1997; Varma et Malathi, 2003).

5.1. Pratiques culturales, prophylaxie

Ce sont des pratiques qui consistent à empêcher ou réduire considérablement l'arrivée du virus sur les parcelles de production. Ils consistent donc à empêcher les introductions et les mouvements de plants infectés par le virus vers les zones encore indemnes (saines). Ces pratiques constituent une priorité dans la lutte contre les Begomovirus (Anderson

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