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Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.


par Aboubacar SYLLA
Université Felix HOUPHOUET- BOIGNY - Master 2 biotechnologies-biosécurité 2017
  

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1.2.Historique

L'histoire des phages a 100 ans. Aujourd'hui, il est admis que la découverte du bactériophage appartient conjointement à deux microbiologistes :

Frederick William Twort : bactériologiste anglais qui a la propriété de la description du principe lytique sur des colonies de Micrococcus, en 1915, il est donc indubitable qu'il avait fait une interprétation imprécise et, surtout, n'avait pas poursuivi ses recherches et encore moins envisagé une utilisation thérapeutique. Il n'est donc pas contestable que le mérite de la phagothérapie appartient à Félix d'Hérelle (D'Hérelle, 1926).

Félix d'Hérelle : biologiste canadien d'origine française, qui a présenté très tôt le rapport entre un phénomène observé au laboratoire et le phénomène de la guérison clinique en 1917. Pour lui, l'apparition de plages claires, observée dans les boîtes de Pétri sur lesquelles cultivaient les bactéries responsables de dysenterie bacillaire, semblait annoncer la guérison. En effet, dès 1918, d'Hérelle après avoir constaté que « la pathogénie et la pathologie de la dysenterie bacillaire sont dominées par deux facteurs agissant en sens contraire : le bacille dysentérique, agent pathogène et le microbe filtrant bactériophage, agent d'immunité », affirma que c'est « logique de proposer comme traitement de la dysenterie bacillaire l'administration, dès l'apparition des premiers symptômes, de cultures actives du microbe bactériophage » (D'Hérelle, 1919).

Par ailleurs, l'étude des phages a contribué à la naissance de la biologie moléculaire et fourni des indications fondamentales sur le mode de réplication et la morphogenèse des virus. Les phages ont également contribué à la compréhension de certaines épidémies et des maladies infectieuses. Ils sont par ailleurs responsables de fermentations défectueuses dans l'industrie laitière, et sont utilisés dans le

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Revue bibliographique

diagnostic (Singh et Arutyunov, 2012) et dans le biocontrôle. Actuellement, beaucoup de recherches sont orientées sur la génomique des phages, l'évolution, l'écologie et la découverte de nouveaux phages à des fins thérapeutiques.

A ce jour, plusieurs milliers (environ 6000) de phages ont été décrits mais on estime que seulement 10% d'entre eux ont été découverts (Ackermann, 2009).

La tête du bactériophage a généralement une structure icosaédrique qui est constituée par un noyau très compact d'acide nucléique, entouré d'un enduit protéinique ou capside. La capside est uniquement constituée de protéines dont l'ensemble forme une enveloppe qui protège le génome viral (ADN ou ARN, en simple ou en double brin) (Figure 1).

La capside est amorcée par un connecteur qui est un complexe multiprotéique situé à l'un des sommets de la capside, le connecteur est à la fois en interaction avec elle, mais aussi avec l'ADN et les éventuelles protéines internes ainsi qu'avec la queue du phage (Lurz et al, 2001). Le connecteur est l'élément central de la machinerie servant à l'incorporation de l'ADN viral dans la capside lors de la réplication des phages dans la bactérie. Et c'est aussi en passant par le connecteur puis la queue que l'ADN viral est injecté dans le cytoplasme de la bactérie (Ponchon et al, 2005) (Figure 1).

La queue est un complexe multiprotéique assemblé indépendamment de la capside et du connecteur. L'ancrage de la queue sur la capside au niveau du connecteur termine le cycle d'assemblage des bactériophages. La queue des phages est impliquée dans la reconnaissance et l'attachement aux bactéries hôtes, dans le transpercement des membranes bactériennes ainsi que dans le transfert de l'ADN viral de la capside dans le cytoplasme (Ackermann, 2003).

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Revue bibliographique

Figure 1 : Schéma illustrant la morphologie et les différentes protéines structurales (Effantin, 2005) :

(A) le phage T4 (Myoviridae, queue contractile), (B) le phage T7 (Podoviridae, queue courte) et (C) le phage SPP1 (Siphoviridae, queue non contractile), (D) Image prise en coloration négative du phage X (Siphoviridae, queue non contractile) illustrant les différentes parties le constituant notamment sa queue

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"Il faudrait pour le bonheur des états que les philosophes fussent roi ou que les rois fussent philosophes"   Platon